這信傳到清廷，康熙帝本已遣靖逆將軍富寧安，率兵駐紮巴裏坤，防備西域，至是急命傅爾丹為振武將軍，祁裏德為協理將軍，出阿爾泰山，會合富寧安軍，嚴備準噶爾入寇。另遣西安將軍額魯特，督兵入藏，侍衛色棱為後應。康熙五十七年，兩軍次第渡木魯烏蘇河，分道深入。大策零分軍迎戰，隻數合便退。明是誘敵。額魯特率兵追入，色棱繼進，到喀喇烏蘇河岸，大策零留有伏兵，頓時四起，截住清兵。額魯特等料知陷入重地，率兵猛撲，怎奈這番敵軍，純是精銳，與前時接仗，大不相同。額魯特不能前進，隻得退後，不料後麵流星馬又到，報稱準兵繞出後路，把軍餉截奪去了。清兵聞軍餉被劫，不戰自亂，額魯特、色棱兩人，極力彈壓，勉強鎮定。過了數日，糧盡矢窮，準兵四麵聚集，好似天羅地網一般，一陣攻擊，清兵全營覆沒，都做了沙場之鬼。雖是戰死，幸而死在西方，免得童男童女接引。
康熙帝接了敗報，再命皇十四子允禵為撫遠大將軍，駐節西寧，升任四川總督年羹堯，備兵成都，擬分道進發。敕封噶爾藏堅錯為達賴六世，檄蒙古兵扈從達賴，隨大軍直入西藏。於是蒙古各汗王貝勒，各率部兵至青海，恭候清兵出塞。康熙五十九年春，詔移允禵移駐木魯烏蘇河治餉，令將西寧軍副都統延信出青海，年羹堯仍坐鎮四川，令將川軍副護軍統領噶爾弼出打箭爐，分趨藏境。大策零聞清兵分出，自拒青海軍，另遣部兵三千餘人，抵擋噶爾弼。噶爾弼副將嶽鍾琪，素有膽略，領親兵六百名，首先開路，至三巴橋，係入藏第一險要。嶽鍾琪招募番眾，許他重賞，令詐降守橋兵，裏應外合，竟把三巴橋占住。噶爾弼率軍來會，忽聞準部兵來奪三巴橋，頭目叫作黑喇瑪，有萬夫不擋之勇，噶爾弼頗驚慌起來。嶽鍾琪道：“有鍾琪在，就使來了紅喇瑪，也不怕他，待明日擒他便是。”是夕，嶽鍾琪率兵出營，潛掘陷坑，上用青草蓋住，令兵士帶了鉤索，伏在陷坑裏麵。部署已定，然後回營。次晨，黑喇瑪仗著勇力，飛奔前來，嶽鍾琪出兵對敵，誘黑喇瑪至陷坑旁。黑喇瑪有勇無謀，但知上前追殺，不料腳下有坑，一腳踏空，墜入坑內，任你黑喇瑪膂力過人，至此被伏兵鉤住，急切不能展身。伏兵緊緊捆縛，扛入清寨。黑喇瑪受擒，餘眾不戰自降，方擬鼓行入藏，忽來了大將軍檄文，令待青海軍並進。噶爾弼躊躇未決，嶽鍾琪道：“我兵隻齎兩月糧餉，從川西到此，已過了四十多日，若再待青海軍，糧餉食盡，如何入藏？現不如乘機疾進，沿途招撫番眾，用番攻番，約十日可抵拉薩，出其不意，容易蕩平。”噶爾弼欲集眾議決，鍾琪道：“勢在必行，何須多議！鍾琪不才，願噴此一腔熱血，仰報朝廷，請於明晨即行。”鍾琪係嶽武穆王二十一世孫，武穆仇金，鍾琪忠清，似不能善繩祖武，惟為清攻藏，恰有可原。噶爾弼也不多言。
