三是對於和自己有師承關係的俞樾，在評論其《群經評議》中《爾雅》部分時，黃侃指出：“偷君此書，中失參半。”肯定其前人所未道及的精到之處，也批評其書“隨意破字之病，較高郵王氏為尤多”。明確表示，“雖師承所自，亦不敢阿其所好也”。表現了他對學術問題嚴肅科學的精神。
其次，黃侃研究《爾雅》，擺脫了經學的束縛，使《爾雅》研究進入了語言科學的新領域。從漢代到清代，學者們一般都認為《爾雅》是明經、通經的工具，有的人認為它還有幫助閱讀其他古書、增廣見聞的作用。不論是前者還是後者，都認為《爾雅》是一部工具書性質的書。
真正說來，清代是曆史上《爾雅》研究成果最多、成就最高的一個時代。研究的視野較之前人擴大了許多，研究的內容較之前人也寬廣不少；然而由於傳統思想觀念的束縛，學者們對《爾雅》的研究仍然沒有脫離明經、治經的範圍。章太炎把傳統的小學改稱為語言文字之學。黃侃在此基礎上提出了訓詁學探討語言的新課題。他說：“真正之訓詁學，即以語言解釋語言。初無時地之限域，且論其法式，明其義例，以求語言文字之係統與根源是也。”提出訓詁學研究的對象是語言，目的是推求語源，探索語義係統和語義發展的規律。在這種思想指導下，黃侃對我國第一部訓詁學專著——《爾雅》的名義和內
容進行了深入的研究。他一方麵肯定了《爾雅》的工具書性質，認為《爾雅》與經傳百家多相同，是訓詁之正義，是“厘正故訓，綱維群籍之書”。另一方麵認為《爾雅》所釋是我國北方地區公用的通語，是經典中常用的詞語，是一部反映上古漢語詞彙麵貌的語言學著作。
黃侃在比較《說文》和《爾雅》兩書異同時，曾說《說文》所釋是脫離具體語言環境的字詞的本義；《爾雅》所釋是出現在具體語言環境中的詞義，其中包括本義、引申義和假借義。指出應當注意兩書的特點，兩類訓詁的區別。但不能因此而認為《爾雅》所釋為非通語語詞的意義，因為《爾雅》所釋不論是詞的本義、引申義還是假借義，都是“公言”“常語”的意義，對這些詞義的研究，就是對當時公言、常語詞義的研究。
黃侃的這一論述，就《爾雅》的研究擺脫了經學的束縛，從明經、治經的狹小天地裏解放出來，為《爾雅》研究開辟了新的境界。這在雅學史上是一次不曾有過的飛躍。這一突破，把《爾雅》研究納入了語言科學的新領域。
其三，黃侃研究《爾雅》，不僅使自己掌握了《爾雅》的精髓，而且摸索出了一條研究的科學途徑，給後學以莫大的好處。
所謂理論的精髓，就是黃侃通過研究後，從理論上闡明
《爾雅》研究中形、音、義三者之間的關係與必須以《說文》、古韻學書為工具和基礎的道理，清代學者研究《爾雅》多采用以聲音通訓詁的方法。這可以解決《爾雅》詞義研究中許多實際的問題，但訓詁和文字、音韻三者的關係如何，文字、音韻的作用是什麼，清代學者還沒有人從理論上加以明確的闡釋。章太炎提出以聲音、訓詁求文字推衍之跡，由音而義，由義而形，將形、音、義三者綜合起來進行研究的方法。黃侃進一步闡述了章太炎的思想。在《爾雅》研究中，他從理論上論述了形、音、義三位一體不可分割的關係，文字、音韻在《爾雅》研究中的作用。他說：“治《爾雅》之始基在正文字，其關捩在明聲音。字不明，則義之正假不能明，音不明，則訓之流變不能明。”深刻地闡明了研究《爾雅》必須以正文字為基礎，以明聲音為關鍵的道理。
與此同時，黃侃還結合自己的治學經驗，提出了研究《爾雅》的一整套具體的方法，包括其程序和參考書。
總之，在古往今來的《爾雅》研究中，黃侃的研究則是具有總結性和開創性的。所以使他在雅學史和訓詁史上成為承前啟後、繼往開來的一代宗師。
黃侃在滬苦鑽的第三本書是《廣韻》，全稱為《大宋重修廣韻》，韻書，五卷，宋陳彭年等奉詔重修。收字二萬六千餘，平聲字多，分上下二卷，上平二十八韻，下平二十九韻。
上、去、入聲各一卷，上聲五十五韻，去聲六十韻，入聲三十四韻。共二百零六韻，研究上古語音的，大都以此為重要根據，研究上古或近代語音的，也都以此作為比較的資料，是漢語音韻學中重要的一部韻書。
