石室的右下方大平台，是重建後的彌陀岩寺，寺中有大殿五觀堂等，大殿為單簷歇山式建築。殿內供奉阿彌陀佛和觀音、大勢至菩薩，為脫胎飾金佛像。三世佛並排結痂跌坐於仰覆蓮花座上，主像高些，左右兩像稍低。佛像保存完好，皆為吐蕃式樣：佛發螺鬢，上置寶嚴。麵相上寬下窄，雙耳垂肩，肩寬腰細，均著袒右肩袈，並以袈裟一角搭於左肩上。衣紋用凸雕線條表示，雖曆經滄桑而線條依然明顯。石像均有圓形頭光及身光。
中尊為釋迦像，又稱現在佛，主司現在的世界，其造像作觸地印之魔相，一手向下撫地，一手向上。左尊稱為藥師佛，即過去佛，主管過去的世界。他也是一手向下，一手向上，隻是左掌托缽。右尊叫彌陀佛，是未來佛，做施定印之禪定相，即雙手交疊置於腹部。
險要的地勢，精湛的技術和迥異的形狀，無不讓每一個參觀者嘖嘖稱奇。
南台岩則如“空中樓閣”，巨石高聳，視野曠遠，左挹大海，右帶金溪，晉水橫波，古城在抱，紫帽淩霄峙其前，東西兩塔拜其下，是“山海大觀”意境區中一處妙奪天工的奇景。
1952年在清源山風景名勝區彌陀岩西側興建“弘一大師之塔”，塔內安放著大師的舍利子。石塔建築材料取材於馳名的泉州白花崗岩，經過精雕細作，使整座石塔具有閩南地方仿木石構的建築特色，塔內頂部為蜘蛛結網的藻井仿木鬥拱結構，層層疊起，以增大塔內的空間效果。
弘一大師舍利塔左側摩崖上有中國佛教協會原會長趙樸初“千古江山留勝跡，一林風月伴高僧”的石刻。右側為曾任新加坡佛教總會主席廣洽、廣淨法師的舍利塔。
由於弘一大師在美術、金石、書法、音樂、佛學等方麵的高深造詣，因此與太虛、印光並稱為近代三大高僧。他流傳在泉州的墨寶甚多，舍利塔前的“悲欣交集”係其生前最後遺墨。
清源天湖既是蓄水工程，更是景觀工程。大壩雄偉壯觀，水麵波光粼粼，湖畔山峰林木倒映湖中，藍天白雲，湖光山色，交相輝映。
瑞像岩是清源山風景名勝區“幽穀梵音”意境區內的主要景點之一。矗立在天柱峰上的瑞像岩石室，創建於宋元祜二年，初為木構，1483年間改為仿木石構建築。石室內的宋代石雕飾迦瑞像，以天然崖璧雕琢而成，做立狀。佛像莊嚴大方，端莊慈祥，雕工精湛，是我國古代建築和佛教石雕藝術的重要實物資料。與天柱峰對峙的羅漢峰，怪石嶙峋，千姿百態，猶如一尊尊威武的羅漢，惟妙惟肖，栩栩如生，構成“五百羅漢”朝釋迦的神奇景觀。穿過石室左側的崖洞，豁然開闊，隻見三塊巨石恰似三條大蟒蛇，伸頭出洞，故謂“三蟒出洞”。
古時在山崖的平台處，建有“望州亭”，可俯瞰古城勝景。崖璧上顯眼的“忘歸”石刻兩字，道出了如此美妙的自然景觀和人文景觀，使人流連忘返。
靈山聖墓是我國現存最古老、最完好的伊斯蘭教聖跡，在清源山風景名勝區靈山景區內。據明代何喬遠《閩書》記載，唐武德年間，穆罕默德遣四賢徒來華，一賢傳教廣州，二賢傳教揚州，三賢沙仕謁，四賢傳教泉州，卒葬靈山。
墓上刻伊斯蘭教常用的“雲月”圖案或《古蘭經》片段。墓前放有一塊天然巨石，風吹欲動，手推能晃，故稱“風動石”，明代泉州知府周道光題刻“碧玉毬”三個大字。
碧霄岩分為上、下碧霄。從入口處仰視，碧空如線，又稱“小有天”，洞旁的岩壁上刻有“透碧霄”三字。由洞口順梯而下，便進入下碧霄。
這裏有元代藏傳佛教“三世佛”石雕造像，有“廣欽老和尚塔院”，塔內安放著老和尚的舍利子。在塔院上方的摩崖上，雕刻有“廣欽老和尚坐禪伏虎”浮雕，更具神奇的色彩。
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傳說，天宮中的老君一天下凡到泉州清源山觀景時，忽然看見一個大火球朝人們撲去。老君使出了法術，將火精打回原形逃之夭夭了。他為了使火精不再來騷擾人民，便舍身化成一尊神像，守鎮清源山腳下。清源山的人們十分感謝、敬佩老君，便將這座神像稱作老君岩。