說起來，這次的恐怖襲擊，還有一個十分八點檔的起因。
首先是西蒙斯，作為美國首席安全顧問，這個老家夥沒少和恐怖分子和黑幫打交道，在這個過程中，結識了專門倒賣情報賺錢的專業間諜艾達王，兩人本來是合作關係，可是奈何艾達女神魅力無限，不但迷倒了小帥哥裏昂和現實中的大批玩家，就連這個位高權重的西蒙斯也沒能抵擋她的魅力，對其癡心一片。
可是艾達王對這個老頭子並不感冒，西蒙斯個老屌絲隻能天天對著照片自己擼（事先聲明我沒見過，隻是根據劇情的一點合理想象……）可就在這時，他手下的首席研究員，也就是另一位BOSS卡拉的研究獲得了新的進展，她通過將T維羅妮卡病毒與G病毒相結合，研發出了一種威力強大，進化迅速，而且還能最大程度保留宿主理智的超級病毒，也就是本作中出現的C病毒，靠這種病毒，不但能造出強大的生化怪物，甚至還能改變人的基因，讓其通過化繭重生，完全變成另一個人！
這個研究成果本來具有十分強大的戰略意義，但是西蒙斯聽到後，第一反應不是利用這牛B朝天的病毒製造生化武器，而是被那個改變基因的效果吸引了。
如果我能把人的基因改變，是不是就能造一個艾達王出來？
本著這變態的思想，老西蒙斯開始了創造活體充氣娃娃的計劃。可是這東西難度太大，需要宿主與目標的基因吻合度很高，一連試了好幾次都沒有成功。最後一次偶然的機會，西蒙斯發現，原來卡拉博士的基因，就與艾達王非常吻合！
這真是踏破鐵鞋無覓處，得來全不費工夫！西蒙斯騙卡拉參與實驗，而這個卡拉居然還真就同意了！
說起卡拉，這也是個挺悲劇的女人，作為一個把生命奉獻給科研的女博士，在別人的眼中，她可能是一個與愛情無緣的老處女。但是實際上，她一直沒有戀愛結婚，整天泡在實驗室裏的最大動力，並不是對科學的熱愛，而恰恰就是一個懷春女子對愛情的渴望！
沒錯，這個卡拉，其實深深愛著西蒙斯！為了西蒙斯，就算用自己的身體試驗都心甘情願，但是她沒想到的是，西蒙斯竟然是為了私欲將她改造成了另一個女人！
試驗成功了，不隻是外貌，卡拉就連思維和記憶都被西蒙斯做了手腳，竟然真的認為自己是艾達王！
但紙終究包不住火，卡拉那被篡改的記憶出了問題，她竟然想起了實驗的真相，雖然思維還有些混亂，但是她對西蒙斯那畸形的愛，最終變成了無邊的恨意。
卡拉開始背著西蒙斯做自己的生化研究。她的心裏有了一個新的目標，要毀掉西蒙斯努力構建的世界，要毀掉整個世界！
因此，簡單來說生化6的劇情梗概就是這樣的
西蒙斯（boss之一）得到了C病毒，經過調查，得知威斯克之子，傑克穆勒（主角之一），天生帶有抵禦一切病毒的抗體，所以在2012年，以政府的名義派遣特工雪莉（主角之二）去東歐尋找傑克，試圖同時掌握病毒和抗體
同時卡拉（BOSS之二，艾達王的克（和諧）隆體）暗中成立了新安布雷拉公司，在東歐發動了恐怖襲擊，害死了克裏斯（主角之三）和皮爾斯（主角之四）的隊友，兩人因此開始追蹤卡拉。
同時卡拉瞞著西蒙斯派遣自己研發的變異怪物捕縛者（BOSS之三）抓捕了傑克和雪莉，並暗中帶到位於中國蘭祥市的秘密試驗基地。
經過了為期半年的研究，靠著傑克和雪莉的基因，卡拉強化了C病毒。不但研發出了3支威力無比的強化型病毒劑，還製造了一隻無比恐怖的生化武器，可以幾天之內向全世界散播病毒的混沌喪屍（BOSS之四），藏在蘭祥市的海底實驗室。
此時時間到了2013年，美國總統試圖向世界公布生化病毒的真相，西蒙斯為了阻止他，在高橡樹市發動了恐怖襲擊，害死了美國總統，並嫁禍給總統身邊的兩位特工裏昂（主角之六）和海倫娜（主角之七）。兩人為了追查此事，開始追蹤西蒙斯。
同時，卡拉聯係了真正的艾達王（主角之七），炫耀般的對她透露了恐怖襲擊的計劃，艾達王追查到卡拉的動向來到蘭祥市，同時還告訴了西蒙斯卡拉的暗中動作。西蒙斯怒火中燒，一路追到中國蘭祥市。裏昂和海倫娜也尾隨而至。