此後三年，聯邦政府積極清除社會中的黑暗勢力，在遇到棘手的事情時，總會有新人類和超級智能機械戰士的影子出現。
也許他們達成了某種默契，總之新人類再也沒有在古人類社會上大規模出現過，他們以普通人的身份居住在古人類中間。
經過漫長的歲月，地球上的生物開始了一次新的進化。
在人類中一部分人掌握了一種新的力量，這種力量被叫做暗能量。而在其他生物體內，同時有一些幸運的生物也擁有了這種力量。
擁有暗能量的生物被人們稱之為寵獸。
根據這些寵獸所具有的暗能量屬性和大小的不同，寵獸們被分為一到九級，每一級又分為上、中、下三品。
因為寵獸數量稀少，所以任何一隻寵獸不論級別高低都是很罕見的。
迄今為止，人類所發現最強的寵獸也不超過五級上品。每一隻寵獸孵化時就已經確定了級別，在以後的成長中，它的級別不會再出現任何變化。
但是每三年一出的獸王則不一樣，它會隨著主人力量的增長而發生變化，但是人力有限，曆史記載的最強獸王也隻能生長到五級上品。
寵獸因為具有暗能量而能和新人類達到某種程度的聯係，這種聯係被叫做合體。
合體後的新人類與寵獸會以一種特殊的狀況存在，一般是半人半獸，不但激發出了人類的潛能，增強了戰鬥力，同時人類也具有了一些隻有某些動物才能擁有的本領。
上集回顧
寵獸學校的暑假到了，三年級以上的學生全部離開了學校。
在邱雷的幫助下，留在學校的蘭虎有幸來到了傳說中的新人類聚集之地——神鷹城。
為了湊齊邱雷下學期的學費，兩人在神鷹城開始辛苦奔波，四處推銷邱雷研製的能量轉換器。邱雷在神鷹城一家餐館中找了一份洗碗的工作，而蘭虎則在一個意外的情況下通過考核，參加了神鷹城舉辦的寵獸電子大賽。
相比即將舉行的七大洲八大新人類學校寵獸大賽，這個以電子模擬形式來舉辦的大賽更像是一次難得的熱身機會，因此不僅吸引了神鷹城的新人類少年，而且也吸引了來自四麵八方，身懷絕技，武功強悍的新一代寵獸戰士們。
一時間，神鷹城內風雲際會，雄心勃勃的新人類少年們為了獲得寵獸電子大賽冠軍各顯神通，展開激烈較量。意外獲得參賽資格的蘭虎選擇了卓風，數十年前古亞洲大陸偉大的寵獸戰士，作為自己參加寵獸電子大賽的英雄。本不引人注目的蘭虎卻一路過關斬將，一次次打敗被人看好的強者，不斷爆出冷門。
就在寵獸電子大賽開展得如火如荼的時候，一場危機意外降臨，一直潛伏在暗中虎視眈眈的新聯盟對寵獸電子大賽伸出了魔爪。為了增加黑暗勢力的力量，新聯盟在神鷹城暗中抓捕天賦較高的新人類少年，很多寵獸電子大賽的參加者也難逃厄運。
在危急時刻，寵獸電子大賽不得不停止舉行。因為麗麗雅突然失蹤，蘭虎展開了搜索，並一路跟蹤敵人，卻不慎遭到了敵人的伏擊，並被捉到了新聯盟隱藏在神鷹城中的大型飛船上。在船上蘭虎成功脫困，並救出同樣被囚禁在飛船上的朋友們。在即將逃出飛船的時候，新聯盟東方分部的新首領蜘蛛寵獸戰士貝妮卻突然出現在他們麵前……
在千鈞一發之際，黑豹女王羅蘭和神鷹城幾位頂尖高手及時趕到，扭轉了不利的局麵，貝妮被抓，一場風波終於平息了。