1948年駐日盟軍總司令部經濟科學局民間運輸課發布禁止港口裝卸業務的專包及二次轉包，山口組港灣轉包事業備受打擊。1949年，田岡一雄擔任港洞會（碼頭工會前身）會長。
1951年7月、田岡一雄前往東映京都攝影所，拜訪鶴田浩二的經紀人兼鬆廉吉，要求讓鶴田浩二在山口組的興行部演出遭拒。1952年1月，鶴田浩二在大阪天王寺區的旅館遭山口組組員山本健一等人施暴的“鶴田浩二襲擊事件”震驚日本演藝界；同年，日本運輸省製定港灣運送事業法，廢除GHQ所禁止的港口裝卸業務的轉包，山口組再度活躍港口事業。
1953年山口組與本多會成為關西地區兩大黑道勢力相對抗，同年，山口組開始至九州發展；同年，山口組興行部改稱“神戶藝能社”，並舉辦“民辦二十大歌手演出”（“紅白對抗大賞”前身）的廣播節目。
1956年4月，神戶港二次轉包的業者聚集成立“神戶港港灣勞動組合連合會”，是由山口組相關企業加上15個獨立工會及440名勞動者組成。在這之前，神戶港的大型工會組織原本隻有由一次轉包的業者所組成的“全港灣勞組神戶支部”。同年7月，“小鬆島抗爭事件”爆發，山口組小天龍組組員與本多會係平井組組員，雙方發生衝突。事後，衝突事件擴大、本多會係的福田組、勝浦組介入。
1957年11月，小天龍組組長在小鬆島港遭福田組組員槍擊。山口組總部獲知即由地道行雄指揮結集組員115人赴德島縣福田組事務所舉牌示威，在半途便遭德島縣警隊攔截。之後在自民黨議員小西寅鬆的仲裁下，山口組與本多會達成和解。
1978年7月11日，三代目田岡一雄組長在京都市被鬆田組大日本正義團的組員鳴海清槍殺受傷，事後在山口組的各方施壓下，鳴海清在京都一單人宿舍內自殺身亡。1981年7月，三代目田岡一雄組長病逝。
四代目
1984年6月21日，在田岡邸的大廳，竹中正久與舍弟23人、若中46人的直係組長，進行杯事的鞏固。23日，人事底定，若頭為中山勝正、舎弟頭為中西一男、最高若頭補佐兼本部長為岸本才三，渡邊芳則、宅見勝、嘉陽宗輝、桂木正夫、木村茂夫各自就任若頭補佐。
1984年8月，在和歌山縣串本町的賭場，山口組幹部岸根敏春帶著人打死了一和會幹部潮崎進。因為這事件的發生，“山一抗爭”事件隨即爆發。之後，“一和會”勢力急速衰退，到了1984年年底，山口組組員數約14000人、一和會則隻有2800人。
1985年1月，四代目組長被打死，導致“山一抗爭”事件被激化，最後於1989年初，在會津小鐵會會長與稻川會本部長居間協調下達成和解，“一和會”被迫自行瓦解、四代目山口組結束。
五代目
1989年4月，“渡邊芳則”繼承五代目組長，山口組勢力範圍再度積極擴大。早期采納若頭“宅見 勝”的方針，避免和警方的對立、並合理的導入全國分區的區域領導製。
2012年12月1日中午，神戶市消防部門接到報警，稱有一位老人倒在家中。救護車趕到這戶人家家裏搶救時，發現這位老人是山口組第五代組長渡邊，發現他已經死亡。初步的司法診斷顯示，渡邊屬於病故。
六代目
2005年8月，“司忍”（本名“筱田建市”）繼承六代目組長，卻也因涉案於同年底收監服刑6年，組的營運暫時由“執行部”代理、並創設“幹部”役職。此時，山口組仍積極涉入關東的勢力版圖、吸收在東京活動的國粹會以對抗關東的兩大勢力住吉會及稻川會。
2009年10月，山口組新設“組織委員長”職務，山口組總本部的‘弘道會體製化、一本化’導向，同年11月，大阪府警方指名加強取締弘道會；隔月，日本警察廳的弘道會壞滅作戰方針展開。
2011年4月9日，日本最大黑社會組織山口組的“一號人物”筱田建市出獄後到達東京品川火車站準備返回位於神戶的家中。當日，筱田建市在東京出獄。筱田建市又稱“司忍”，他於2005年12月因非法持有武器而被捕入獄。