黃侃對古音學的研究，主要是從《廣韻》出發來著手的。他曾說過：“凡舍《廣韻》而別求古音者，皆妄也。”從《廣韻》出發，依鄒漢聲古聲紐說，劉逢祿的古韻部說，陳澧的今音學說，提出了“古本紐”“古本韻”的看法。
對於“古本紐”（即“古本聲”）的確定，他是從《廣韻》“歌部”入手的，歌部音本為元音，觀《廣韻》歌、戈二韻音切，可以證知古紐消息，如非敷奉微，知徹澄娘，照穿床審禪，喻日諸紐，歌、戈部中皆無之，即知古無是音矣。黃侃此一論證，其師章太炎“初不以為然”，後乃見信，於《薊漢微言》一文中譽為“此亦發明”。師弟間善善從長，令人感佩。
那麼28部是如何擬定的呢？28部考定論證的方法，一如確立19紐之例，即考察《廣韻》裏凡有19紐的韻，謂之“古本韻”。依他看來，“大抵古聲於等韻隻具一、四等”，所以，《廣韻》韻部與一、四等相應者，必為古本韻，不茬一、四等者，必為後來變韻”。這樣，他考定出具有19紐的一、四等“古本韻”共32個。在這32韻中，有8韻開口、合口相配，它們是歌、戈、寒、桓、曷、未、魂、痕。並其開合而為4，32
去4即為28，這28韻即為“古本韻”，它們不是一等便是四等韻。於是，古韻28部就這樣確立下來。
此28部，“皆本昔人”，可謂集乾嘉古音學之大成。
然而從黃侃提出古聲19紐和古韻28部說以來，卻有兩種截然相反的看法。
一方麵是林語堂的批評，他說黃侃的古音研究犯了循環論證的錯誤。隨之而來者有王力等。王力認為：“黃氏以古本紐證古本韻，又以古本韻證古本紐，在理論上犯了乞貸論證的毛病……總之，他‘古本韻’‘古本紐’之說絕不可信。而陰、陽、人三分之說不失為一家之言，我們應該分別來看，不可因他立言失當而完全抹殺他的古音學說。”王力的意思是，黃侃求古音的方法應當否定，而他的成果則不能抹殺。
另一方麵是錢玄同和劉賾等的肯定，錢說：“今人黃君季剛承章君之學，刊《廣韻》206韻中考得古本韻32韻（知此32韻為古本韻者，以韻中止古本聲19類也。因此32韻中止有古本聲，異於其他各韻之有變聲，故知其為古本韻。又因此32古本韻中之聲類止有19，故知本聲之僅此19類。本聲本韻互相證明，一一吻合，以是知其說之不可易），……今黃氏根據《廣韻》之古本韻而定為28部，可謂至當不易之古韻部居。由是蓋可知章君所定，本體己合於古，若更補此五部，則完全無缺矣。”劉賾著《漢語韻圖說》，針對錢玄同對黃侃的評論曾
說：“錢君所論諸家古韻標目及分部異同與得失，至為審諦。先師黃君於《廣韻》中求得古韻28部，其部數適與鄭庠及顧、江以來古韻諸家之說吻合，而奄有眾長。故錢君推崇備至也。”錢、劉對黃侃古音說從方法到結論都給予了充分肯定。
綜觀黃侃有關古聲19紐和古韻28部的全部論述，可以看出他始終是將音理、音史、音證結合起來進行古音研究的，並專從《廣韻》中求古音。這是一種辯證思維的方法，是非常科學的方法。
黃侃在那樣艱苦的條件下取得如此重大的學術成果，太可寶貴了！正如古人所雲：“艱難困苦，玉汝於成。”
黃侃手寫《說文形聲字稿》
六、轉換戰場，在北大
當教授
1914年秋天，黃侃經北京大學文科學長（即文學院長）夏錫祺向校長胡仁源引薦，入北京大學國文係任教授，講授《文學概論》《詞章》及《中國文學史》。
新來乍到，所見所聞，使他心潮澎湃，浮想聯翩，遂作詩一首，題目叫《賦初入都》：
依然繁盛舊長安，
五噫誰同梁伯鸞？
樂府猶聞歌玉樹，
仙人已見泣銅盤。
興亡自是諸君責，
功罪須從異日看。
酒罷登樓一惆悵，
西山斜照近闌幹。
來北都後，麵臨的第一件揪心事情就是要營救老師章太炎。1914年2月，章太炎因反對袁世凱複辟稱帝，被袁世凱指使陸建章幽禁於北京。開始，章太炎被禁錮在一所被廢除的軍校內，繼而，又被移禁於龍泉寺，並派巡警守門。同年6月，章太炎絕食裝瘋七八天，袁世凱派醫診視後，遂將其移居到東城錢糧胡同。黃侃到京後，探知章太炎的下落，便冒著殺頭之險，搬進錢糧胡同與章師同居，一麵侍奉太炎，一麵與太炎日夜論學。經過一段時間後，警察逼令黃侃遷出，章太炎繼續絕食。在此情況下，黃侃集同門諸人致教育總長湯化龍論救。