隨處可見的顯示器上不斷的顯示著一個令人興奮的DNA螺旋體，高度防護的實驗室外牆是由鈦合金製成，可以有效的防治導彈襲擊，但主要目的還是為了實驗的安全，在這個位於地下的高度機密研究所裏，一間高度戒備的四號實驗室裏，一名研究員正在檢查黑色神秘藥水的化學成分，*作過程完全由機器人完成，*作員隻能通過遙控手柄來*作機器人，即使藥水灑落也不會造成什麼危害，研究員正在將黑色藥水裝入壓縮瓶中，在*作過程中研究員十分小心，生怕在真空環境中進入一絲空氣，造成黑色藥水揮發，一旦出現這種情況，研究員就會被隔離，情況嚴重的就會被滅口。研究員成功的將黑色藥水裝入了壓縮瓶中，不知道什麼原因，研究員突然發出了一聲慘叫，瞬間化作一股黑煙消失不見，工作台上灑落著破碎的壓縮瓶碎片，被看守的警衛發現後，一邊向上級報告，一邊向鐵門逃跑，隻聽警衛大聲慘叫，也和研究員一樣瞬間消失的無影無蹤。警報響起，秘密研究所迅速陷入恐慌，男男女女四處逃竄，設備器材散落一地，紙張文件上下紛飛，電梯擠滿了人，突然“轟隆！”一聲巨響電梯墜毀，研究所裏的所有研究員就在這聲巨響後，全部消失，留下空蕩蕩的實驗室，散落一地的設備器材和文件。
在一個晴空萬裏的早晨，在新世紀豪華別墅裏，孫哲明正在跟隨著悠揚的音樂和月兒一起翩翩起舞，突然出現了一位身著黑色西裝，一頭白發，年齡大概在60歲左右的老人正在一旁為孫哲明和月兒打著拍子，孫哲明看到是張教授來了，就關掉了音樂，月兒隻好回到房間看電視去了。
孫哲明：“每次您都神出鬼沒的，吧，這回您找我有什麼事呢？”
張教授：“你知道生化武器嗎？”
孫哲明：“你是造價昂貴，製造繁瑣的生化武器嗎？”
張教授：“沒錯，就是如此，生化武器也就是生物戰劑，你要十分了解，這會對你有好處，因為黑衣使者正在秘密製造它！”
孫哲明正要問明原因，張教授再次消失。孫哲明打開電腦開始搜索黑衣使者的下落，孫哲明不敢相信自己的眼睛，一個黑色煙霧籠罩著整個地球，孫哲明覺得很不正常，耳畔回響起張教授的話“你要十分了解，這會對你有好處……”於是孫哲明開始搜索有關生化武器的詳細資料“生化武器可呈氣、煙、霧、液態使用，通過呼吸道吸入、皮膚滲透、誤食染毒食品等多種途徑使人員中毒；持續時間長，毒劑汙染地麵和物品，毒害作用可持續幾小時至幾天，有的甚至達數周……”此時孫哲明更加確信黑衣使者此次的行動肯定與他有關，看來黑衣使者迫不及待的想要得到時空穿梭技術，孫哲明決定再去會會這位老朋友。
孫哲明知道此次行動的危險性，決定不讓月兒跟隨，月兒顯得很懂事，沒有繼續糾纏孫哲明－－白洞開啟，來到哈克什開闊的地下秘密研究室，發現在入口處的地板上躺著一個身著黑衣，年齡大約在二十歲左右的青年人，“這不是黑衣使者嗎？”孫哲明感到很意外，連忙用手表型電腦掃描，發現這個黑衣使者不是機器代理人，而是真正的黑衣使者，顯然黑衣使者早在一個小時前就已經死去，手裏還緊緊握著一台掌上電腦。
孫哲明從黑衣使者手中拽出掌上電腦，仔細查看後，掌上電腦顯示“警告，濃度已超標！”隻見一團黑色煙霧從天花板的排氣管飄散，出現在孫哲明眼前，原本已經死去的黑衣使者從地上爬了起來，渾身上下飄散著黑色煙霧，雙眼發著紅色光點，孫哲明從沒見過如此強大的黑色毒氣。
“既然不好對付那就避開吧！”孫哲明立刻啟動瞬間移動，來到四處掛滿顯示器的監控中心，孫哲明調取實驗室在前些天拍攝的監控錄像，一段觸目驚心的視頻引起了孫哲明的注意，看來是由於實驗的一次失誤造成的研究員被一團黑煙包圍，慢慢的進入他的體內，而後便化作一股黑煙消失得無以無蹤。
如果黑色煙霧突然出現在自己麵前，就會立刻被黑色煙霧幹掉，“難道就沒有消滅它的方法嗎？”孫哲明繼續用手表型電腦搜索解決方法，“黑色煙霧會受到天氣影響，改變方向和濃度……”孫哲明看見這條消息後，才明白黑色煙霧是通過空氣進行傳播，而且還會通過風的方向四處擴散。