21世紀，地球上的人們開始遠離戰爭，逐漸走向和平，而此時，在外太空的一個隕石向地球飛來，在大家建設和平時期，殊不知，大變動開始了！
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在東京灣，建設好的TPC總部緩緩打開入口艙，將飛燕一號放出，調查隕石掉落的地點，並取回隕石。
蒙古草原上，大地突然一片震動，冒出一個幾十米高的怪獸，在夕陽下顯得似乎十分興奮。飛燕一號上，麗娜張大嘴巴，問道：“那是什麼？”大古也問道：“這是什麼怪物？”這正是沉睡了三千萬年的超古代怪獸哥爾讚。哥爾讚沉睡的太久了，在戰火連天的超古代，不可能有那麼寧靜的天地，於是興奮的想活動一下。麗娜大聲的說道：“不好，怪獸朝村落去了，我們要阻止它。”“用信號彈嚇嚇它。”於是操縱飛燕一號朝怪獸飛去。“坐穩了！”“噗噗～”兩顆信號彈發射出去，然後往天上九十度飛行。哥爾讚看見漫天的煙霧，又沒有敵人的蹤影，在超古代的生活經驗，令它第一個念頭就是先躲起來再說。於是在地麵上挖個洞，跑了。大古和麗娜見怪獸跑了，也駕駛著飛機，回總部。
“這就是那顆隕石？”“裏麵好像包著什麼東西。”麗娜看了下，似乎有什麼東西在裏麵。在激光切割器的切割下，一個錐形的金屬體出現在隊員們的眼前。忽然，“嘀～”的一聲，將所有人嚇得後跳一步。金屬體打開一個口子，透出一個人的圖像，正是幽憐的圖像，幽憐說道：“後代們，你們好，我是前地球警備團團長幽憐，當你們收到這個時光機的時候，大變動將要來臨，而度過這次災難的方法，找到有巨人的金字塔，將巨人複活，複活方法是～～”隻聽見一陣噪音傳來。聽到幽憐的話，一個個麵麵相覷。而後，又傳來那包裹時光機的泥土是3000萬年至2500萬年前的，大家更是驚訝，又有美爾巴的登場，更是堅定大家的想法。
在路上，掘井不由抱怨道：“衛星拍不到，怎麼可能有金字塔呢！”新城也說道：“不知道，找找看吧！”
這天，哥爾讚從地底鑽出，一聲咆哮，向一個地方破壞而去，美爾巴也出現了，不過，它是直接飛上天，以飛快的速度，從美國飛來。TPC總部內，一時間也得到了怪獸出現的消息。令大家奇怪的是兩個怪獸似乎在尋找什麼。野瑞立刻想到金字塔，在電腦上計算怪獸的路徑交彙地點，道：“我知道了，在這裏。”利用衛星，將圖片拍攝在屏幕上。居間惠立刻說道：“快，通知副隊長他們，進去金字塔。”
大古在一進入山穀內，就發現有人在叫他，可仔細一聽有沒有，就這樣，一直朝著聲音的方向尋找。終於，在過了橋之後，聲音更清晰了，立刻衝著去找。而崛井追著他大聲問道：“大古，你怎麼了？大古，回來，哎呦！”情急之下就摔了一跤。新城從後麵追上來，問道：“你沒事吧？”“沒有，走，繼續找吧！”崛井站起來拍拍屁股，回答他的問題。“滴滴～”一陣通訊聲想起，崛井打開通訊器，道：“我是崛井。”“馬上跟著大古隊員，那裏有金字塔。”居間惠麵帶嚴肅的說著。崛井不由睜大眼睛看著大古跑去的方向。愣了下，立刻回答：“明白！”就追著去了。