第三股力量黑暗勢力的介入，引起新人類和聯邦政府的高度警惕。
新人類的幾個偉大的人物代表新人類與聯邦政府進行了一次秘密談判，第二天，新人類突然在古人類視線中消失。
此後三年，聯邦政府積極清除社會中的黑暗勢力，在遇到棘手的事情時，總會有新人類和超級智能機械戰士的影子出現。
也許他們達成了某種默契，總之新人類再也沒有在古人類社會上大規模出現過，他們以普通人的身份居住在古人類中間。
經過漫長的歲月，地球上的生物開始了一次新的進化。
在人類中一部分人掌握了一種新的力量，這種力量被叫做暗能量。而在其他生物體內，同時有一些幸運的生物也擁有了這種力量。
擁有暗能量的生物被人們稱之為寵獸。
根據這些寵獸所具有的暗能量屬性和大小的不同，寵獸們被分為一到九級，每一級又分為上、中、下三品。
因為寵獸數量稀少，所以任何一隻寵獸不論級別高低都是很罕見的。
迄今為止，人類所發現最強的寵獸也不超過五級上品。每一隻寵獸孵化時就已經確定了級別，在以後的成長中，它的級別不會再出現任何變化。
但是每三年一出的獸王則不一樣，它會隨著主人力量的增長而發生變化，但是人力有限，曆史記載的最強獸王也隻能生長到五級上品。
寵獸因為具有暗能量而能和新人類達到某種程度的聯係，這種聯係被叫做合體。
合體後的新人類與寵獸會以一種特殊的狀況存在，一般是半人半獸，不但激發出了人類的潛能，增強了戰鬥力，同時人類也具有了一些隻有某些動物才能擁有的本領。
獨孤奇被四臂人族首領格魯亞帶到火盤星域的元火星，在此覲見即將陷入沉眠的火鴉老祖。在元火星的生死曆練中，獨孤奇身上沉寂已久的火鴉血脈被激活。獨孤奇堅定的心誌打動了火鴉老祖，將保護火鴉一族的重任交給了他，並送給他一個強大無比的寵獸卵。
遵照火鴉老祖的吩咐，格魯亞接著帶獨孤奇來到了火鴉族勢力的核心區域——統治之殿。同樣即將陷入沉睡的統治之殿的主人火鴉族八殿下宣布獨孤奇將接掌統治之殿，成為統治之殿的十殿下，這引起了火鴉一族眾多大人物的不滿。意識到自己弱小的獨孤奇抓緊一切時間拚命增強自己的力量，並收服了寵獸卵孵化出的神獸後裔九尾地蠍。
在沙丘之星，蘭虎和巨石一起兜售小樹精開發出的神聖藥劑的仿製品時，意外遇見一頭巨大的沙漠地龍襲擊血色要塞外出狩獵的強者。有瘋子之稱的白裏衝出要塞，和沙漠地龍展開激戰。在關鍵時刻，蘭虎挺身而出，幫助白裏爭取到了寶貴的晉級時間。白裏臨陣晉升為領主，最終擊敗沙漠地龍。
由於發生了沙漠地龍襲擊事件，龍科德曼將軍對血色要塞附近的敵對生物進行了一次大清洗。想要狩獵到蟲子，獲取源晶石，蘭虎不得不遠離要塞，深入沙漠。在一個綠洲中，蘭虎目睹了蟲族和沙漠鯰魚的廝殺。蘭虎準備螳螂捕蟬之時，卻不知已有黃雀在後，老冤家墨菲特猝然對他發動偷襲。