華盛頓剛剛把信寄出去不久，大陸會議就給他寄來了一封公函，經過大陸會議討論決定，蓋茨將軍被任命為加拿大美軍總指揮。比起蘇利文將軍，東部的議員們似乎更欣賞蓋茨，這主要是因為在圍攻波士頓的戰役中，蓋茨和新英格蘭人民建立起了良好的關係。6月22日，蓋茨正式啟程趕往加拿大。無奈之下，華盛頓隻好放棄了自己的想法，並希望蓋茨能夠力挽狂瀾。
蘇利文將軍從前線發來了最新的戰報，敵軍在加拿大的兵力已經增至1.3萬人，主要包括一支愛爾蘭軍隊、一支英格蘭軍隊以及豪將軍的部隊。其中大部分的軍隊已經在卡爾頓、菲利普以及裏德塞爾將軍的帶領下分陸路和水路分別從魁北克出發，另外一支大部隊已經在弗雷澤將軍的率領下抵達了三河城，剩餘的一支部隊在奈斯比將軍的率領下負責後勤物資的運輸。蘇利文將軍在6月8日寫給華盛頓的信中表達了對湯普森將軍在三河城順利擊敗敵軍的期望。湯普森將軍按照原定的計劃率領部隊連夜向三河城進軍，天亮的時候，他們朝敵軍開了炮。雙方的鬥爭持續了一整天，美軍始終處在有利的形勢之下。後來，湯普森將軍命令部隊駐紮在聖·皮埃爾河的右邊，在那裏他發現了聖·克萊爾以及他的部隊正駐紮在河對岸。夜裏他打算偷偷地渡河，給敵軍來個出其不意攻其不備。但是，他並不知道敵軍此時已經得到了增援。到岸之後，他們迅速向三河城靠近，不幸的是，帶路的向導迷了路，把他們帶進了一片沼澤地，後來他們發現方向不對，不得不又往回行走了大約兩英裏。這個時候天已經亮了，敵軍發現了他們的船隻。正當他們還在沼澤地裏艱難地行走的時候，敵軍朝他們開了火，大炮一發接著一發的在他們身邊爆炸，不少士兵倒在了血泊裏。最後，他們終於抵達了三河城，但是已經太晚了，弗雷澤將軍率領的部隊已經先他們一步趕到了，一發現他們，就把他們團團包圍住了。部隊此時亂成一鍋粥，湯普森將軍竭力想要將部隊集合在一起，但是麵對強大的敵人，他最終隻集合了一小部分人，其餘的都四處逃散了。他們中了敵人的埋伏，沒有抵抗多久就被迫投降了。在這次戰鬥中，湯普森將軍、歐文上校以及其他200多名士兵被俘，二十多名士兵犧牲，其餘的人都向大沼澤方向逃跑了。成功逃脫的士兵向蘇利文將軍彙報了三河城戰役的情況，此時，蘇利文才意識到自己低估了敵人的兵力，因而造成了不可挽回的損失。萬般無奈下，他隻好將部隊解散，率領一小部分的炮兵在敵軍趕到之前，撤離了索瑞河口。
蘇利文在給華盛頓的信中表達了自己無限失落的心情，覺得自己沒有完成總司令交給他的任務，感到非常抱歉。他將此次戰役失敗的原因做了詳細的解釋和分析，並說明了部隊目前麵臨的困境。他認為如果不趕緊撤退，那麼僅存的兵力也有可能損失殆盡。沒過多久，他就收到了斯凱勒將軍的回信，指示他將部隊撤退到王冠角。
蘇利文將軍撤退之後，這場收複加拿大的戰役就以美軍的失敗而告終了。這是一場充滿了革命的激情與鬥誌的戰爭，同時也是一場充滿了艱難與困苦的鬥爭，美軍在每一場戰役中都表現了不屈不撓、堅韌不拔的革命精神，雖然遠征的計劃失敗了，但是絲毫不損美軍為爭取自由而戰的光榮形象。但是，美軍從中也吸取了經驗教訓，相比英軍，美軍的作戰缺乏科學的指揮和周密的布局，這是造成這次戰役失敗的根本原因。