“愛宕”級直接引進了美國“宙斯盾”作戰係統的組成部分綜合反潛作戰係統，而沒有沿用“金剛”級上的國產係統。這套係統具備了遠距離探測多類型水下目標的能力和對淺水水域的低噪聲潛艇和低速航行的潛艇的優良探測能力。
“愛宕”級上裝備的反潛武器是“阿斯洛克”反潛導彈和MK-46Mod5型及73式輕型反潛魚雷。同時，還裝備1架多用途反潛直升機。“阿斯洛克”反潛導彈最遠射程28千米，可對處於水深40~1000米的潛艇展開攻擊。其戰鬥部為一枚MK-46Mod5型反潛魚雷。
“愛宕”級有16個MK-41垂直發射單元裝備“阿斯洛克”反潛導彈，備彈16枚。日本目前正在以國產97式魚雷為戰鬥部研製國產新型反潛導彈。
MK-46Mod5型反潛魚雷最高航速44節，射程11千米/40節，作戰深度61~4572米，其製導精度很高，並具有多次重複攻擊的能力，製導係統在丟失目標後可重新進入搜索狀態，直至動力耗盡為止。
“愛宕”級的近防係統是2座MK-15BlockⅠB型“密集陣”近程防禦係統，布置位置為艦艏、直升機庫上各一座。電子戰裝置為NOLQ-2綜合電子戰係統和4座MK-36Mod12型箔條誘餌發射裝置以及魚雷誘餌。對海作戰武器則是8枚90式反艦導彈。而“金剛”級上裝備的則是美國的UGM-“魚叉”反艦導彈。
此外，“愛宕”級的艦體也在“金剛”級的基礎上做了重大改進。如增設了直升機庫，桅杆改為迎風傾斜式整體桅杆等。
宙斯盾
“宙斯盾”作戰係統是美國海軍為了滿足艦載防空係統的需要而開發的“先進的艦用導彈係統”。在美國海軍看來，“宙斯盾”作戰係統可以有效地防禦敵方同時從四麵八方發動的導彈攻擊，它構成了美國海軍艦隊的堅固盾牌。
“宙斯盾”作戰係統具有幾大特點：它的反應速度快，主雷達從搜索方式轉為跟蹤方式僅需005秒，能有效對付作掠海飛行的超音速反艦導彈；它的抗幹擾性能也很強，可在嚴重電子幹擾環境下正常工作；在反擊能力方麵，該係統作戰火力猛烈，可綜合指揮艦上的各種武器，同時攔截來自空中、水麵和水下的多個目標，還可對目標威脅進行自動評估，從而優先擊毀對自身威脅最大的目標；從可靠性來看，它能在無後勤保障的情況下，在海上連續可靠地工作40~60天。
美軍的“宙斯盾”作戰係統自1981年研製成功之後，先後裝備了美國27艘“提康德羅加”級巡洋艦以及最新型的“阿利·伯克”級驅逐艦。日本海軍新一代“金剛”級驅逐艦上也配置了從美國采購的“宙斯盾”作戰係統。
由於“宙斯盾”作戰係統代表了當今世界最先進的海軍科技水平，其造價自然非常高昂，每套作戰係統造價高達兩億美元。盡管如此，還是有越來越多的國家紛紛加入製造“宙斯盾”戰艦的行列。這些國家中既有老牌海軍強國德國、荷蘭，也有挪威、韓國等。