次晨，嶽鍾琪即用皮船渡河，直趨西藏。途中遇土司公布，用好言撫慰。公布很為感激，遂代為招集番兵七千，引鍾琪入拉薩。鍾琪觀番兵可恃，遂分部兵三千名，繞截大策零餉道，自領番眾趨拉薩城。拉薩城內，隻有幾個準兵，見嶽軍大至，盡行逃散。鍾琪長驅入城，號召大小第巴，宣示威德，除助逆喇嘛的，殺了五人，並幽禁九十多人，其餘一概赦免，那時僧俗都頂禮膜拜，感謝再生。
這時候，青海軍統領延信，正與大策零相持，連敗大策零數陣。策零欲退回拉薩，又被嶽軍截住，進退兩難，遂爬山過嶺，遁回伊犁。途中崎嶇凍餒，死了大半。延信遂送新達賴入藏登座，令拉藏汗舊臣康濟鼐，掌前藏政務，頗羅鼐掌後藏政務，留蒙古兵二千駐守，奉詔班師，各回原地鎮守，西藏暫歸平靖。康熙帝又要咬文嚼字，親製一篇平定西藏碑文，命勒石大昭寺中，小子也不暇細錄。
隻是康熙帝安樂一次，總有一次憂愁，相逼而來。憂樂相循，禍福相倚，是顛撲不破的事理。入藏軍已報凱旋，台灣忽報大亂。說來可笑，台灣亂首，乃是一個販鴨營生的小百姓，名叫一貴，他的姓恰與大明太祖皇帝相同。嚐見人家婚喪事，排列儀仗，每借同姓的頭銜，書入頭行牌，以示烜赫。一貴雖是販鴨，然與明祖同姓，亦自足誇。自施琅收服台灣後，台民雖稍有蠢動，事發即平。至康熙晚年，用了一個貪淫暴虐的王珍授台灣知府，沒有稅的要加稅，沒有糧的要征糧。百姓不服，就要拿來打屁股，或枷號幾個月。還有一切訴訟事件，有錢即贏，無錢即輸，因此台民怨憤異常。官逼民反。這個朱一貴，雖是販鴨為生，他卻有幾個酒肉朋友，一叫黃殿，一叫李勇，一叫吳外，這三人素不安分，與朱一貴恰很是莫逆。一日，到了酒樓，一麵吃酒，一麵談論平日事情，黃殿問一貴道：“近日朱大哥生意可好？”一貴搖頭道：“不好不好！現在這個混帳知府，棺材裏伸手，死要銅錢，連我販賣幾隻鴨，也要加捐。我此番販鴨一千隻，反蝕了好幾千本錢，看來隻好罷休哩。”小本經營，不應加重捐，觀此便知。李勇、吳外齊聲道：“這般狗官，總要殺掉他方好。”該殺！一貴道：“隻有我等幾個小百姓，那裏能殺知府？”黃殿道：“要殺這個混帳知府，也是不難，隻此處非講事堂，兄弟們不要多嘴。”黃殿乖。言畢，以目示意。大家飲完了酒，由一貴付了酒鈔，遂同至一貴家內，彼此坐定，黃殿道：“朱大哥你道是販鴨好，還是做皇帝好？”一貴醉醺醺的笑道：“黃二弟真吃醉了，販鴨的人，怎麼好同皇帝去比？”黃殿道：“朱大哥想做皇帝否？”一貴大笑道：“像我等人，隻能販鴨，那裏會做皇帝？”黃殿道：“明太祖朱元璋曾充廟祝，後來一統江山，好端端的做了皇帝。大哥也是姓朱，販鴨雖賤，比廟祝要略勝三分，水無鬥量，人無貌相，要做皇帝，何難之有？”一貴聽了此言，不覺手舞足蹈起來，便道：“我就做皇帝，黃二弟等須要幫助我。”黃殿道：“總教大哥不要驚慌，明日就請大哥南麵為王。”一貫乘著醉意，便道：“我果有一日為王，就使千刀萬剮，亦是甘心。”賭什麼氣？罰什麼咒？天道昭彰，不容妄說。黃殿道：“一言為定，不要圖賴。”一貴道：“自然不賴。”黃殿便邀同李勇、吳外，告別而去。