至此，江孜隻剩古城堡在藏軍手裏，榮赫鵬在讓他們撤出的最後通牒時間到後，於7月5日對城堡發起進攻，榮赫鵬先佯攻，把藏軍注意力吸引到西北角，隨後在半夜對藏軍發動奇襲，但被打退。天亮時6門英印軍火炮向藏軍猛轟，近百發炮彈落在藏軍陣地上，藏軍工事的石塊和泥土在炮火轟擊下騰起一團團煙塵，又拋落在地上。藏軍隻得伏在工事裏，英印軍隨即發起衝鋒，但剛一衝就被藏軍齊射的火力打退。英印軍發起第二次進攻，他們在馬克沁重機槍掩護下衝上藏軍陣地，與其白刃格鬥，攻占城堡東南角。但占領這個地方卻使英印軍被動，因為城堡上垂直射下的槍彈使他們無還手之力。
第二天，英印軍將炮彈由榴霰彈換成高爆炸藥的實心穿甲彈，炮手將炮彈一發發準確地射向目標，被炮彈炸飛的石塊幾乎遮住城堡東南角，城堡被炸開了缺口。隨後英印軍向缺口衝去，藏軍用巨石和火繩槍給英印軍造成很大殺傷，戰鬥陷入僵持。正在此時，一聲巨大的沉悶爆炸響聲傳來，原來一發炮彈擊中了藏軍彈藥庫。藏軍火力頓時減弱，英印軍趁機衝了上來，藏軍急紅了眼，脫光了上衣，兩眼噴著怒火，手中揮舞大刀，與英印軍肉搏。雙方大刀、長矛、子彈、刺刀在空中飛舞，不斷有人倒下，發出尖利的慘叫聲。藏軍傷亡慘重，英印軍將他們逼到了城堡邊——下麵是高100多米的懸崖。陷入絕境的藏軍大吼著，悲壯地集體跳下懸崖。在場的英印軍目瞪口呆。
在整個江孜抗英之戰中西藏人民的表現可歌可泣，康特來《拉薩真麵目》說：“幾十個人奮起猛攻比他們強大得使他們鬥爭絕望的敵人，拚死命地戰鬥到最後一個人倒下去，一小部分農民會為保衛一個村莊全體戰死，像古羅馬的愛國者那樣，曆史上再也找不到比得上他們的例子。”華達爾的《拉薩和它的神秘》說：“西藏人民的英勇是無可爭辯的，當我們的榴霰彈在他們頭上爆炸時，他們勇敢地保住陣地，沉著地向我們的大炮一槍又一槍還擊，一點鍾又一點鍾地支持下去。”
達賴得知戰敗後離開了西藏，去了外蒙古，他準備與沙俄聯係，因為仗打到這時，大清還毫無反應，他對大清徹底失望了。8月3日英印軍進入拉薩，狂熱的殖民主義分子正要吞掉西藏時，英國政府決定：吞並西藏還不成熟，榮赫鵬應簽訂利於英國的條約，然後退出西藏。於是榮赫鵬與西藏政府展開談判，由於西藏政府沒有電報接收設備，清政府對西藏的指示要通過談判對手英國轉交給西藏，這不能不說是巨大的恥辱。9月7日喪權辱國的《拉薩條約》簽訂，條約規定賠款360萬兩白銀，拆除一切防禦陣地，開放通商口岸，西藏資源不能給任何外國（給英國留著）。由於清政府代表駐藏大臣有泰沒簽字，條約簽訂後，清政府拒絕承認。1906年6月24日，雙方在北京簽訂新約，新約對中國的損害要小得多，防禦陣地不拆了，西藏資源也沒說不給外國，賠款減至25萬兩。1908年1月27日，英印軍撤走，江孜抗英之役結束。