新的條約規定如下第一條戰爭雙方在簽約之日起停止一切戰爭行為，不得尋釁，不得以任何名義和理由挑起戰端，違約者將成為所有簽字方的共同敵人。
第二條承認荷蘭政府對台南的占領。
第三條葡萄牙在台北的港*由哈大全管理，葡萄牙人可以使用港口進行貿易。哈大全擁有在港口征調葡萄牙船隻，並招募葡萄牙士兵的權利。
第四條承認哈大全所有商會對朝鮮貿易的主導權，所有對朝貿易必須經過總兵府批準，私自從事對朝貿易將被視為走私，受到掠私船的攻擊，此類戰鬥不受到合約限製。
第五條承認李旦為新的琉球總督，代理荷蘭、英國、葡萄牙、僑民商會四方管理琉球事物。對路徑琉球的商船收取關稅，並同意向哈大全繳納六層的收益。
第六條荷蘭人準許僑民商會和麗水公司（哈大全的）的商船到香料群島當地采購香料、藥材、木材、翡翠原石等商品，並享受同等於荷蘭商人的價格優惠，但所有商品不得以任何理由和形式銷往滿荊加以西地區。
第七條條約從簽字之日起生效，有效期為十年。
在原本《澎湖條約》的基礎上，新的條約已經完全剝奪了葡萄牙人和英國人的特權，他們要在環中國海做生意可以，想要占地盤是絕對不可能的。
荷蘭人還存著一定的實力，哈大全不想趕盡殺絕，就先讓荷蘭人逍遙一陣子吧。
新條約被分成五分，由葡萄牙人負責把其中的三分帶走。安德拉德流著眼淚登上一艘葡萄牙商船，臨走時他還依依不舍的看著陸地，心中發誓一定要回來，一定要向哈大全討還血債。
為了防止洋鬼子的報複，哈大全命令安妮帶領南方艦隊返航。
“安妮，你一個英國人，在這次戰爭中，你的祖國沒有任何損失，他們的戰艦沒有一艘受傷。你回去後找人帶話給德雷克，隻要他們守規矩，安安心心的做生意，我絕對不會虧待他們。”
“是。主公。”安妮帶著南方艦隊返回馬尾。
許心素跟著安妮返回福建，他對福建沿海的地頭熟悉，哈大全讓他協助安妮防禦台南的荷蘭熱。
哈大全在台北留下了三千陸戰隊，有本地的中國人配合，他們足以守住台北地區。
哈大全則帶領北方艦隊，還有李旦的手下離開台北前往琉球。
這時琉球守軍不足五百人，因為主力部隊已經離開，剩下的人都躲在城堡內不敢出去，他們也怕本地人鬧事。
而琉球本地的反抗組織，已經開始準備大反攻了。
哈大全的艦隊在海上放了幾炮，琉球守軍就乖乖的投降了。
當看到大批的明軍登陸，並占領了侵略者的城堡，琉球人沸騰了。特別是琉球國王，他們以為大明朝的軍隊來援救他們了。琉球貴族組織了一個盛大的歡迎隊伍，當貴族們看到李旦下船的時候，都覺得有點不對勁。
當聽說領兵來的，是大明朝的靖邊侯哈大全時候，琉球的貴族們才放下心。
哈大全沒有下船，他看著岸上歡呼的人群對身邊熊寬說：“他們以為他們得救了，其實他們什麼都不會得到。”