但是在這個世界之中，賢者之石是被賦予了無視“等價交換”原則並可以煉成任何物質的法術的增幅器，賢者之石又可以稱為紅藥液、哲學者之石、天上之石、大煉金靈藥、赤之究極物質、第五實體。
但是它的製作原料是活人，準確的說是人的靈魂。
賢者之石其實是由活人的靈魂經過煉成陣而煉成的紅色石頭，根據煉成方法，被煉成人數，和煉成者的技術，賢者之石會以不同的形態出現，可以使固體，也可以是液體。賢者之石的能量並非無限，具體視其濃縮的靈魂數量而定。
【原來如此，那麼那時候在王宮中的事也明白了：克賽魯克塞斯王建了一個煉成賢者之石的煉成陣，而且看這個靈魂的數量，估計是覆蓋了整個克賽魯克塞斯王國。】
迦南看著身邊不斷哀嚎的克賽魯克塞斯人靈魂，歎了口氣。
【至於原因，估計是為了長生不老吧。從“瓶中的小人”霍蒙克魯斯那裏得到的知識，之後就用全國的人民的靈魂煉成賢者之石得到長生不老，真是殘酷的家夥，把自己的國民完全不當回事啊。】
【不過，我現在可沒功夫想這麼多呢，現在看看能不能從這個賢者之石中脫離開吧。】
迦南看著周圍的靈魂漩渦，這些東西除了吵鬧一點之外對她完全沒有影響。
【先觀察一下這個賢者之石的宿主，如果好說話的話，就不用我費力了。】
迦南揮動起手指，接著一個個玄奧的符文從她的靈魂之中飄離出來，組成了一個暗紅色的法陣。
【不過，這種可能性真是不大啊……開始吧，靈魂的交流。】
——賢者之石外——
馮·霍恩海姆跋涉在沙漠之中，他已經快幹渴而死了，雖然他也知道，自己是不會死的，至少在體內的那個東西消耗完之前是不會死掉的，那個讓他痛苦的東西……
那是一塊賢者之石，由克賽魯克塞斯王國一半的人民的靈魂煉成的，包含著五十三萬六千三百三十條人命的賢者之石。
在那個已經銘刻進霍恩海姆的靈魂內的噩夢的晚上，克賽魯克塞斯王為了長生不老而建立了覆蓋著整個克賽魯克塞斯王國的煉成陣，然後就在他以為自己成功的時候，卻不知一切隻是“瓶中的小人”霍蒙克魯斯為了離開燒瓶獲得自由而設的的圈套。
霍蒙克魯斯利用他體內的霍恩海姆的血打開了真理之門，之後將整個克賽魯克塞斯王國的人們全部煉成了賢者之石。
原本繁榮昌盛的克賽魯克塞斯王國在一夜之間覆滅了。
之後，霍恩海姆逃離了克塞姆克塞斯，逃離了原本繁榮，現在卻淪為死城的故鄉。他害怕呆在那裏，因為一旦寂靜下來，他就會聽到自己體內那些靈魂的哀嚎，這些折磨得他快要瘋掉了。
來到這個沙漠之中已經快要三天了，他曾經聽說過在克賽魯克塞斯王國的東方是一個遼闊的沙漠，穿過沙漠後就會來到另一個國家，那裏是他的目的地，他希望在那裏找到解決自己身體內的賢者之石的方法。雖然他也知道自己的這個想法實在是太天真了，他在那個晚上也進入了真理之門，他也獲得了真理，但是在他所了解的真理中，除了將賢者之石內的靈魂完全消耗幹淨之外，就再也沒有其他的方法了。
不過，霍恩海姆不會放棄，他一定要找到一種方法，讓自己的同胞們得到解脫。
不過，在這之前，他還是沒有抵過幹渴對他的侵蝕，他跌倒在地上，他知道自己不會死，但是這種感覺還是很糟糕。他躺倒在地上，一陣黑暗向他襲來，很快就吞沒了他的意識。
接著，他的眼前就出現了那個已經見過很多次靈魂的漩渦。不過這一次就出現了不同的東西：一位盤坐在一個暗紅色煉成陣中的，渾身散發著銀亮色光芒的銀發女孩子，她的樣子與她周圍的的那些哀嚎著的靈魂格格不入。不過看起來她對於霍恩海姆的出現十分驚訝。
就在霍恩海姆驚訝的時候，女孩開口了：
“原本我以為會是克賽魯克塞斯王，不過結果出乎意料呢。”
女孩露出了笑容。
“來聊聊吧，賢者之石的宿主。”