從一八九八年五月一日離開家鄉，到一九〇二年三月二十四日離開南京赴日留學，魯迅在南京生活了近四年。近四年的生活，使魯迅在自然科學基礎，西方近代新思想的吸取，整個中外文化修養的進一步提高等方麵，有了新的變化，眼界胸懷與學識，都非昔日可比。在南京時，他刻了兩顆圖章，一顆刻著“文章誤我，一顆刻著“戛劍生。周建人的解釋是：“意思是說，以前讀古書，做古文，耽誤了我的青春，現在我要‘戛的一聲拔出劍來參加戰鬥了。這一解釋基本合理，比較符合魯迅當時的思想實際。歐風西雨的沐浴，使他對自己過去的生活有了新的認識，新的知識天地的出現，自然對過去所讀也有新的體會。是的，僅僅局限在傳統文化中，不睜眼看別的民族的文化，在那樣的時代，不誤青春才是怪事；而在風雨飄搖的清末，不靠戰鬥——以知識之劍作為武器的戰鬥——顯然也不是熱血青年的應有衷腸。所以從那時起，他讀書的興趣開始從純故紙堆中鑽了出來，一方麵他開始廣泛吸收新的知識和思想，另一方麵他仍然沒有放棄研讀古籍，不同的是，他此時讀古書，認識的角度自然和以前是不大一樣了，思想自然要站得高得多。由於這一段時間，魯迅本人留下的資料極少，隻有極少的親友在回憶中或在日記中有所記載。因此，要完整地了解他此時買書的情況已不大可能，隻能勾勒幾個側影，以對本時期他購書情形有一輪廓性的了解。
周作人當時的日記，是目前最原始的魯迅在南京時購書情況的資料了。由於日記本身亦不全，所記也不是完整的。現摘抄如下，以資參閱。日記中的日期皆為農曆。
Δ一八九八年
十二月廿五日：“晨椒生叔祖自金陵回家，得豫亭（注：魯迅本來號叫豫山，因易被人叫做“雨傘，故改了一個字，初為豫亭，後又變成豫才）兄十七日函，雲要抄書格紙百……寄回畫報一本，《百鳥圖說》一本，《百獸圖說》一本，韋門道氏撰，廣學會出售，每本洋二角。
Δ一八九九年
九月十六日：“雨。伯文叔從金陵回來，帶回大哥函，並書籍衣服，目錄列下：官紗庫二條，石印《芥子園全集》三函十二本，《閱微草堂筆記》四本，《解學士詩》一本，《狀元閣執筆法》一本，《讀書樂》摹本一套八頁，《弟子規》摹本一套十九頁，以上四種皆狀元境李光明莊刊印本。
十二月二十六日：“雪、寒甚。上午大哥同椒生叔祖回家，帶回……浙江求是書院章程一本，《聖武記》一部十本。
Δ一九ＸＸ年
五月十五日：“晨伯文叔自江南歸，……交來大哥初十日函，並王漁洋《唐人萬首絕句選》一部二本，張伯行刻《周濂溪集》一部四本。
十二月三日：“上午同大哥往大街……大哥購《曲園墨戲》一本，《百衲琴對句》一本，板頗佳。
十二月二十八日：“下午同大哥往大街，購李長吉《昌穀集》不得。
Δ一九〇一年
十一月二十六日：“晨步至陸師學堂，同大哥閑談，午飯後回堂，帶回《世說新語》一部，雜書三本。
十二月十三日：“上午大哥來，帶來書四部。（這四部書，據周作人所記：為“鉛印的《包探案》及《長生術》，前者即柯南達利所著的《福爾摩斯偵探案》，在中國是第一次翻譯；後者係哈葛得所著蠻荒小說之一，原無作者名字，這是後來才省悟出來的。其三《巴黎茶花女遺事》，為林琴南譯本，那時隻署名冷紅生。又一種則是《農學叢刊》石印四冊，似是羅振玉所編印，其中有《蠶桑問答》、《牧豬法》、《烘雞鴨法》、《藝菊法》、《瀏陽土產表》等。）