耶和華的話臨到亞米太的兒子約拿，說：“你起來往尼尼微①大城去，向其中的居民呼喊，因為他們的惡達到我麵前。”
約拿卻起來逃往他施②去躲避耶和華，剛到約帕，正好有一隻船要往他施去，他就給了船價，上了船，要與船上的人同往他施去，好躲避耶和華。
然而，耶和華使海中掀起驚濤駭浪，海上狂風大作，開往他施的船隻不堪風暴的摧毀，眼看就要傾覆，沉沒海底。水手們個個懼怕，各人哀求自己的神。他們把船上的貨物拋在海裏，這樣可以減輕一些重量。這時，約拿正在底艙睡覺。
船主下到船艙去找他，說：“你這沉睡的人哪，為何還在睡覺呢？起來，求告你的神，也許神顧念我們，使我們不至滅亡。”
船上的人此時手忙腳亂，互相議論，說：“我們來掣簽，看看這災臨到我們是因為誰的緣故。”於是他們便掣簽，掣出約拿來。船上的人對他說：“你對大家說清楚，這災臨到我們是因誰的緣故？你是幹什麼營生的？你從哪裏來？是哪一國、屬哪一族的人？”約拿回答說：“我是希伯來人。我敬畏耶和華那創造滄海旱地之天上的神。”
他的話使問他的那些人個個懼怕，對他說：“你這是做的什麼事呢？”他們個個膽戰心驚，因為約拿告訴了他們上這隻船的原因，他們知道了他是故意躲避耶和華。這時海浪翻騰得更厲害了，他們對約拿說：“我們該怎樣做才能使海浪平靜下來呢？”約拿對他們說：“你們把我抬起來，拋進大海裏，海就平靜了。我知道你們遭這大風浪是因我的緣故。”
然而，他們不好下手，隻是努力地搖槳，想要把船靠攏岸邊，但卻是徒勞，海浪越發翻騰得厲害。他們便求告耶和華說：“耶和華啊，我們懇求你，不要因這人的性命使我們死亡，不要使流無辜人血的罪歸與我們，因為你耶和華是隨自己的意旨行事。”於是，他們抬起約拿，把他拋在海中，海上的狂浪便平息了。船上的人便大大敬畏耶和華，向耶和華獻祭，並且許願。
耶和華安排一條大魚吞了約拿，他在魚腹中三日三夜。
約拿在魚腹中禱告耶和華他的神，說：“我遭遇患難求告耶和華，你就應允我；從陰間的深處呼求，你就俯聽我的聲音。你將我投下深淵，就是海的深處；大水環繞我，你的波浪洪濤都漫過我身。我說，我從你眼前雖被驅逐，我仍要仰望你的聖殿。諸水環繞我，幾乎淹沒我，深淵圍住我，海草纏繞我的頭。我下到山根，地的門將我永遠關住。耶和華我的神啊，你卻將我的性命從坑中救出來。我心在我裏麵發昏的時候，我就想念耶和華。我的禱告進入你的聖殿，達到你的麵前。那信奉虛無之神的人，離棄憐愛他們的主；但我必用感謝的聲音獻祭與你。我所許的願，我必償還。救恩出於耶和華。”
耶和華吩咐魚，魚就把約拿吐在旱地上。
耶和華的話第二次臨到約拿說：“你起來！往尼尼微大城去，向其中的居民宣告我所吩咐你的話。”
約拿便照耶和華的話起來，往尼尼微去。
尼尼微是一個大城③，需要三日的路程才能走完這個城。約拿進城走了一日，宣告說：“再等四十日，尼尼微必傾覆了！”
尼尼微人信服神，約拿的宣告迅速傳遍了全城，尼尼微人聽了，便宣告禁食，上至國王下至百姓，都穿麻衣。
尼尼微王耳聞約拿宣告的刑罰，下了寶座，脫下朝服，披上麻布④，坐在灰中。他曉諭遍告尼尼微通城說：“王和大臣有令，人不可嚐什麼，牲畜、牛羊，不可吃草，也不可喝水。人與牲畜都當披上麻布，人要切切求告神。各人回頭離開所行的惡道，丟棄手中的強暴。也許神回心轉意，不發烈怒，使我們不至滅亡，也未可知。”
他們痛悔的一切作為神都察看了，耶和華見他們離開惡道，就饒恕他們，不把所說的災禍降與他們了。
耶和華饒恕了尼尼微人，這使約拿大為不滿，甚至發怒，他向耶和華禱告說：“耶和華啊，我在本國的時候豈不是這樣說過嗎？我知道你是有恩典、有憐憫的神，不輕易發怒，有豐盛的慈愛，並且後悔不降所說的災，所以我急速逃往他施去，耶和華啊，現在求你取我的性命吧！我這樣活著不如死了的還好。”
耶和華說：“你這樣滿腹怒氣合乎情理嗎？”