“911事件”似乎也讓以色列人放開了手腳。借助反恐的名義，在美國的默許下，以色列於2002年1月出動了地麵部隊和飛機、導彈，襲擊了巴勒斯坦自治政府所在地的約旦河西岸以及不時向以色列境內施放火箭彈的哈馬斯等激進組織所盤踞的加沙地帶。沙龍還宣布阿拉法特自治政府為恐怖主義組織，從3月開始，以軍就圍困了巴勒斯坦自治政府總部和阿拉法特的拉馬拉官邸，斷水斷電，揚言要解散巴勒斯坦自治，驅逐阿拉法特。但以色列也為自己的行動付出了巨大的代價，就在以軍攻打約旦河西岸的傑寧難民營時，有十七名以軍士兵被打死。占領難民營之後，以軍對難民營進行了徹底清剿，不過，由於以軍封鎖了難民營，具體的傷亡情況不詳。據聯合國事後調查，在以軍從3月到5月兩個多月的行動中，約有近五百名巴勒斯坦人死亡，以軍也有三十人喪生。
但以色列的軍事打擊不僅沒有鏟除巴勒斯坦人的反抗，反而引發更加激烈的恐怖襲擊。就在2002年這一年，猶太人幾乎找不到一處安全的地方，影院、咖啡廳、街道，甚至大學裏隨時會響起爆炸聲，據統計，這一年死於恐怖襲擊的以色列人高達四百人！
事實上，哈馬斯等派別的很多行動，已經超出了阿拉法特的控製範圍。歲月不饒人，這位老人麵對紛亂的巴勒斯坦局勢，已經心有餘而力不足。
以色列憑借遠強於對手的武器裝備，對巴勒斯坦抵抗組織大打出手，從場麵上看是明顯占據了上風。不過，麵對複雜的亂局和憤怒的巴勒斯坦人，美國總統布什知道必須在阿拉伯人和以色列人之間尋求一種平衡，否則，以色列僅僅憑借武力是難以打出中東和平的，於是，中東和平“路線圖”於2003年4月由美國正式對外拋出。為了推動這個“路線圖”的實施，布什甚至不惜飛赴中東，親自與阿拉伯各國和以色列的諸位大佬協商，推銷美國的中東計劃。
但冰凍三尺非一日之寒，多年的血仇也難以憑借一個模棱兩可的“路線圖”徹底解決，雖然“路線圖”得到了巴以政府的謹慎歡迎，將巴以關係向前推進了一小步，但很快就在雙方重燃的激烈衝突中擱淺，空留布什的一聲歎息。
沙龍也知道僅僅憑借武力最終是無法解開中東迷局的。與他的多位前任一樣，在揮舞大棒的同時，他也在苦苦尋求化解阿以關係的途徑。眼見“路線圖”計劃擱淺，他搖身一變，於2003年11月提出了單邊“脫離計劃”，也就是說通過以色列主動撤離加沙地帶和約旦河西岸的猶太人定居點，來實現猶太人與巴勒斯坦人脫離接觸。這實際上也就是以色列所謂的“以土地換和平”。
2004年10月，被以色列圍困在拉馬拉官邸長達兩年半的阿拉法特病危，不得不轉往法國醫治，一個多月之後，病逝巴黎。
由於被圍困後，阿拉法特的食物都是通過以色列人提供的，所以當時就有人猜測是以色列人讓阿拉法特慢性中毒而死的。八年之後，巴勒斯坦向世界宣布，阿拉法特的確死於中毒。為查明死因，在征得阿拉法特遺孀的同意之後，決定開棺驗屍，這些都是後話。
這位一生戎馬，睡覺都槍不離身的鬥士，為了巴勒斯坦人的建國夢想貢獻了自己的終生，至死也沒能了卻立國的心願，他撇下的除了他那尚還年輕的妻子和不滿十歲的女兒外，還有岌岌可危的巴勒斯坦亂局。
阿拉法特死後，巴勒斯坦人於2005年1月舉行了大選，長期追隨阿拉法特左右的阿巴斯成為巴民族權力機構主席。相比阿拉法特，阿巴斯對外政策更加溫和，所以，以色列也對阿勒斯坦新的掌舵人釋放出了善意，就在阿巴斯宣誓就職之後不到一個月，巴以就在埃及的斡旋下達成了結束長達四年之久的暴力衝突的協議，從而向實現巴以和平邁出了可喜的一步。