第二十四疑問三點圓伊不縱不橫不並不別舉橫川走火火縱橫縱橫並並別。
答今見疑問不見用法單見事求何也本此圓伊三點元喻三德法身案光明疏凡一十箇三法皆一三無異在果時謂三德三身三解脫在因時雲三德三煩惱三識等如此之三法一一此中體不相離三一身三身三不定離則非一合亦非三名不可思議之三一也即舉圓伊以為其喻三因以比其功耳若雲橫川即竪四教意若雲走火即橫四教意如此分橫竪故非圓法我今如來藏智三德法身何甞次第何甞不次第何甞偏何甞圓何甞不偏何甞不圓今此圓中其法如此故能次第能不次第能偏能圓故名不可思議如圓伊三點其法如是今不見法況但見事求故雲非宜也文中雲三點具足即成圓伊如今但取一點自體相即那得非得伊非伊何得不縱不橫隻是一分點字若如此見無情隻說一點何處有三若爾何隻有一身無三身也隻有一德無三德也眾生隻有一性無三性也隻有一煩惱業無三業也如此三數邐迆配之但此一而二三也若雲秤互相即隻得其名此何名也此名何所召召何理也若言橫川走火亦復點字者亦非也本將偏以顯圓明橫川走火非今將點字稱雖難此何顯名故知非也古德釋祕密藏雲解脫之法亦非涅槃如來之身亦非涅槃摩訶般若亦非涅槃釋三法各異亦非涅槃我今安住如是三法為眾生故名入涅槃如世伊字三點若並則不成伊縱亦不成更舉喻釋如摩醯首羅麵上三目乃得成伊三目三相一在額上二如人眼故舉此況伊也三點若別亦不成伊故結雲我亦如是今故隻取一點作不互為不縱不橫義雲今釋與經異者具如先述應知仁者用心大論取意太過失圓伊義今若作此釋隻得一點不得三點若爾與為論隻單得一分法身並無報應隻雲一分能應德般若解脫並無此是孤獨解脫無諸權用聲聞一法尚非具足況如來圓常耶。
第二十五疑問引文雲乘戒四句破事戒受三惡身持理觀見佛得道又案持相文雲前來諸戒律儀防止故名不具足中道之戒無戒不備故名具足又雲理觀觀心論持戒者具足能持上十戒也疑雲若準此文乘急之人無戒不備何故名為戒緩亦名為破事戒受三惡身者。
答以理觀觀心具足持十戒者理中無造作何論持破又雲中道之戒無戒不備此理與中道左右異名無二體也既無造作但名理戒持之是乘乘於此乘見佛聞法而事戒律儀之中違犯七聚以違犯事戒故的須受三惡身何以故違事戒故以乘急故於惡道身見佛聞法今問乘急之人無戒不備何故名戒緩者 答單觀此乘緩事戒否乘戒兩事各別體不相關不得將乘戒為事戒故四句中各具乘緩急義為（去聲呼）有緩急故報有昇沉乘是理戒戒是事戒若事理合持是第一句受人天身於華嚴中見佛聞法豈有三惡道受餘如常談今何事事單守一理既無造作此理何所至到若爾此理具無記之體守此為三惡之根何謂是持戒不應爾。
第二十六疑問引文雲無明癡惑本是法性以癡迷故法性變作無明起諸顛倒等疑雲癡迷與無明此二有何殊而雲癡迷故法性作無明又元初無明為從法性起為從法性外起若法性起法喻不合若外起者無明癡迷法本非法性也又元初法性由何等因緣而起癡迷也。
答此難意太過文雲無明癡惑本是法性以癡迷故法性變作無明起顛倒善不善等彼舉喻如寒來結水為氷水本非氷被寒所加法性本非癡迷被無明所加變作癡迷迷生故造作諸惡業如寒寒重故以水結成氷所問為癡迷與無明此亦何殊者 答無明與法性淨穢無乖的迷悟論此即無二元理既一無明與癡迷不是兩物何名無明何名癡迷 答觸事不知名為無明隻緣觸事不知名之為癡以癡不知故不識是非故名為迷為此無明不知不識不知是不識非造作諸業招生死果十二因緣三世輪轉此即是迷若法性者本是清淨一如真諦諦備萬德不是癡迷今隻為無明所覆法性不明全此法愛作無明無明若明朗然大照此無明全是法性此法性全是無明何以故迷故悟故下文雲無明即是法性見思破即是無明破無明破即是見法性何曾是二如人迷東為西至可悟時即上來迷西處便是東無別東也不得離無明外覓法性不得離法性外別覓無明先問元初癡迷為從法性起為法性外起此合即是兩體更喻說如一人具解種種妓得種種名尅名定實非二人也應知不得言從四句起皆妄計也中論所破（雲雲）
