少數散在的腎內尿酸結石，一般對腎功能沒有什麼影響。限於一側腎髒內的尿酸結石即使是多發性的，而且對該側腎髒已造成損害，對側腎髒也可代償性維持正常的腎功能。如果雙側腎髒均有較多尿酸結石存在，則較易引起腎功能損害，甚至引起腎功能不全及尿毒症。在腎盂及腎盞部位的結石由於阻塞腎盂，可造成腎盂及腎內積水，使腎內壓升高，壓迫腎髒，使腎髒擴大，最後可喪失功能。輸尿管內的尿酸結石主要危害是阻塞輸尿管，使腎髒形成的尿液不能進入膀胱排出體外，而引起阻塞上端的輸尿管和腎盂積水。膀胱內及尿內的尿酸結石則可刺激膀胱及尿道粘膜，引起粘膜損傷，亦可阻塞尿路引起排尿困難，甚至尿瀦留。
當結石引起尿路梗阻、腎盂積水及排尿障礙等後果之後，尿中的尿酸不能排出體外，進一步在腎髒及尿路中沉積而形成新的尿路結石，或使原已存在的結石增大，形成惡性循環。有尿路結石的痛風病人也容易發生尿路係統的感染，如腎盂腎炎、膀胱炎、尿道炎等，而且很易轉為慢性尿路感染，這主要是因為結石可直接損傷腎髒、膀胱，引起局部粘膜破潰而有利於細菌的侵入。此外，腎盂、輸尿管梗阻引起腎盂積水、膀胱尿瀦留、排尿不暢等均有利於細菌的侵入與繁殖。反複發作的尿路感染又可促進結石的發生與發展，二者互為因果。所以，痛風病人發生尿路感染時應及早給予徹底有效的治療。