遭遇德軍魚雷
1937年，蒙巴頓晉升為海軍上校，1939年初被任命為“凱利”號艦長。1939年8月23日，蒙巴頓以艦長的身份正式接收“凱利”號，並親自在艦上升起了皇家海軍軍旗。
蒙巴頓早就斷定歐洲大戰會再度爆發。而且，在英國，除了蒙巴頓之外，幾乎再沒有別人注意到丘吉爾。在整個30年代，丘吉爾被三個政黨的領導人所厭惡和疏遠。
1939年9、10月間，“凱利”號與德國潛艇進行了殘酷的戰鬥，共擊中了9艘德國潛艇，其中確定擊沉一艘，其他幾艘的毀傷情況不明。
1929年11月下旬，“凱利”號奉命出海搜尋一艘U型潛艇。蒙巴頓提出港口可能已被德國人布下了水雷，但他的意見未被重視。當“凱利”全速駛向一艘正在燃燒的油輪時，一枚水雷撞上了螺旋槳爆炸。
在“凱利”號維修期間，蒙巴頓帶著參謀人員到第5驅逐艦隊的“卡爾文”號上繼續戰鬥，直到1940年2月“凱利”號修複完畢。
1940年5月，“凱利”號奉命與“伯明翰”號巡洋艦一起出航，在靠近海岸的北海水域搜捕德國布雷艇和一些E型艇，途中“肯達華”號等新型驅逐艦加入搜捕編隊。5月14日夜，“凱利”號被德國魚雷擊中了。
8月8日，不列顛之戰開始。雖然“凱利”號此時正在維修，因而沒經曆英國這段黑暗的時刻，但蒙巴頓卻在此期間打了一場他一生中受批評最多的海上戰鬥。
9月，蒙巴頓臨時受命指揮第5驅逐艦隊的“標槍”號等三艘驅逐艦，此時第5驅逐艦隊駐泊在樸次茅斯，處於英國防線的最前沿。11月29日5點40分，“標槍”號驅逐艦的雷達屏幕上出現了5艘德國軍艦，蒙巴頓立即率領“標槍”號等3艘戰艦出海迎敵。在距敵艦約900碼時，“標槍”號進行邊舷側炮火齊射，這次未命中。緊接著蒙巴頓親自校正位置，又組織一次炮火齊射，命中德軍旗艦。但就在蒙巴頓下令發射魚雷的話音未落之時，兩枚德國魚雷先後擊中了“標槍”號，使它失去了戰鬥力，隨即德艦便釋放煙幕撤出了戰鬥。
戰鬥結束後，蒙巴頓受到了各種各樣的指責，心裏特別難受。但這次挫折並沒有影響到他的功績。1941年元旦，蒙巴頓被授予優異服務勳章，除了維多利亞十字勳章之外，這是對軍人勇敢的最高獎勵。
1940年12月15日，“凱利”號重返第5驅逐艦隊。1941年4月，“凱利”號第5驅逐艦隊離開樸次茅斯，前往地中海。“凱利”號所駐泊的港口距西丁裏半島上的德國空軍機場隻有100英裏。
5月初，“凱利”號奉命襲擊駐泊在本華茲內的德國艦船。在夜暗的掩護下，“凱利”號悄悄駛到港內防波堤的出口處，由於事先已將艦炮的方位設置好，因此幾次突然齊射便擊沉了港內大部分德國艦船，然後在德軍岸防部隊做出反應之前，迅速撤出。
1941年5月20日，德軍對克裏特島發起了海空協同進攻。21日晚，蒙巴頓率“凱利”號隨第5驅逐艦隊出航迎戰。23日上午，“凱利”號遭到德軍大批飛機轟炸並被擊中沉沒。1941年10月，蒙巴頓晉升為海軍準將，負責指揮英軍兩棲聯合部隊。此時的蒙巴頓剛剛40歲出頭，軍銜也不高，突然提拔到白廳，很顯然，讓白廳的當權者無法接受。這也讓蒙巴頓吃過不少苦頭。
1942年3月4日，蒙巴頓擔任聯合作戰部隊最高指揮官，並兼任參謀長委員會裏的第四參謀長，被授予海軍中將、陸軍中將和空軍中將的軍銜，成為英軍曆史上第一個同時獲得3個軍種軍銜的將軍。
1942年8月，蒙巴頓指揮聯合作戰部隊對法國北端瀕臨拉芒什海峽的迪耶普展開進攻，從結果看毋庸置疑是一次失敗的軍事行動。參加迪耶普行動的6086人中，被消滅、負傷和失蹤者共有3623人，占59.5%，而行動前的預計是10%～20%。更糟糕的是，參戰的加拿大官兵總共4865人，而傷亡、失蹤人員達3367人，占其總人數2/3以上。對這次失敗，蒙巴頓在當時和後來都沒公開指責任何人，也沒有逃避自己應負的責任。