這段時間，已經為人族做了數件大事並且將人組織裏的蒸蒸日上的神農又遇到了一個麻煩。
原來，神農突然發覺到大部分人族食用野獸而肉，長此以往，則會使肌體出現了病症，而即使隻是小病，也因為無人懂得治療法術，而深受病痛折磨，痛苦不堪，甚至最後病越來越重，最終一命嗚呼。
說起來，這種情況其實神農早就是知道的，但是卻一直沒有什麼辦法，但是突然一日，神農不知為什麼，確實沒有絲毫道理的感覺到，解決這個問題的時機到了，也許，他可以找到辦法了。
隨機，神農就陷入了一陣沉思之中。
經過數月時間的思考之後，終於，神農想到了辦法，他決定，要將世間一些具有奇特效力而且並不太稀少的事物的種種性質研究出來，從而找出一種係統的可以讓凡人自己給自己醫治的辦法。
隨即，神農就決定離開人族中心，開始到深山老林，去尋找各種藥物，醫治百姓。
神農離開部落，開始了尋找藥草的旅程。
這一次卻是不同於上一次尋找五彩九穗穀，一路上卻是困難重重，亦是危險重重。
神農在這嚐百草的過程之中，數次瀕臨死亡，但是他並沒有被眼前的困難所嚇倒，依舊不改初衷，一路從北往南而行。
終於，三千年之後，神農完成了嚐百草之旅，回到了首陽山下，在稟明人族三祖之後。便開始一邊治理人族，一邊編寫《神農百草經》。創立醫學，萬年之後。《神農百草經》完成，醫學建立。
如此之後，神農向著整個人族傳授醫術，使得人族的死亡率大大的降低了下來。
就這樣，又是一段時間過去了，這一日，神農在位滿三萬年，終於功德圓滿。
就在這時，薑水流域一時之間紫氣東來三萬裏。瑞氣千條，紫氣彌漫，昊天與女媧還有老子來到，老子說道：“人主神農氏接詔敕。”
神農連忙出屋，跪倒在地，隻聽天空之中傳來渺渺仙音：
今奉天道敕命封為神農為人族地皇，秉持火德，為炎帝，往居火雲洞修行。不染因果，萬劫不滅。爾其欽哉！”
頓時，天機轉動，命運長河徒起波瀾。一道功德金光降下，神農的修為飛速的增加著，竟是一直達到了第三屍將斬之境這才停了下來。而且因為神農功德深厚的原因，向來以後的修煉也要比鎮元紅雲等人要簡單上許多了。
功德金光化為一輪金輪。投射無量光輝，此光無形無色。橫掃洪荒人族，人族不見其光芒，不見其色彩，卻從心中升起一股對地皇神農氏的無限崇敬，對炎帝大德的由衷感激，一時之間，不由悲從心中來，哭哭啼啼哀號炎帝離去，世間又失去一位賢者聖人。
就在這時，突然，昊天的聲音緩緩響起，人族天地二皇以立，人皇不久已將現世，此為吾為人族所煉聖器，得其認主者，可謂人皇。
說到這裏，一道金光從天邊飛來，直接插在了神台之上，正是一把金光閃閃上修山河日月人族百態的神劍。
……
時間匆匆而過，轉眼間，就是十幾萬年，而終於在此時，人族又誕生了足以繼任人族共主之位，有資格在那聲劍台上接受神劍檢驗的人物，但是很意外的是，這樣的人物，竟是一次出現了兩個。
這兩人一人名軒轅，一人則明蚩尤，連個皆有大才，都將各自的部落發展的蒸蒸日上，其中，軒轅所在的部落的的生活水平要更好，而蚩尤所在部落的戰鬥力則要更勝一籌。
原本這也沒有什麼大不了的，隻要讓軒轅劍考驗一番，之後則誰為主誰就成為人族共主也就是了，可是卻沒想到，兩人都通過了軒轅劍的考驗，因此一時間，軒轅劍卻是並沒有做出選擇。