第二十七疑問五品十信差別不同諸忍位號亦異者。
答五忍名位次第如仁王大師配位釋名隨處取理故有不同仁王據別法華中用義據圓大師立義具準經文法華經中所列五品十信文相挌量非不分明乃約如來在世滅後之異佛世時四信弟子佛滅後名五品弟子若約修證論其階位無差別大師雲約佛世滅後之異耳又雲初隨喜品是入信心位分一品為兩心五品即十信心即是鐵輪六根清淨位也已上並是大師說法意應憑取解何更搆疑若於大師至疑更從誰受法耶言忍位不同者大師立義凡諸所釋皆通別兩途若準通釋初伏忍名極至等覺總名伏忍下四忍亦如是其第五品寂滅忍從初伏忍隨其伏處煩惱不起分得寂滅忍之名亦寂滅忍此是分寂滅義餘四亦如是已上通釋若別釋者從初伏忍終至寂滅是妙覺位此則終極為寂滅忍也今依通義故忍名處處不同亦是圓別異故不同也仁王中有一往義亦有再往義一往者從十信至十向名伏忍即十地名信順無生三忍據下再往中即第十與佛同為寂滅忍此是一往義若再往者於十地中分別五忍謂前四十心為伏十地初三為信四五六地為順次三為無第十與佛同為寂滅忍言第十與佛同者此位開兩即等覺菩薩及妙覺也又言今家釋但言伏亦無信忍者下文取住行向為順文在此既取住行向為順明知取十信為信忍也此理明（矣）今取住行向為順忍五品為伏為信即至住行向正是順忍如此次第故不相違其趣如是望不疑也若圓位中初伏即是後寂滅即信即順即寂滅但舉一忍名即具初後是但得圓宗意諸不同自更何疑也。
第二十八疑問引文破法遍中見思即是無明無明即是法性疑雲見思惑即無明何故文雲初信斷見二信已去斷思惟惑八九十信斷界內外塵沙惑也十信已去斷無明又見思等即無明者初信位應見中道何故待至初住方得見乎輔行釋意不明者。
答止觀本文中總相說亦名圓說輔行中別相說總相說者見思即無明同一體故隻為有無明故便生見生思若無無明見思無處生無明本是法性隻為迷故法性變作無明無明若明法性即顯法性若顯無明即破無明破即見法性入實相空既入實相何法不空與非破遍何也輔行中別相說者雲若從文說見思障真無明障中若從意說見思之外無別無明何者體法性見思豈離法性故雲亦即法性何故以同體故如此銷釋甚為分明不測高意如何取別稱意不明請細尋之（雲雲）。
第二十九疑問引文雲始自初品終至初住一生可修一生可證者誰為其人若龍女是應先世種修非一生修證之例也又引起信論雲是菩薩或示超地速成正覺以為怯弱眾生故說於無量阿僧祇劫當成佛道又雲以為懈怠眾生故示如是無數方便不可思議而實菩薩種性根等發心亦等所證亦等無有超過之法以一切菩薩皆經三阿僧祇劫故但隨眾生世界不同所見所聞根欲性異故示所行亦有差別者。
