想起藥鋪老板奚落的話，李時珍回到家後，找來各種“本草”書，仔細研讀起來。
原來，《本草》是我國古代講藥物的書，所謂本草就是中藥材的代名詞。中藥材的種類繁多，鳥、獸、蟲、魚、金、石、草、木，很多都可以人藥，其中以草本類植物藥占多數，所以稱中藥材為本草，把描述中藥材的藥書稱為《本草》。我國流傳最早的藥書，是漢代的《神農本草經》。它總結了秦漢前我國人民研究藥物的成果，記載了365種藥物。從那以後到明代的一千多年間，本草有了很大發展，人們掌握的可以治病的藥物逐漸增多，分類也逐漸嚴密。南朝時期的醫學家陶弘景寫了一本《名醫別錄》，在原有《本草》的基礎上，補充了魏晉時期治病的常用藥物365種。唐朝的李靖、蘇恭等人，奉皇帝的旨意，參照前人的《本草》，又增新藥114種。宋朝的劉翰、馬誌編著的《開寶本草》，劉禹錫、林億編著的《嘉祐本草》，還增加了許多外國藥物。其他如《圖經本草》、《證類本草》、《救荒本草》、《食物本草》、《海藥本草》等，都從不同方麵有所增加。特別是四川名醫唐慎微編著的《證類本草》，采古今單方，收人經、史、百家書中的有關藥物達1558種，是李時珍的《本草綱目》問世以前最完備的藥書。
從《證類本草》問世到李時珍時代，經過了400多年。在這400多年中，藥物知識有了很大發展，醫家和民間新發現了許多藥物。並且，由於礦業生產的發展，還出現了許多礦物新藥。同時，由於我國對外貿易和航海事業的發展，從國外傳來了許多“番藥”。這些新藥在一些雜書上有些零星記載，但錯誤百出。特別是常常將兩種藥物當成同一種藥物，同一種藥物又有許多不同的名字，造成醫生開錯藥，藥鋪抓錯藥，因拿錯藥而害死病人的現象時有發生。
唐慎微的《證類本草》，這本在當時醫藥界公認的全書，仍然有不少錯誤。書中把葳蕤說成是枯萎，其實，這是兩種形態、藥性都不同的植物。葳蕤的葉子像竹葉，治虛熱燥咳及一切不足之症。枯萎的葉是對生的，開白花，可以治霍亂、痢疾。《證類本草》把虎掌、南星這兩個同種異名的藥物，當作兩種不同的藥物記載。陶弘景的《名醫別錄》中，把旋複花當作山薑。冠宗奭的《本草衍義》中，把卷丹和百合混為一談。又如，澤瀉這種藥，久用不行，但有的本草書上卻說：“久服麵生光，能行水上，”“澤瀉久服輕身，日行五百裏”。這些方士的鬼話，寫在書上，不知要讓多少人受害。
李時珍想，“本草”的混亂，造成藥物的混亂，即使我們的藥方開得再好，藥抓錯了，也照樣給病人造成危害。看來，重修“本草”的事情，已經刻不容緩了。特別是漏子事件，使李時珍更是非常激動。
一天晚上，李時珍想來想去，睡不著覺，就跑去敲父親的房門。李時珍想把存在心裏很長時間的問題和父親談一談。
李月池被叫醒了，披著衣服走出來。李時珍等父親坐下，不好意思地說：“爸爸，我有一件事情一直鬧不明白，我想問問您。本草既然有好幾百年沒有修過，為什麼就沒有人想到修一部新的?”李月池笑著說：“你就是為這個把我喊起來的嗎?”
李時珍不好意思地笑笑，說：“對不起，爸爸。可是我心裏實在很著急。爸爸，藥上又老是出毛病，本草不重編是不行了。”
李時珍父親問道：“你的意思是怎樣?”
“依我說，應該趕快修一部新的，把我們見識到的東西都給添上去，把前人講錯的都給改正過來。”李月池笑笑，說:“你不要把事情看得太容易了。編一部本草，必須把全國出產的藥物，都重新查訪過，那要花多大的人力財力，誰有那麼大的力量!”李時珍帶著懷疑的口氣問道：“那麼，唐人、宋朝人又是怎麼幹的？”
李月池打斷兒子的話，說：“你難道不知道，那是朝廷修的嗎？隻有朝廷才有這個力量。”
李時珍興奮地說：“那我們也去請朝廷修。”
聽了李時珍的話，父親沉吟了很長時間，然後說道：“修本草可不是一件簡單的事情。編一部本草，不僅要把曆代本草和諸子百家的書籍研究透徹，而且還要把全國出產的藥物一一重新考察清楚，需要花很大的力氣。同時還必須說服朝廷出麵才行。曆代4本草，大多是朝廷出麵修的。黃帝命令大臣調查百草藥效，定《本草經》。集注《神農本草經》、編著《名醫別錄》的陶弘景，原來就做過官，後來雖然隱居深山，但仍和梁武帝交往密切。唐朝時，唐高宗命令大臣李勤，組織蘇恭等人，在《名醫別錄》等藥書的基礎上，將4本草從三卷增加到七卷，寫成《唐本草》。宋太祖命令醫官劉翰重新樣校本草，宋仁宗再下詔命補注本草，這才有了《開寶本草》、《嘉祐本草》。所以，隻有朝廷出麵，才有重修4本草必需的人力、財力、權力。有的本草雖是以個人署名的，那也是因為這些人有錢有勢，受到過朝廷的扶持。像我們這樣的人家，曆史上還從來沒有人修成本草的，現在，誰能與朝廷說上話，你還是我?”