學生在校期間由特殊體質而導致的疾病，由於個體差異、疾病情況不同而很難有統一的預防處理方法，一般根據家長提供的信息，按照學生的個體情況分別采取措施，做好有關預案，針對個別情況及時處理。而一些常見傳染性疾病，輕者危害患病學生本人的健康，重者危及其他學生，再說是有一定規律可循的，因此學校應該盡可能做好有關預防和處理。下麵簡單介紹一些常見疾病的預防和處理。
1．腸道傳染病
腸道傳染性疾病指各種病原體經口腔進入人體而後使人發病，並且能由糞便排出病原體的各種腸道疾病。主要包括：病毒性肝炎、脊髓灰質炎（小兒麻痹症）、痢疾、副傷寒、霍亂、副霍亂等。
腸道傳染性疾病的傳播途徑非常多，病原體可以通過水、食物以及手、蒼蠅、蟑螂等媒體進入人體。另外，病人和身上帶菌的人可以長期排出病原體。人群隻要有一個患病，很快就會傳染給其他人。有一所學校因一名學生患肝炎，當時沒有發現，很快造成班級中其他同學同時爆發流行。有些腸道傳染病也能夠通過其他途徑傳播，如乙型肝炎它能夠經未消毒的針頭或病人的血液傳播，脊髓灰質炎可以通過空氣中的飛沫傳播。
預防和處理腸道性傳染病，主要通過治理傳染源達到目的。學校應立即采取措施，隔離患病學生，通知家長將其帶回治療，及時在患病學生所在區域進行大麵積消毒，與病人接觸過的學生也要進行體檢或預防性服藥。平時在日常工作中，學校要搞好環境衛生、飲食衛生，保護水源，搞好廁所衛生，嚴格糞便和汙水處理，消滅老鼠、蒼蠅、蜘蛛和蚊子等有害動物。教育學生養成飯前便後勤洗手、不喝生水、瓜果要衝洗幹淨後吃，不吃變質的飯菜等衛生習慣，配合防疫部門做好預防接種工作。
2．呼吸道傳染病
呼吸道傳染疾病主要是通過空氣、飛沫、灰塵吸入人體後導致的病症。病人咳嗽、吐痰時可將病原體排出體外進入到空氣和灰塵中，再傳給他人。常見的呼吸道傳染性疾病有麻疹、水痘、百日咳等。其中流行性感冒發病率特別高，流腦的死亡率也最高。
呼吸道傳染疾病的傳染期主要是在發病期，病愈之後傳染性相對減少，因此必須做好早期的治療和預防工作。當然也有例外，如白喉、流腦、百日咳等病愈後還有可能傳給他人。呼吸道傳染病多在氣溫較低的冬春季發生，人們在室內活動時間相對增多，人群聚集可加速呼吸道傳染疾病的流行。另外，大氣寒冷，人體受涼後抵抗力容易下降，也是誘發病的一個因素。
如果發現學生有呼吸道傳染病，症狀較輕的可以繼續上課，但必須要注意做好隔離衛生工作，病情較重的必須回家休息治療或到醫院就醫。學校要教育學生不要隨地吐痰、擤鼻涕，咳嗽打噴涕時要有手帕捂住口鼻。教室最好每天開兩次窗戶通風透氣，每次10分鍾左右。發現有患病學生，最好用食醋熏蒸教室、宿舍，殺滅空氣中的病菌。預防接種也是預防呼吸道傳染病的有效途徑。有些傳染病如不進行預防接種，一生中早晚都要被傳染，如水痘、麻疹、百日咳、流行性腮腺炎等，學校應該宣傳傳染病的有關知識。