柱花草在栽培種植過程中易遭受各種蟲害，據報道，在哥倫比亞柱花草害蟲主要有葉蟬科（Cicadellidae）、椿象科（Pentatomidae）、網椿科（Tingidae）等刺吸式害蟲，在泰國柱花草栽培草地還有沫蟬科（Cercopidae）害蟲危害葉片和嫩莖葉。在哥倫比亞頭狀柱花草受危害程度最為嚴重。此外，葉甲科（Chtysomelidae）的咀嚼式害蟲也常發生危害，在泰國葉甲科和象甲科（Bruchidae）危害頭狀柱花草，在哥倫比亞葉甲科害蟲危害頭狀柱花草5個栽培品係葉片和嫩莖葉，平均每月幹草產量損失達2.8%。
柱花草在巴西和哥倫比亞還常遭受鱗翅目細蛾科（Gracilariidae）害蟲鑽心蟲（Caloptilia sp.）的危害，在澳大利亞受鞘翅目天牛科（Cerambycidae）害蟲Patyomopsispe dicornis（Fabricius）的危害。在1978~1980年，CIAT調查了哥倫比亞柱花草蟲害，最主要的是鑽心蟲和天牛科昆蟲危害柱花草，二者為南美洲最主要的蟲害。鑽心蟲幼蟲主要從柱花草基部莖稈開始危害，主要危害圭亞那柱花草和糙柱花草等敏感品種，常在莖基部鑽孔引起長勢減弱，2年後可導致整株死亡。田間篩查鑒定抗蟲頭狀柱花草和圭亞那柱花草的研究表明，柱花草抗蟲機理存在結構效應，敏感品種的厚壁組織層相對較薄，而厚壁組織相對較厚的柱花草相對抗蟲。天牛科害蟲Patyomopsis pedicornis（Fabricius）幼蟲主要從主根和莖部主莖危害，最終造成整株死亡。天牛科害蟲危害澳大利亞西卡糙柱花草草地，幼蟲鑽空根係上部和主莖基部引起0.3hm2西卡糙柱花草的植株全部死亡。鞘翅目天牛科害蟲Prosoplus torosa也危害澳大利亞西卡糙柱花草草地。
蚜蟲（Budworm）嚴重影響柱花草的種子產量，在南美洲花生紅頸麥蛾［Stegasta bosqueella（Chambers）］主要危害柱花草的莢果，使圭亞那柱花草種子嚴重減產，而且對晚花品種的危害更嚴重。具有高產種子潛力的圭亞那柱花草受蚜蟲危害程度高於頭狀柱花草、大頭柱花草。在南美洲圭亞那柱花草還受木虱（Psyllids）、白蟻（Termites）和花生蝕葉野螟（Hedylepta diemenalis）幼蟲的危害，在哥倫比亞蝕葉野螟幼蟲引起頭狀柱花草和圭亞那柱花草小葉病，在澳大利亞毛毛蟲（Caterpillars）影響柱花草的花和花序，引起種子減產。
在我國柱花草推廣早期，柱花草受葉蟬（Cicadellidae）的危害，並可傳播一種類菌質體（MLO），導致柱花草叢枝病。
同時柱花草開花期易遭受黏蟲［Mythimna separate（Walker）L.］、斜紋夜蛾［Prodenia litura（Fabricius）］和中華管薊馬（Haplothrips chinensis Priesner）的危害，一般危害柱花草花器、嫩枝和嫩葉，嚴重影響柱花草種子產量。在幹旱季節，柱花草葉片及幼嫩組織易受葉蟎（Tetranychus spp.）危害，嚴重時會造成葉片褪綠、發黃、皺縮、卷曲及落葉，甚至整株萎蔫死亡。另外，還發現柱花草也受一些害蟲零星危害，如東亞飛蝗［Locusta migratoria manilensis （Meyen）］、斑角蔗蝗［Hieroglyphus annulicornis （Shiraki）］、中華蚱蜢［Acridachinensis （Westwood）］、橙毒蛾（珀色毒蛾，Aroasub strigosa Walker）等。同時，在柱花草播種季節要注意防止幼苗出土前螞蟻的危害。