另外，他們還在頭蓋骨的頭部與臉上發現了雙晶，這是由於衝擊引起的晶體耦合，這意味著頭蓋骨是利用某種衝擊力加工而成的。至於古人究竟采用了什麼方法和工具，至今還是一個謎。
另一方麵，玻璃工藝品專家摩雷認為，要想從整塊水晶切削、加工出像水晶頭蓋骨那麼精巧的工藝品，在技術上是完全不可能的，加之在完成的頭蓋骨上看不出使用任何工具的痕跡，由 此，推斷這個“水晶”頭蓋骨實際上是用玻璃製造的。
他說：“玻璃起源於公元前2000多年前的美索不達米亞， 1200年左右，玻璃的加工技術傳到了埃及，公元前300年左右，在中國出現了彩色玻璃珠。因此，公元前1600年瑪雅文明很可能已掌握了玻璃製造技術。”
但是，其他專家認為摩雷的說法缺乏充分根據，特別是瑪雅時代的水晶頭蓋骨不能與上述玻璃製品等同而語，因為它唯有用近代剛開發出來的晶體玻璃製造工藝才行。如果是幾千年前用玻璃加工法製成的水晶頭蓋骨，它經過這麼長的歲月肯定要褪色泛黃，失去透明度。
然而這個水晶頭蓋骨至今還閃爍著令人難以置信的晶瑩光澤，如果對著太陽光，它還會放射出七色的彩虹，如果對著燭光，則發出令人恐懼的紫光。
更驚人的秘密
研究人員發現，如果讓人凝視水晶頭蓋骨發出的紫光30秒到1分鍾，大部分人會進入不可思議的催眠狀態，由此推斷這個水晶頭蓋骨可能是瑪雅祭司或巫師用來在催眠狀態下與亡靈進行“交流”的工具，而裏希特博士認為這是利用催眠術進行疾病治療的工具。
首先，裏希特博士曾用它對患者施行催眠術，不用注射麻藥就成功地進行了牙齦手術、接骨和腫瘤切除手術，患者在手術中除了流一點血外，絲毫沒感到疼痛，特別是對於不能麻醉的特殊體質的人，通過這樣的催眠術就能進行手術。
其次，裏希特博士從眾多木乃伊的頭蓋骨上發現了做外科手術的痕跡，由此他推斷在古瑪雅和印加文明時代曾進行即使在近 代醫學上都感到非常困難的腦外科手術。那就是用這個水晶頭蓋骨讓患者進入催眠狀態，然後用殺生石施行隻是少量出血而不感到疼痛的手術。
根據這一新的假說，原來用作殺生祭神的那塊石台是瑪雅人為了祈求長生而進行心髒移植或內髒手術的石製手術台。事實上古代的許多超文明都是現代觀點無法解釋的。
發現其他的水晶頭蓋骨
在當今世界像這樣的水晶頭蓋骨還發現了幾個，其中3個較為著名，除黑吉斯發現的這個贈給美國民族博物館外，還有兩個分別收藏在大英博物館和巴黎郊外的夏洛宮人類博物館中。
大英博物館藏的被鑒定是屬於“古代墨西哥”。夏洛宮人類 博物館藏的是大約為真人頭骨的一半大小的水晶頭骨，法國專家認為是阿斯特克人在14世紀或15世紀時製作的。這3個水晶頭蓋骨中，尤以美國民族博物館藏的最為精致。
這些超乎人們想象的水晶頭骨究竟出自何人之手？如何製作的？製作的意圖到底又是什麼呢？至今仍不能被我們現代人所理解。