科索沃政治製度的一大問題在於塞爾維亞族人沒有能夠融入到阿爾巴尼亞族為主要群體的科索沃臨時自治結構中去。這一問題在科索沃北部鄉鎮和其他塞爾維亞族居民占主體的居民點表現得尤為突出，這些地方已經形成了所謂的“平行結構”。聯合國安理會第1244號決議的授權沒有涵蓋塞爾維亞族人的平行結構，這一結構在科索沃憲法框架中也沒有體現。
戰爭結束以後，塞爾維亞族人相對孤立，他們留在了由科索沃維和部隊保護的飛地和科索沃北部地區（北米特羅維察）。當時的管理製度、警察機構、司法程序、教育事業和醫療衛生設施繼續運轉，靠塞爾維亞的經濟和組織援助——在此主要是貝爾格萊德科索沃問題協調中心——維持。隨著塞爾維亞政府開始在科索沃政策上積極起來，來自貝爾格萊德的物質和組織援助在2000年10月米洛舍維奇倒台以後還有所增長。這導致在很多領域，科索沃境內塞爾維亞族人居住的地區一直被排除在聯合國科索沃臨時行政當局特派團和歐洲安全與合作組織所建立的、為科索沃—阿爾巴尼亞族為主要族群的管理結構之外，塞爾維亞族人的平行結構構成了“剩餘科索沃”。
在管理、公安、保健以及教育和培訓（教育領域的平行結構詳見第5章）領域，塞爾維亞少數民族或者說科索沃北部的主體民族塞爾維亞族平行結構的存在最為明顯。由於貝爾格萊德方麵在工資和養老金的支付上給予了資金支持，塞爾維亞族的教育和醫療衛生事業得以維持。貝爾格萊德政府依然為科索沃的塞爾維亞族人簽發護照、駕照、汽車牌照和其他證件。2003年間甚至形成了一個獨立的塞爾維亞族鄉鎮聯合會（“塞爾維亞族鄉鎮共同體”），由它進行單獨的鄉鎮管理；該組織主張在民族和領土基礎上重新組織科索沃，這將最終導致科索沃事實上的分裂。
在醫療衛生領域也產生了平行機構。科索沃直到今天還有幾個醫療衛生機構是由塞爾維亞衛生部經營的。多數職員在米特羅維察北部的醫院工作，總計有約1100名從業人員，為約5——6萬人服務。其他一些機構位於科索沃最為重要的飛地之一格拉卡尼卡和其他一些飛地。此外，塞爾維亞內務部警察（MUP Ministarstvo Unutranjih Poslova）的殘餘力量還在北米特羅維察工作，但其規模已經遠遠小於戰後前幾年了。隨著混合科索沃警察部隊的建立，一些塞爾維亞內務部警察變成了科索沃警察部隊的成員。目前科索沃警察部隊有42名警察在北部工作，其中19名以前是塞爾維亞內務部警察。但是，塞爾維亞內務部警察依然領導著幾個行政辦公室，這些辦公室負責簽發護照、駕照、身份證和汽車牌照。在司法領域，北米特羅維察設有平行法院，另外在塞爾維亞族鄉鎮層麵也設有幾個法院。
主要在科索沃北部的這種平行結構進一步加劇了科索沃的民族分裂。
科索沃主體居民阿爾巴尼亞族人認為聯合國科索沃臨時行政當局特派團對塞爾維亞族的平行結構以及貝爾格萊德對科索沃—塞爾維亞族人的政治影響無能為力是其最大的弱點之一。特別是在2003年12月塞爾維亞議會選舉前夕，科索沃—阿爾巴尼亞族的政黨以極其尖銳的形式批評聯合國科索沃臨時行政當局特派團和聯合國秘書長特別代表霍爾克裏允許科索沃—塞爾維亞族人參加塞爾維亞選舉。