李時珍離開了武當山後，沿著襄河往南邊走，沿路東尋西訪，漸漸到達江南地界。一天，他們在沿江一個小鎮上等候班船，打算坐船到南京去。這時，李時珍無意聽到一個船家說起，南京藥王廟裏正在舉行三皇會，全國各地的藥材商人，都把本地出產的藥材帶到那裏去買賣。李時珍心中驚喜，告訴龐憲和建元：“這種事，還是嘉靖年間在北直隸的任丘舉辦過一次，已經有好多年沒有舉辦了，我們趕得真巧。”於是，他們決定馬上趕往南京，以免去晚了大會已經散去。
船到南京龍江碼頭後，李時珍上岸，雇了兩名挑東西的，到水西門去找客店住下。沿途果然聽見人們紛紛說藥王廟裏非常熱鬧。
李時珍三人趕到藥王廟，隻見廟裏廟外，東一個鋪麵，西一個攤子，都是做藥材生意的。有的門前一排排地擺著藥籮，上麵插著標簽，標簽上寫著藥名，什麼山陝麥門冬啊、廣東砂仁啊、泗州紫菀啊，山東百部啊，湖州前胡啊，河南貝殼啊，關東白薇啊，看也看得眼花繚亂。家家店鋪都擠滿了采辦藥材的人。廟門口的戲台上，有個江西班子在唱戲，又有本地人趕來做小生意的，十分熱鬧。
李時珍一家一家藥攤挨著看，一麵看一麵問，問過了又仔細比較著。
有時，李時珍高興起來，還要考考徒弟。他們走過一家大藥攤時，李時珍從一隻沒有標簽的藥籮裏抓起一把果仁，盯著龐憲看，意思是問他認識不認識。龐憲說：“這是大風子，氣味辛熱，產生南海。”“就這些?”李時珍笑了笑。
龐憲想了想，又說：“師父說過，熬出來就是大風油，可以殺蟲攻毒。”李時珍點點頭，說道:“記住，這才是最要緊的。”三皇會一連舉行了好多天，李時珍每天都到那裏觀看訪問，收集到不少藥物，也增加了不少知識。他們攜帶的大包小袋，都裝得滿滿的，李時珍帶的筆記本，每一本也都記得滿滿的。使李時珍非常高興的是，在這裏看到了不少新奇的藥物。有個老藥販，把新近才流傳起來的煉樟腦的方法也告訴了他。有幾個泉州商人，送了他一些外國藥材，什麼“乳香”、“沒藥”、“血竭”、“白豆蔻”，與國內的大不一樣。李時珍小心地裝了起來，準備回去仔細研究一番，將來在《本草綱目》裏介紹介紹。
他們一直等到三皇會結束了，才雇傭了一隻江船回蘄州去。
李時珍一走進家門迎頭就碰見了他的妻子。妻子見李時珍回來了，喜出望外地對著屋裏喊：“建方快來，你爸爸回來了。”家裏的人聽見，都跑過來了。院子裏一片歡聲笑語。
李時珍的妻子見他麵色黑黝黝的，胡子又白了一些，心裏不禁有點難過。她低聲說：“看你辛苦成什麼樣了！”
李時珍笑道：“我並不感覺到怎麼，我每天都吃得飽，睡得著。”
李時珍問了家裏的情況，喝過茶，就走過去打開衣包，取出筆記本.走進了書房。
李時珍曆時多年周遊四方，行路萬裏.雖然艱辛無比，但收獲很大，為他後來著述《本草綱目》，奠定了堅實的基礎。