火之國……
多年前……兩位絕世強者在一處山坳中進行了一場驚天大戰，那場大戰雖隻有兩人，卻硬生生的改變了那裏的地貌。最終他們兩敗俱傷，不久後隕世。那兩位強者，分別叫做“千手柱間”以及“宇智波斑”；而他們戰鬥的場所，被後人稱為“終結之穀”。而那穀地的不遠處，便是第一代火影“千手柱間”拚命守護的村落——木葉村。木葉村是千手柱間和宇智波斑共同聯合千手一族和宇智波一族吸納各個家族後與火之國達成協議而成立的。那是千手和宇智波的心血。但宇智波斑因其弟弟的死和一些人有意的挑撥，與千手柱間決裂，造成了以上大戰。木葉村後來的領袖“千手扉間”繼承了其兄長的意誌，在短短六年的建設中，開辦了忍者學校，創立了暗部，用一係列的方法將木葉打造成了忍界最強之村，同時也使木葉成為最祥和的忍村。這樣的木葉自然遭到了其他村落的嫉妒，於是，其餘四村聯合起來，想要擊垮木葉，瓜分其土地和資源。於是，第二次忍界大戰開啟。開戰後，二代火影千手扉間帶著木葉眾人奮力抵抗，硬是在四國的圍攻局麵下守住了防線。其本身在戰爭中更是身先士卒，為保護木葉新生力量身死於水之國前線。但因其戰績卓越，而水遁有被其實用的出神入化，因此得一諡號“水神”。而後，千手柱間的徒弟——猿飛日斬，在千手扉間臨死前的任命中，繼承火影的意誌，成為木葉的第三代火影。他為人親和，但對敵人異常狠辣，在忍者大陸上很快鑄就了威名——站在大地上就不會倒下的男人！至此，最然各村都在攻打木葉，但勢頭卻平穩了不少，木葉也獲得了寶貴的喘息時間。在此期間，木葉花大力，出大資，加快忍者學校的發展，希望能培養出新一代的優秀生力軍。並且，木葉還推出了上忍指導製，剛畢業的下忍可以收到上忍的指導，三人一組，這樣一來，同其他忍村相比，木葉的下忍可以獲得最優秀的資源。再說忍校，不僅是忍族的人，木葉同樣為常住居民的孩子和孤兒們提供了進入忍校學習的機會。而此時，木葉內大族呈三足鼎立之勢，分別是日向、千手和宇智波，三族互相比拚，爭相發展，使得木葉內外都暫時和平了。到此時，二次忍界大戰已至中期。
忍界……
在火之國正緩慢發展時，其餘四國因利益分配不均等原因起了內訌，第二代水影與第二代土影在戰鬥中同歸於盡，而後，各國取消了前期的聯合攻擊，改為各自為戰，自己攻打該自己打的地方，聯軍至此瓦解，進攻木葉的方式變成了協約聯合的攻擊。進攻的腳步更慢了。
因為各國在進攻木葉上的兵力減少，於是忍界因為他們的戰爭需要更亂了。許多國家在一夜間被滅，曾經因封印術聞名於忍界的漩渦一族也被雷之國的雲隱滅了族。
至此，各國的補給正在慢慢完善，新一輪的大戰也許就快開始了……
我們的故事從這裏開始…………………………………………………………………………………………………………
火之國，木葉……
今天對於許多家長和孩子是個特殊的日子，因為忍者學校一年一度的招生開始了，家長們目送孩子進入學校，而孩子們也充滿期待的開始了自己的忍校生涯。
但是，人群中有一個男孩子臉上卻帶著濃濃的悲傷，與入學的快樂氣氛格格不入。他的相貌一般，黑發黑瞳，臉龐也稍顯稚氣，因此也沒引起多少人的注意。他的名字叫做雲。他的父親是一個商賈，在四年前因貨物被強盜盯上被擄後去世，隻留下一筆豐厚的財產供星雨和他母親相依為命。那時他還小，自然感受不到喪父之悲，和母親在一起生活的也是有滋有味。他的父親和母親商量後沒有給他起姓氏，又因為兩人的共同愛好是看雲，所以起了這個名字。但五年來他母親為了照顧他也是過度操勞，全憑著信念在支撐著身體來撫養他，於是，在昨天聽說他被忍校錄取後，心裏一鬆，終於倒下了，而且再也沒起來。