學園都市是麵積占據東京都西部的三分之一的都市，居住著230萬人口，其中八成（180萬）以上是學生，科學勢力的代表。擁有世界上最尖端的科技，一般認為領先外界約30年。學園都市的由統括理事長亞雷斯塔·克勞利花費50年的時間創建，由「統括理事會」全權管理。由於技術、研究多數都是高度機密事項，學園都市內的警戒體製非常嚴格，對人員進出有嚴格的限製。學園都市一個由二十三個學區構成的巨大的教育機構的集合體，以發掘超能力而提供特殊的教育課程，主要靠從外部招收學生。除了教育機構，還有麵向學生研究設施，生產、商業設施，國際展示場，國際機場等等在都市內生活的所需要的生活設施都齊備。學園都市雖然與外部隔離，但是在某些特定時段會向社會公眾開放。學生家長及社會人士可以在這些時段裏進入學園都市進行參觀，而且還有現場電視直播能力者互相戰鬥的場麵！現在已經明了的“特定時段”有：大霸星祭（9月19日到9月25日）和一端覽祭（時間不明，大約在10月末11月初的樣子）。學園都市的學生，大部分居住在學校的宿舍中，並在各個學校中接受能力開發。學園都市的學生大都借由藥物、催眠術與通電刺激等方式取得超能力。有各種類型不同能力，以範圍和威力分為無能力者（Level0）、低能力者（Level1）、異能力者（Level2）、強能力者（Level3）、大能力者（Level4）、超能力者（Level5）、絕對能力者（Level6），實際絕對能力者隻是理論上存在進化為Level6的可能，並沒有哪一個角色成功進化為Level6。並每隔一定時間會進行身體檢查，重新測定一次，但學生中的六成是無能力者，而學園都市中超能力者也隻有七人。學園都市內不存在警察，隻有風紀委員（Judgement）和教師自願參與的警備員（Anti－Skill）維護治安。另外還有直屬學園都市上層的暗部組織，是“光明”與“黑暗”並存的城市。
學園都市中的地下組織，數據庫有記載的至少五個，為各自目的而行動。直屬統括理事長亞雷斯塔或統括理事會。任務是進行“無法向外界表達的事”，包括暗殺、滅口、消除資料和鎮壓等。
這絕對不能算是個好地方不是麼？
而其中絕對能力者進化計劃更是黑暗
學園都市能力開發的終極目標是「SYSTEM－成為宛如神明意旨一般降落凡塵的人」，為了更進一步靠近神而需要創造出超越人類的存在——絕對能力者（Level6），以超越人類的存在理解神明的意誌。為此誕生了「絕對能力者進化計劃」。經過“樹形圖設計者”精密演算，學園都市中的七名超能力者中隻有排名第一的一方通行有機會進化為絕對能力者（Level6），但是需要二百五十多年的一般課程訓練才能進化為絕對能力者（Level6）。因為沒有能使人能夠活二百五十年的方法，因此“樹形圖設計者”有找出了另一種方法，那就是利用實戰來促進能力的增長，即準備好特定的戰場，讓戰鬥依照計劃進行以掌控“實戰中能力增長”的方向性。根據“樹形圖設計者”的演算結果，製藥準備好一百二十八種戰場將超電磁炮殺害一百二十八次，一方通行便可以進化為絕對能力者（Level6）。但是因為無法準備一百二十八個超電磁炮，所以實驗將目標鎖定在同時期進行的「能力者量產計劃」中的“妹妹們”，由於量產型的“妹妹們”具有的能力不及其素體超電磁炮的1%——也就是「Level2」的程度，因此根據“樹形圖設計者”的演算結果，隻要準備好兩萬種戰場及兩萬名“妹妹們”也可以達到相同的目的。最初的9802項實驗在研究所內進行，而剩下的10198項實驗則需要在戶外進行，由於涉及到屍體處理問題，所以戰場集中在學園都市的第七學區