草木堂的堂主，不是別人，正是雲山。雲山自從菲菲死後，便一言不發，除了采藥、配藥就是麵壁靜坐，一坐就是六年，他原本是精英堂的堂主，其無論是修為還是德行，在雁行門中都算是出類拔萃。但任務的失敗與愛人的離去，讓他心灰意賴，甚至可以說是萬念俱灰，成天如同行屍走肉一般，掌門無奈，便把他的精英堂堂主一職另挑人選擔任，並與之擔任草木堂堂主一職。
自從雲山任務失敗回歸山門後，隻給雲飛另外取了一個名字後，便再也沒有過問，至於現在他長成什麼樣子，也是不知道的。
堂主之下有三個隊領，每個隊領下又分三個列隊，每個列隊又可分為七個小隊，每個小隊由十人組成。而這一屆進入草木堂的新人並不是很多，隻是剛好湊齊了兩個列隊的人數，這兩個新人列隊與演武堂淘汰下來的另一個列隊的人一起組成一支新的領隊。
在大門大派中都有一些激勵與懲罰的製度，從而刺激門下弟子急流勇進，讓他們懂得不進則退的道理，因此大多都采取了末位淘汰製。雁行門主要分為三個堂口與六個大班，堂口分為：精英堂、演武堂與草木堂，精英堂主要任務就是技藝修行，並賦予秘密任務，完成高難度的委托，是整個門派的中流砥柱，也是主要的經濟創收的地方，而演武堂主要的任務則是整個門派的安保工作，分斥候、密探、警衛與勇士，除了安保，偶爾也參與一些重要任務，從而築造起門派的銅牆鐵壁。相比之下草木堂就成了類似野戰醫院的角色，培養屬於本門派的醫師，配置療傷與輔助型藥膏，負責整個門派傷病的處理與安置，但由於雁行門長久一來都沒有出現過“宗”級以上的醫師，故而其受到的重視程度也就日益衰弱。至於其他六大班，都是由堂口淘汰下去的與天賦不高的人組成，主要負責整個門派的衣食住行與商鋪經營等，為整個門派提供後勤給養。
負責新人的隊領的領長叫馬明，高高瘦瘦的個子，顴骨有點高，眼睛卻有點凹陷，單薄的嘴唇，讓人覺得有點像骷髏頭，也因此被其他的領長叫了這個外號。他是草木堂的老人了，從一個采集弟子熬成了領長，雖然沒有太大的本事，但卻紮實肯幹，對待自己的屬下也很友好，頗有長者風範，他鑽研的是陽係功法，配合的是陽性精神淬煉，一手調配製藥的手藝，在門派中是頗受歡迎與好評的。
把新人都安排妥當後，便把他們召集在大堂門前的那塊空地上訓話，三聲五令的要求新人遵守草木堂的規矩，從堂規到日常事務的注意事項，他都詳細的描述了一遍，對於他這種老人來說，這種工作已經是再熟悉不過的了。最後，他作為過來人也作為一位長者，語重心長的和新人們說：“該說的我也都說了，下麵的事情就需要你們自己去考慮了，草木堂的書庫你們可以多多參閱，每個人都要想好自己想學的技藝功法，我現在簡單說下五行技藝與陰陽功法的特點，你們都用心記一下。所謂金木水火土，五行相生相克，各有其優劣，金係剛猛迅捷，卻過硬而易折；木係生生不息，卻無法抵禦尖利；水係連綿不絕，卻沒有特別的殺手鐧，火係爆裂勢大，卻不能持久；土係則堅強頑固，卻行動遲緩。然而對於行醫修行的人而言，五行都是有用的，金係能夠切割皮肉，剜肉祛瘡，是外科傷科不可或缺的，對采集特殊藥草有特殊效果；木係能夠療養內傷，加速外傷愈合，是行醫中最全能的一係；水係可減緩病患痛楚，降低病情惡化的可能，對熬製元力湯藥也有提升作用；火係能夠加速止血，特別適合煉製藥物；土係可對骨傷筋絡損傷治療有特殊療效，對采集與培育高級靈草也有提升作用。另外，功法分陰陽，陰則暗，陽則明，暗則隱，明則顯，隱則韜光養晦，顯則磊落光明，陰係功法，表麵限製法功的力度，但使之更綿長持久，更不易被發現或受到打擊，而陽係功法，表滿更加剛猛迅捷，講究的是一招製敵，但卻消耗極大，不能長久。五行生氣，陰陽淬神，相互配合，成就萬千修行道路，你們每一個人作為草木堂一員，肩係整個門派的生命安危，一定要努力修行。”