1942年春，李士群正在蘇州忙於籌備汪精衛“出巡”清鄉地區事宜，吳四寶忽為上海日本憲兵隊逮捕，報上也登載“國府”通緝令，通緝吳四寶，說是“破壞和運”。李士群得訊，慌忙奔走營救，費盡口舌，好不容易把吳保釋出來，但日本憲兵隊指明要李士群帶回蘇州管教，不能讓吳再在上海，李當然答應。臨行時，日本憲兵隊負責人對吳說：“李先生保你出去了，你吃點東西走吧。”當即給吳吃了一碗麵。次日，李士群把吳四寶帶往蘇州，這時吳覺得肚子疼痛，不時腹瀉，吳身體素稱結實，不疑有他，到了蘇州還去玄妙觀燒香謝神，不料第二天即暴斃。
李士群對於吳四寶之死，不免感到兔死狐悲，從此對日方宴會存有戒心。豈知一年以後，李也同樣死於日憲之手，從中毒到死亡，前後也是三天，和吳四寶之死如出一轍。
8.自作孽，不可恕
1941年7月1日，江蘇省的吳縣、昆山、太倉、常熟四縣開始“清鄉”，偽清鄉委員會成立駐蘇辦事處，李士群以清鄉委員會秘書長名義兼任處長。後來汪偽政權在江蘇淪陷區，分四個階段“清鄉”（吳縣、昆山、太倉、常熟、無錫、江陰、武進七縣為第一階段，太湖東南一帶為第二階段，鎮江、丹陽、揚州為第三階段，蘇北南通、如皋、海門、啟東為第四階段），李士群是實際的主持者。
1942年1月1日偽江蘇省政府改組，原主席高冠吾調往安徽，李士群繼任省主席（1943年改稱省長），同時，清鄉機構結束，由偽省政府接管，號稱“清鄉省政一體化”。此時李士群一身掌握省政、清鄉和汪偽統治區特工大權，又兼調查統計部部長和警政部長，鋒芒畢露，氣概不可一世。
1943年9月7日，李士群從上海乘早車回蘇州，偽省府各廳處局長照例到站迎接，當時李的精神萎頓，沉默無言，出站後即乘保險汽車駛回護龍街822號住所。當天下午傳來消息，說省長身體不適，大家認為或係路途辛苦所致，不足為奇。第二天，又傳出消息說，他身體很不好，家屬焦急，已向上海聘請名醫來蘇治療。當天上海來了幾位醫師，都診斷不出什麼病症，注射了許多針藥，仍無療效。其症像是周身大量出汗，幹毛巾都來不及更替使用，並不時腹瀉。
第二天早晨，李士群病危消息傳至日本駐蘇州部隊，即由小林師團派了三位高級軍醫前來診斷，很快便斷定說：“李省長是中毒，瞳孔已經放大，關節失靈，已無法挽救。”又說：“在我們本國，這種中毒的人也時有發現。凡是已發現中毒現象的人，首先要化驗血液，要經過24小時的細菌培養，才能得出中毒的結論。但等到結論出來，病人都已無法救治，所以這樣中毒的人是百死無一救的。”延至第三天下午，李氣絕斃命，時年39歲。
李士群死後，偽省政府成立治喪委員會，料理身後事宜，並急電汪精衛報喪。第四天，南京派偽行政院秘書長陳春圃來蘇，代表汪精衛致祭，並參加入殮儀式。
過了幾天，日本憲兵隊忽然要根究李士群中毒消息的來源，並向李公館辦事人員和葉吉卿氣勢洶洶地追根問底，威脅葉吉卿說：“不可再說李先生是中毒，該說是病死的。”從此大家再也不敢提起“中毒”兩字。據說先前日本駐蘇部隊和憲兵隊並不知道其中的底細，俟後接到上級指示，搞清楚內幕，才有徹查中毒消息之舉，否則小林師團派去的高級軍醫也決不會說李的病源是中毒了。
在停靈期間，不知是誰發起，通知偽調查統計部所屬高級人員到李公館集會，到會的有偽調統部次長後升部長的楊傑、次長夏仲明，上海政治保衛局局長萬裏浪，以及馬嘯天、葉耀先、胡均鶴、晉輝、唐克明等數十人。
接任偽江蘇省長的是陳群。同一時期，偽淮海省省長郝鵬去職，由郝鵬舉繼任。當時社會上盛傳著一副對聯：上聯是“陳群、李士群，去了一群，又來一群”；下聯是“郝鵬，郝鵬舉，你幹此舉，我幹那舉”。這副對聯，對賣國求榮、殘害人民的民族敗類，表達了高度的憤懣和蔑視。