人們常說：“有收無收在於水”，這句話充分體現了水在作物生長過程中所具有的重要性，沒有水再好的作物品種也長不出東西來。可是，絕不是說水越多越好，而是要求有適量的水，特別是芝麻這個作物，沒有水不行，水多了也不行，這是為什麼呢？
芝麻研究工作者曾經做過這樣一個試驗：把芝麻種在花盆裏，讓花盆裏的土充分吸足水分，我們叫它飽和持水量，在這種情況下讓芝麻生長，在芝麻大量開花的盛花期3天，開花即將結束的終花期2天，就會造成全株萎蔫。如果把盆裏的土壤水排掉，再把盆放到陰處，植株還可以恢複生長。否則，植株就會死亡。
受澇害死苗的原因，主要是因為土壤裏麵的孔隙被水完全填充以後，在土壤裏麵就會缺少氧氣，植株的根係就會被迫進行無氧呼吸，於是就產生了大量的二氧化碳和酒精，使根係中毒。我們人在正常情況下，進行呼吸時需要大量的氧氣，如果沒有氧氣，我們就會被悶死，其實這裏有許多相似的地方。當植株的根係酒精中毒以後，根吸收水分和吸收土壤養分的能力就會減弱，可是在這個時候，芝麻植株地上部分的葉片由於還要繼續向大氣中散失水分，我們叫它葉片的蒸騰耗水，這樣就會造成地下吸水和地上耗水失調，導致地上部分萎蔫，嚴重的還會死苗。我們把害受植株從地裏拔出來，就會發現，受澇的芝麻根係外表的顏色由正常的鮮褐色變成了灰黑色，變成了失去活力的、散發酒精味的朽爛根係。
在不同時期遭到水淹澇害對芝麻的影響是不完全一樣的。這和我們人一樣，在不同的年齡得病或者受傷，導致的結果是不一樣的，比如在年輕的時候得病就容易好，而在老年得病後就好得非常慢。芝麻也是這樣，如果在苗期，也就是還沒有開花的時候受淹，幼苗就會變黃而且生長緩慢，植株的個子矮小，最終結的果實也會減少；如果在開花結果期受水淹澇害，比較輕的情況下會導致秕粒增多，嚴重時就會造成植株萎蔫死亡。