阿拉善廣宗寺活佛賈拉森是一位博學的高僧，他在綜合研究曆史典籍、當地傳說以及眾多物證後認為，六世達賴喇嘛在阿拉善定居後往來於蒙古和安多藏區之間，弘法利生，最後在阿拉善圓寂，是“鐵證如山”的事實——
……直到“文革”前，阿拉善南寺叫黃樓廟的大殿堂裏的鍍金塔內，（還）供奉著六世達賴喇嘛的肉身法體，透過塔門鑲嵌的紅玻璃，可隱約地看見倉央嘉措的麵孔。
按照倉央嘉措的遺願，在倉央嘉措生前選定的地點，修建了南寺。南寺始於清乾隆二十一年（1756年）破土動工，次年基本竣工，寺名潘代嘉措林（利樂海寺）。說南寺建於牛年，就是指的這一年，這和《倉央嘉措傳》成書是同一年。關於它成書的地點，在書末明記是潘代嘉措林，應該認為指的就是南寺。阿拉善昭化寺（俗稱朝克圖庫熱廟）在倉央嘉措生前已經建成，當時的寺名也叫潘代嘉措林。南寺建成後把原潘代嘉措林全盤搬到南寺，並襲用原寺名。後來乾隆帝於庚辰年（1760年）賜給南寺以廣宗寺的匾額，從此南寺才有了這個正式名稱。潘代嘉措林是《倉央嘉措傳》成書的地點，並不是倉央嘉措圓寂的地點。他圓寂的地點，是在今阿拉善左旗南部沙漠中的門吉林寺（承慶寺）附近。
相傳在阿旺多爾濟（《倉央嘉措傳》作者）的晚年，有人讒言阿旺多爾濟不滿旗劄薩克（紮薩克即蒙古語“執政官”之意）妨礙了宗教事務，坐關念誦旨在推翻王爺政權的黑經，想取而代之。此話激怒了當時的王爺羅卜桑道爾吉，羅王下令將他從南寺抓起來，囚禁在離旗衙門不太遠的格仍布愣荒地為他專門預備的死牢中。他年事已高，終因不堪忍饑受寒而圓寂在囚牢中，享年66虛歲，據推算，大約是1780年的事情。在他被囚期間，附近的一戶段姓人家照料他的飲食，至今還有老人們說某某是那戶人家的後裔。圓寂前他吟唱了那首叫《輪回》的歌。相傳歌詞為阿旺多爾濟所作。過去是不準隨便唱的。詞中教誡人們“慈悲虔誠，洪福基源。橫逆暴虐，罪孽必纏。人身難得，何敢狂歡”，“一生閑暇，忽略行善，死至陰曹，悔恨非淺”，等等。
倉央嘉措確認阿旺多爾濟為第司桑結嘉措（即第巴桑結嘉措）的轉世靈童以後，他和他的曆代轉世活佛們一直被認為是第司（即第巴，倉央嘉措時代西藏地方政府首席政務官）的化身，光緒年間清廷也為阿旺多爾濟的第五代轉世敕封“迭斯爾德（即第司）呼圖克圖”稱號。
過去，在阿拉善左旗南寺收藏著好多和倉央嘉措有關的曆史文物。保存它們的目的，當時也不是出於保護文物的考慮，而是把它們當作神物，讓信眾們頂禮膜拜之用。現在，除“文革”前由內蒙古佛教協會收集起來準備辦展覽的一部分物件幸免被毀，歸還南寺以外，其他的都在“文革”中被毀或丟失。下麵介紹的幾件物品，是在《倉央嘉措傳》中提到過的，供學者們研究時參考。
其一，《倉央嘉措傳》第二章中記載，倉央嘉措當初在更尕瑙爾出走時“腰間有一日增·戴達嶺巴所賜的古降魔橛”。本章中還有倉央嘉措降服兩具詐屍的一段，其中說“從腰間抽出降魔寶橛，打將下去……”，相傳就是這個寶橛的小寶橛，珍藏在南寺。目睹者說，上麵確有被堅硬的物體劃掉的痕跡，說是被詐屍的骨頭劃掉雲雲。寶橛是密宗師不可缺少的法器，南寺保存的寶橛很可能是倉央嘉措的遺物。
其二，本書多次提到的一個重要人物就是工布地區的羅甲，他是個俗人，伴隨倉央嘉措走了很多地方，關係密切。臨別時依依難舍，將自己的一把刀和火鐮包贈給了倉央嘉措。這把刀一直完好地保存在南寺。