答如此二說本非相乖隻為機悟不同如來種種方便為對懈怠眾生說佛道長遠久受勤苦方可得成為治厭長眾生故雲佛道易得然諸佛一法本無長短亦非難易皆是隨機性也為怯弱者說法長劫故下文證為懈怠者示如是無數方便不可思議而實菩薩根性發心所證並皆俱等此文證上上機也有言無有超過之法一切菩薩皆經三阿僧祇劫者此證隨機說法示中機也所所但隨眾生世界不同故所見所聞根欲性異故示所行亦有差別者此即俱證頓漸之機是悉檀隨機性施益之義也釋隨眾生世界不同者即有三五七九乘機緣不同也釋隨雲文明矣斷見者約機且分四品謂上上上中下上上機乘上上乘即見實相理具一切佛法無缺少也即圓頓入也上機見實相事一切法無非實相故此人得事不同理謂須假緣修方便顯出此理次第修行故此別教也中機見體法空真下下機折空真隨見聞處悟解脫破惡故是對治也隨見聞處歡喜是為人也隨見聞處得入理是第一義也故立根欲性異根即世界欲即為人性即對治異即第一義也願見長者示長願見短者雲短如此悟解在機故菩薩示亦超四悉檀之益也更別示者前本文雲一生可證者約理也經雲龍女者約事也且理者圓極之理無初中後一念備足無所闕少頗有凡夫初發心時便登正覺者此理即有此事即無也能知此理具足圓滿者此身心而是三身三德十界三法具足一心三觀是了了分明見具足無減修若備此知即是一生可修一生可證之義離此修外無復別論離此證外無復可證即是此生得義不待進位登到初住方破無明耳夫無明是出假名若知無明即是明明了何處更有無明隻為朝夕行住坐臥即全是無明若能了達即此朝夕行住坐臥便是明了不得將明了了見之是無明若爾者眾生作明白之見行既非是明菩薩更示何法而令求解脫耶可雲發心畢竟二不別是其義也今理既備心令此知依法行即是到妙覺地豈假歷別方便諸教簡麤顯妙千徹萬途耶我今能如是知亦如是行如是證任運如是觀智恒隨彌又彌明轉深轉固功德智顯故四十一位始末並如即大品雲初阿後荼無二無別此是理具頓見頓修非謂不修而自進路名之曰修故經雲煩惱即菩提結業即解脫生死即法身不待斷然後證故是頓故是圓也舉龍女答是事也終不以不修而自得果今且舉此事作答證其圓頓得而有積修之義者正是龍女初發心時一發一切發圓見中道理能依圓而修但於事戒緩而受於龍報而於圓乘急於彼法華中而現作佛事故於此生而速證圓位之義如此故不應別覓其證也如此說者可以意會之不可以事求之難雲。
第三十疑問止觀中用氣治病文謂吹呼嚂嗬噓[口*詩]皆於脣吻吐納轉側牙舌徐運心帶想作氣者疑雲此等六氣一一作氣其如何等。
答如文○吹去冷鼻徐內溫並是一一作乃至[口*詩]去勞乏鼻內和補皆出於口門吹者其相如吹火法是鼻中徐徐納其冷氣內於腹中帶想者帶涼冷之想想其涼冷之氣從鼻湍入至齊輪繞香輪又還到鼻帶其涼冷之想想其氣出入所到一畢已又更作重吹重納取鉢中綃了覺以噓涼也是以一法也呼氣者依名作氣呼（虎胡反）呼法如此此經舉出盡後還出鼻中徐徐納同得體涼此兩氣共治乏用鼻內和補嚂氣亦如呼氣法盡氣任去依嚂名依氣治法如文嗬噓[諿-耳+可]各依名呼召之即是也但依虗言呼喚依字呼之即是隻為彼方言不同故未語耳又疑雲各各作氣其如何者若勞乏即用吹呼氣治病及除風用嚂氣治一一依文用氣次一一和補但覺稍稍有効可即帶想除之補之是也又息有四伴如文細心推之即是無別法也又則則則勞則定言上三不是息守之則散則結即勞守息則定今應去上三伴守第四息大師果果之命人識知如文可解請細詳之即是又出入有盡有不盡者文具細委之非言示麵對方決又雲別運十二息者帶假想心若有上來六種疾病此吐納以吐六並納六共十二息以共治之帶假想者如冷須帶暖想若熱須帶冷想想此冷熱息到其病處此謂假想也故名依息帶想即能治病也然此六氣四伴十二息想如文已細作了若得之見文合得雖然甚難至難此須麵對口決文字中傳示難會也知之。