惡貫滿盈命喪巢鴨絞刑架
1945年8月15日，日本宣布無條件投降，第二次世界大戰結束。
9月11日，盟軍司令麥克阿瑟下達了逮捕戰爭罪犯的命令。19日，盟軍司令部又命令日本政府，將以荒木貞夫為首的11名戰犯嫌疑人逮捕並關進巢鴨監獄，其中有曾任天皇侍衛和關東軍司令的本莊繁大將。本莊繁得知消息後立即自殺身亡。
所有重要的戰犯都收容在東京巢鴨監獄，這裏還關押著大量的被俘官兵。在巢鴨監獄，重要戰犯每人獨居一室，房間長8.5米，寬5米，高10米，配備有桌子、衛生間，地上鋪著稻草墊。其他戰犯二至六人同居一室。
土肥原住進巢鴨監獄之後，就享受了重要戰犯的待遇。對於戰犯來說，這並不是什麼好事。這往往意味著他犯下了比別的戰犯更嚴重的罪行，要為之付出更大的代價。
室內衛生由戰犯自己打掃，看上去倒也幹淨整潔。牢房的燈晝夜不熄，美國憲兵在走廊裏不斷走動，見有人躺下，就走過來用棍棒敲門或用腳踢，還打開外麵的鐵絲門，以防不測。
按照《波茨坦公告》的原則，蘇、美、英三國外長於1945年12月在莫斯科通過了《莫斯科會議協議》，規定盟國駐日最高統帥部應采取一切必要措施，確保協議中有關日本投降及占領和管製日本的各項內容得以順利實現。
經過中國、蘇聯、美國、英國、法國、澳大利亞、加拿大、新西蘭、荷蘭等九國的反複磋商，達成協議，決定將日本首要戰犯交由上述九國代表組成的國際軍事法庭進行審判。此後，印度和菲律賓代表也加入，遠東國際軍事法庭遂由這11個國家的代表組成。
根據莫斯科外長會議協議，盟國駐日最高統帥麥克阿瑟於1946年1月19日發布特別通告，宣布在東京設置遠東國際軍事法庭，並於同日批準了《遠東國際軍事法庭憲章》。
憲章規定，法庭有權審理三種犯罪：（甲）破壞和平罪；（乙）違反戰爭法規及慣例罪；（丙）違反人道罪。國際軍事法庭以審理甲級戰犯為主，乙、丙級戰犯交由受害國自行組建法庭審理。
在遠東國際軍事法庭長達兩年半的整個審理過程中，土肥原的聲音隻響起過一次，他為自己辯護了幾句。從此以後，他便緘口不語。
令土肥原不安的是，中國公訴人開始提出一項對他的新的指控。這就是：
土肥原在日本侵略者中率先提出，使用麻醉品作為侵略武器征服被占領國人民，而不是流血的征服。
這是土肥原的主張，但他沒有想到公訴人會這麼快就掌握證據，並且把他作為始作俑者。
在土肥原看來，這種獨特的侵略“武器”的大量使用，使得日本在被占領國展開了另一場戰爭。這場不流血的戰爭發生在鴉片和海洛因煙館，沒有呻吟，沒有痛苦，也沒有血腥，一切都在不知不覺中進行。
審判進入了第二個階段，土肥原才真正緊張起來。為什麼他當帝國間諜時所從事的陰謀、挑釁甚至是謀殺等幕後活動都沒有使他如此緊張，而他作為一個戰場指揮官的活動卻讓他如此不安呢？
答案很簡單，土肥原活動的第一階段僅僅是為日本軍國主義犯國際性滔天罪行作準備，而第二階段則是日本軍國主義分子把德國發動的歐洲戰爭變成世界大戰的時期，這時土肥原是實際執行陰謀分子的計劃。