7月7日中共中央軍委副主席周恩來，主持保衛國防問題會議，傳達中共中央、毛澤東關於成立東北邊防軍的決定。當天，中共中央軍委代總參謀長聶榮臻將會議決議報告毛澤東，提出以4個軍、3個師255萬人組成東北邊防軍，其任務是保衛東北邊防，必要時支援朝鮮人民軍作戰。東北邊防軍以粟裕為司令員兼政委。毛澤東於當天24時批示：“本日會議決議事項同意，請即按此執行”。
同日美國操縱聯合國安理會通過決議，授權以美國侵朝軍隊為主組成“聯合國軍”。隨後，杜魯門任命麥克阿瑟為“聯合國軍”司令。
7月10日毛澤東複電粟裕並告陳毅、饒漱石：“來電悉。有病應當休養可以緩來，但仍希望你於八月上旬能來京，那時如身體已好，則擔任工作，如身體不好則繼續休養。”
同日周恩來再次主持召開國防會議，最後商定組建東北邊防軍各項問題，並形成中共中央軍委關於保衛東北邊防的決定，決定東北邊防軍部隊於8月5日以前抵達集結地點，除以粟裕為司令員兼政治委員外，以蕭勁光為副司令員，蕭華為副政治委員。此決定由周恩來送毛澤東審查。毛澤東於當日批示：“照此執行”。
7月中旬周恩來委托粟裕傳達指令：華東海軍迅速組織力量，打通長江口航道，掃蕩江浙沿海殘敵；在舟山建立海軍基地，加強戰備，隨時準備應付帝國主義可能擴大的戰爭。
7月14日經中共中央批準，到青島治療。
7月17日軍委發電華東局、華東軍區轉粟裕：“毛主席前電粟要他於8月上旬來京，依情況或留京休養或擔任工作。現粟已去青島休養甚好。請粟於8月上旬來電報告身體情況。如病重則繼續在青島休養，不要來京，如病已愈則盼來京。”
7月22日周恩來與聶榮臻聯名致毛澤東信，報告東北邊防軍部隊8月上旬可以全部到達指定地點，而邊防軍司令員兼政委粟裕需要休養，副司令員蕭勁光、副政委蕭華均一時難以離京到任，建議東北邊防軍先歸東北軍區司令員兼政委高崗指揮，東北邊防軍司令部待粟裕、蕭勁光、蕭華去後再成立。毛澤東於7月23日批示：“同意”。
8月1日鑒於病情日益加重，托到青島的羅瑞卿帶信給毛澤東，報告病情未見好轉，“但又因新任務（指抗美援朝）在即，而自己病症未見轉好，心中甚是焦慮，以致愈加不能定心休息”。毛澤東於8月8日複信說：“病情仍重，甚為係念。目前新任務不甚迫切，你可以安心休養，直至病愈。休養地點，如青島合適則在青島，如青島不甚合適，可來北京，望酌定之”。
8月5日中共中央軍委致電高崗：“邊防軍各部現已集中，八月內可能沒有作戰任務，但應準備於九月上旬能作戰。請高崗同誌負主責，於八月中旬召集各軍師幹部開會一次，指示作戰目的意義和大略方向，叫各部於本月內完成一切準備工作，待命出動作戰”。
8月11日經中共中央批準，撤銷第三野戰軍前委，組成新的華東軍區黨委，陳毅為第一書記，粟裕為第二書記，唐亮為第三書記，負責華東軍區和第三野戰軍的領導工作。
8月23日周恩來召集中央和東北有關部門負責人開會，磋商東北邊防軍的人員補充和供應問題，決定“待聶榮臻回京後，再一同與林彪商決”。
8月下旬由青島轉無錫療養。9月，經上海返回南京。
9月3日毛澤東致電高崗：“林（彪）粟（裕）均病，兩蕭（指蕭勁光、蕭華）此間有工作，暫時均不能來，幾個月後則有可能，估計時間是有的。”
9月5日簽發華東軍區關於第九兵團參加東北邊防軍的行動方案。毛澤東於9月8日批示：“九兵團全部可以統於十月底開到徐濟線，十一月中旬開始整訓。該兵團在徐濟線整訓期間仍歸華東建製，惟裝備及整訓方針計劃受軍委直接指揮為適宜”。
10月8日中國人民革命軍事委員會主席毛澤東頒布命令：“著將東北邊防軍改為中國人民誌願軍，迅即向朝鮮境內出動，協同朝鮮同誌向侵略者作戰並爭取光榮的勝利”。“任命彭德懷同誌為中國人民誌願軍司令員兼政治委員”。
10月17日由南京到上海了解第九兵團行動和空軍交接情況。
10月26日致某同誌信：闡述新形勢下特種兵建設的方針。指出：過去華東特縱建立，是以其作為培養幹部以便爾後大發展的基礎，所以特縱幾乎是包括步騎炮輜以及對空部隊，這樣的組織形式是完全適合當時需要的。而正須大量建設與發展特種兵的今天，如再像過去包羅萬象是不能適應形勢需要的，因此各兵種的分組是十分必要的事。
11月2日下午，抱病出席在上海召開的華東軍區高級幹部會議，作了主戰場與次戰場和軍隊現代化建設問題的報告。關於主戰場與次戰場問題指出：如戰爭大打起來，從世界範圍來看，主戰場在歐洲，亞洲是次要的。從亞洲來看，中國是主戰場。從中國範圍來說，主戰場是東北、華北。“我們已調九兵團去東北，將來如大打起來，還可以調更多兵力去。我們應從全局著眼，隻要主戰場勝利了，就是整個的勝利。”關於現代化問題。要正確認識現代化，應反對對現代化的兩種認識：一是認為現代化很困難，搞不好，這是知識分子的事。另一種認識是認為現代化也“不過如此”，“老一套”，“沒有什麼了不起”。這種自滿情緒也不對，思想上解除了武裝，會使我們進步很慢。他又指出現代化戰爭具有以下特點：立體戰、高度技術、速度快、講協同。提高部隊的現代化水平，當前要做到：遵守時間、提高效率、聯絡順暢、密切協同、嚴格紀律、服從命令、發揚傳統、勇於創新。