寒武紀生物大爆炸正是這一評價的極好例證。大約在53億年前，在短短的幾萬年內，幾乎現在所有生物的門同時出現在地球上。從海洋裏巨大的管狀蠕蟲，甲殼類到較為高級的脊索動物並存。如果進化像達爾文所說的由點滴的、漸進的方式進行，那麼數百萬年的時間無論如何也不足以完成這一曆程。雖然寒武紀之前的多細胞生物化石也有發現，但按進化論的觀點，它們與寒武紀生物並無承傳關係。現代達爾文主義者也無法解釋，稱之為“迷中之迷”，事實上寒武紀生物大爆炸是進化論不可逾越的障礙。
寒武紀生物霸主——三葉蟲
3.人類的起源
《物種起源》發表的時候，達爾文曾說：“隻有人類的進化，怎麼都不可能用我的進化論來說明。”
人類進化示意圖人類進化如果單從進化論觀點來看，似乎顯得太快了。以人為例，進化論者認為，人類誕生的曆程為：南方古猿—原人—舊人—新人—現代人類。在這一過程中，人腦容量增長極為迅速。而現代人類產生後，進化又仿佛突然不起作用了，五千年來人的腦容量基本沒有變化。再看腦細胞數量，現代類人猿為10億個，而現代人類約為140億個。單從數字上看是增大了14倍，但智力水平卻發生著跳躍性的變化，這些證據強烈地暗示：這個進化樹是不正確的。這些物種也許根本沒有任何親緣關係，而進化論者隻是按時間順序把它們拚湊在一起而已。
另外，20 世紀 60 年代以來，肯尼亞的峽穀和湖附近地區的考古也發現一些不利於進化論的佐證。1972年出土了一具類人動物的頭骨化石，編號為KNM—ER—1470，簡稱1470號人。按其分類特征，它類似於現代人，屬於人屬，比南方古猿和直立猿人要進步得多，但它卻處於290萬年前。1470號人比進化論者所公認的人類始祖南方古猿早90萬年，比直立猿人早200 萬年。這從根本上動搖了進化論的證據，成為古人類學中的一件懸案，至今沒有一個進化論者能夠歸屬1470號人在進化樹中的位置。
從胚胎學方麵來講，它與比較解剖學類似，從生物發育過程中形態的變化，推論出高等動物的胚胎在發育中重現其進化曆程。如人類胎兒在發育之初與豬和鼠的胎兒都具有鰓裂和尾，形態也很相似，其實，這隻是表麵現象。首先，人類胎兒的“鰓裂”事實上不是鰓裂，而是快速發育的皮膚的褶皺；其次，人類胎兒的尾狀結構也絕不是尾，而是神經管。在蛙胎發育過程中的尾狀結構亦是神經管。再次，形態這一表象是由基因決定的。較為普遍接受的基因調控理論認為，動物形態雖然豐富多彩，但在分子水平上的調控都是一致的，因此，動物胚胎發育之初形態相似，是由於基因調控水平相同而已。這是近年來發育生物學最為重大的發現之一。也就是說，從形態相似仍不能得出本質相似的結論。不可回避的化學進化
化學進化是指生命產生前在分子水平上的進化。如果要完整的理解進化論，不僅要回答生命產生後的生物進化過程，而且還要解決生命物質是如何產生的問題。即怎樣由簡單、無機的小分子進化到複雜、有機的大分子，進而產生生命體。但這個問題被進化論者們故意地回避了。
一位教授曾對數種有關進化分子生物學的學術期刊近十年來所發表的上千篇文章進行研究，表明都沒有涉及這些。化學進化是無法用進化論來解釋的。流行的觀點認為，原始地球擁有還原性大氣，含有氮，氫，硫化氫等成分，不含或含少量的氧。大氣放電經常發生，原始海洋中水溫較高，並有頻繁的地質活動，如地震，火山噴發等。基於這種觀點，1951年米勒進行了著名的“原始湯”實驗，他在一個燒瓶中模仿原始地球的環境，用氣體放電模擬雷電。實驗結束後，在產物中分離到了氨基酸，這個結果轟動了科學界。但更多的問題暴露後，樂觀主義漸漸消失了。我們僅舉兩例，說明他們的困境。
一是化學選擇性，所有生物大分子結構都表現為空間上的有序，蛋白質分子除了特定氨基酸的連接外，還能形成 Alpha—螺旋、Beta—折疊等二級結構、結構域等三級結構、直至形成四級結構——亞基。雙鏈DNA分子由兩條單鏈組成，除單個核甘酸的連接與氫鍵作用外，還能形成雙螺旋和超螺旋（A—DNA；B—DNA；Z—DNA等），所有這些結構都與該大分子的功能緊密相連。一旦這些結構遭到破壞，該大分子就會失活，所以生物體在合成生物大分子時表現出極高的精確性。