學科建設是學校的基礎工作，學校是執行學科建設的一個主體。國家對學校的要求是一個總目標，希望浙大在下世紀辦成一流大學，為國家提供更多更高質量的建設人才，提供更高水平的科學研究成果，能成為長江三角洲地區高新企業的一個重要的支撐點。這是國家的總體要求。但是要實現這個總體要求，學科建設作為校內的基礎性建設，就要考慮怎麼來組織實施，這裏有學校的責任，有係的責任，有所的責任，有每個領導的責任，有每個教師的責任。我想是否可以分層次地來思考。
第一，規劃、評估、聘任。
客觀的規劃與評估看來主要責任在學校和係。全校的布局當然要校一級來抓。一級學科範圍內的布局主要應該由係學術委員會在係主任領導下，以係的高職稱人員為主體，廣泛征求各方麵意見來考慮。在執行過程中的質量、目標的實現，好壞與否的評估工作也應由學校和係來負責組織。因為係基本是按一級學科建立的，或者說絕大多數是按一級學科建係的，我們有條件這樣來做。做這項工作的當然不是光靠係主任一個人，光靠校長或者是副校長幾個人，主要還是要由校、係兩級領導機構，依靠專家，包括校內校外專家來進行規劃的研究、谘詢與評估工作，作出判斷，作出決策，作出聘任。
第二，學科建設的執行人、執行單位。
我認為學科建設的執行人、執行單位應該在二級學科，在研究所。係的範圍恐怕太大，要去執行某一個學科建設的話，係主任要管的麵太寬，是有難度的。執行單位應該是在所一級，學校實行的是研究所所長負責製，或者學術帶頭人負責製，有所務會議，所下麵可以有研究室，當然可以同時兼有教研室，也可以所下麵直接領導研究組。這就是學科建設的基層細胞。科學院裏麵有許多所，有的所有3000餘人，它實際上是一個行政管理單位，所長好像校長一樣，是個家長，什麼事情都要操心都要管。他沒辦法去執行業務領導，最多隻能執行學科規劃的工作，無法執行學科建設的工作。
學校裏過去是教研室，它是以教學為主要任務的一個組織機構。這當然是發揮過曆史作用的。但是現在學校要變成一個研究教學型的大學，既要做教學工作，又要做科學研究工作，而且進行高級人才的培養，更多地要依賴科學研究的進程來實施。研究生離開了科學研究，怎麼進行研究生的教育？所以，學科建設更重要的是要建立符合教育、科學研究內在規律性的組織機構。
要做到這一點，必須要給所長以職權，但對研究機構的設立，所長沒有權。所長毛遂自薦說我願來建個什麼所，這是不現實的。首先是上麵有個藍圖，要建設發展一個什麼樣的所，然後全世界招聘，招聘來以後，請你去做所長。你可以提出具體的方案來，或者在競選所長的時候，或者在應聘的時候，可以作報告，講自己的藍圖和規劃。這個規劃如果跟國家或者是跟學校總體規劃相一致，條件也適合，人家就聘任你，聘任以後給職給權。學校裏一般給的條件，一是給固定編製。給了固定編製以後請什麼人由你自己定，當然有的還附有規定，要符合條件。比如說你的秘書一定要符合秘書條件的人進來，隻不過人事部門審核和備案而已，一般是不駁回的，你有用人權。二是給空間，一開始就談好給多少房子。三是給啟動經費作為起步。諾貝爾獎獲得者到美國，他要價700萬美金，人家也滿足他了。我們這裏做不到，但總是要有一點。四是最重要的，所長有發展權。這些基本的東西給了以後，他要有發展，開展科研教育，培養研究生，也就是在國家的法律框架內，在學校總體條塊的框架內，他有自主發展權。如國家給5個編製，但他後來發展到100個了，其他的95個是他聘用的，聘用了以後，他來負責發工資，協調他們的關係來組織做課題。實際上是計算機分布式係統，或者是社會科學裏麵的分級管理體製。所以校長或科學院院長要操心的，實際上是管好下麵的係主任或所長。所長來考慮在學校規劃之下他本學科的發展。當然我這裏講的是人格化了。國外的確是自然人，作為所長，有的權力比較集中，但是也可以考慮不一定是一個人，也可以是幾個人的聯合，有一個群體，發揮集體的作用。我想這也未嚐不可。這要根據學科的實際情況來考慮。國外也有各種不同的模式，日本是講席製，德國是所長負責製，基本上是一個人。德國大的所也有幾個人在一起合夥的。馬普學會的研究所，是由幾個室主任共同領導的，成立一個所務會議。所長是放在所務會議之下的，所務會議集體討論決定，所長去執行，與黨委領導下的校長負責製有異曲同工之妙。
這兩年，學校有點發展，我總感覺到我們除了經濟杠杆以外，很重要的一條，是成立了以二級學科為主的研究所，雖然還是在萌芽之中，各研究所情況也不一樣，有的所是獨立實體，有的所是個“聯邦”，但畢竟有了90多個研究所了，所長至少有了發展權、空間權，也核定了一部分編製，現在又有了一點流動編製的用人權，所以發展會快一些。我覺得在這一個組織模式下麵，要逐步跟世界接軌，否則無論同國內的同類大學競爭也好，同國際的同行競爭也好，是不可能的。因為人家是有“師長”、“團長”，帶領著一支隊伍在那裏向自然界作戰，僅是靠“散兵遊勇”，這怎麼行？再有聰明才智，有時候冒一下是可能的，但要達到一流水平是不可能的。所以我希望浙大能在學科建設方麵思路更清楚一點，或者說在發展過程當中步子更堅定一點，措施更有力一點，能夠充分發揮所一級的領導作用，走出自己的道路來。而這個道路也是許多發達國家科學研究機構經過100多年走出來的道路，是符合客觀規律性的。當然不一定搞“一刀切”，可以允許各所之間的組織模式有所區別，有的所下麵可以有室，有的所下麵可直接是研究組；有的所可以所長比較穩定，也有的所可以實行所長輪流坐莊，比如搞一、二屆，然後換一換。但是學科建設要搞上去，光靠學校集中統一領導是不可能的，一定搞不好的。給你搞好一兩個有可能，你要搞好一片，這是不可能的，因為校長的知識是有限的，精力也是有限的。因此，真正的學科建設的執行者，它的力量所在是學科內部，是在學科帶頭人領導下的梯隊。