溫嶠臨走的時候，向王敦辭行，痛哭流涕，幾次出門了又轉回來。溫嶠走後，錢鳳對王敦說：“溫嶠與朝廷關係非同一般，與庾亮也有深交，不能信任這個人。”王敦說：“溫嶠昨天喝醉了，對你稍有失敬，你怎麼能立刻就誣陷他呢！”
溫嶠到達建康以後，向司馬紹稟報了王敦打算反叛之事，請求事先做好準備。又和庾亮一起謀劃討伐王敦的辦法。
王敦聽說以後，勃然大怒，說：“這個奸險之徒竟然敢騙我！”於是寫信給司徒王導說：“溫嶠才離開幾天，竟然就做出這種事情！我要找人把他活捉回來，親自割下他的舌頭。”
司馬紹想要征討王敦，就向光祿勳應詹征詢意見，應詹鼓勵司馬紹，司馬紹最後做了決定。於是下詔任命將領，準備征討王敦。
這時，司徒王導聽聞王敦病危，就趕緊帶領家中子弟為王敦發喪。大家以為王敦真的死了，士氣高昂。於是尚書向王敦府第頒下詔書，列數王敦的罪狀。
王敦見到詔書，非常生氣，但因為病情越來越嚴重，自己已經不能領兵出戰了。準備發動軍隊攻打京師的時候，王敦讓記室郭璞占卦，郭璞說：“事情不會成功。”
王敦一直懷疑郭璞幫助溫嶠、庾亮，聽說卦象是凶兆，就問郭璞：“你再算算我還能活多久？”郭璞說：“由剛才的卦象推算，明公如果起兵，那就死到臨頭。如果您不起兵，仍然住在武昌，還可以活很長。”
王敦生氣了，說：“你的命有多長？”
郭璞說：“活不到今天晌午。”
王敦就把他抓起來斬了。
王敦讓錢鳳和冠軍將軍鄧嶽、前將軍周撫等人率軍進攻京城。
王含對王敦說：“這本是我們王家的事，我應當親自披甲上陣。”王敦於是任命王含為元帥。
錢鳳等人問他說：“事成之日，天子該如何處置？”
王敦說：“還沒有去南郊祭天，怎麼能稱天子？你們傾盡所有的力量，保護東海王和裴妃就是了。”
於是王敦以誅殺奸臣溫嶠等人為由，向司馬紹上書。
七月初一，王含等人率領水軍、步兵共5萬人，到達江寧秦淮河南岸，京城的人都十分恐懼。
溫嶠把部隊轉移到屯河北岸駐紮，燒掉朱雀桁來以削弱敵方銳氣，使王含等人無法渡河。
司馬紹還想親自掛帥出戰，聽說橋已經被燒斷，勃然大怒。溫嶠說：“現在宿衛的士兵人少體弱，征召的援軍還沒到，如果讓敵人衝進來，就會危及朝廷，隻怕連祖宗的牌位都會受損，陛下又何必可惜一座橋呢！”
司馬紹親自統率各軍出城迎戰，在南皇堂駐紮。初三夜裏，招集精壯士兵，派遣將軍段秀、中軍司馬曹渾等人率領1000名披甲士兵渡過秦淮河，出其不意襲擊叛軍。清晨，在越城與敵人交戰，大獲全勝，斬殺了敵軍的前鋒將何康。
王敦聽說王含戰敗，勃然大怒，說：“我這個哥哥，如同老弱婦孺一般。這下門戶衰敗，大事不成了！”他回頭對參軍呂寶說：“我要起來。”然後用力起身，但因體弱多病，隻能再躺著了。
於是，王敦對舅父少府羊鑒和王應說：“我去世後，王應代替我，先設立朝廷百官，然後再安排喪事。”過了不久，王敦就去世了。
王應不讓死訊泄露出去，也不發喪，用席子包裹屍首，在外麵塗上蠟，埋在議事廳裏，然後和諸葛瑤等人日夜縱酒淫樂。
王敦死後，叛軍沒有了領頭人，人心渙散，很快就被打敗了。王含、王應父子投奔荊州的王舒，王舒帶著軍隊前來迎接，接到後把他們二人扔入長江淹死。
錢鳳逃到闔廬洲，被先前投奔王敦的潯陽太守周光斬殺。周光赴朝廷打算以此向天下人謝罪。
沈充潛逃時找不到方向了，來到自己以前的部將吳儒家。吳儒騙沈充躲在自己家牆壁的夾層裏，然後笑著對沈充說：“三千戶的侯爵在這裏了。”
沈充說：“你如果還顧念以前的情義保全我，我家必定會對你感恩戴德；你如果為了謀取利益而殺我，我死了，你家必定也會被牽連而滅族！”吳儒就把他殺了，把他的頭顱送到建康。
陶侃善治荊州
陶侃很小時，父親就去世了，家境貧寒，經範逵推薦擔任郡裏的督郵。長沙太守萬嗣路過廬江，見到陶侃，覺得他不同尋常，就讓兒子與陶侃相交，結為朋友後才離去。後來陶侃被察舉為孝廉，到了洛陽，豫章國郎中令楊晫把他推薦給中書郎顧榮，陶侃因此而有了一定名聲。
陶侃，東晉名將
後來陶侃等人戰勝了叛亂的蠻族人張昌，他的上司、荊州刺史劉弘對他說：“我過去擔任羊公羊祜的參軍，羊公說我必定能擁有他那樣的成就；如今看你，也一定能繼承我啊。”後來陶侃果然在平定蘇峻叛亂中立下了汗馬功勞。
晉太寧三年（公元325年）五月，朝廷指定陶侃擔任征西大將軍、荊州刺史，統管荊、湘、雍、梁四州軍務，荊州的百姓都歡呼雀躍。
陶侃機靈敏捷，謙虛好學，整天正襟危坐，檢查督管軍府中的眾多事務，沒有一刻閑暇。他常對人說：“大禹這樣的聖人，尚且珍惜每寸光陰，至於一般人，更應該視一寸光陰一寸金。怎能隻顧遊玩喝酒，在世上時碌碌無為，死後也默默無聞呢？這是自暴自棄！”
將吏中有人因喝酒賭錢而置正事於不顧，陶侃就命令收取他們的酒器和賭博用具，全都扔到江裏，然後鞭打那些人，說：“卑賤的奴仆才賭博！老子、莊子崇尚浮華，不是先王那些可以作為準則的言論，對實際事務沒有什麼幫助。有德行的君子應當注重形象，怎麼能蓬著頭、光著腳，還說自己開放通達呢？”