一支考古隊帶回的巨人下肢骨骼在M國上下引起了轟動，這一發現很可能會證明傳說中的巨人時代確實存在過。當局對這件事也非常重視，指定由著名古人學梅丁博士負責對巨人骨骼的研究工作。不料就在梅丁博士宣布巨人之謎即將解開前夕他卻突然遇害了，而且研究資料和巨人骨骼全都神秘失蹤——這消息又一次震驚了M國上下。
高級警探馬克溫受命調查梅丁博士被害和巨人骨骼丟失一案。經過一段時間的秘密調查，馬克溫發現這個案子背景複雜，似乎有更大的問題隱藏其間。這時，馬克溫發現自己被人監視，上司也要他立即停止對梅丁一案的調查。
馬克溫不想半途而廢，他陽奉陰違加緊了調查。隨著調查的深入，馬克溫越來越接近案件的核心，同時馬克溫也越來越不安，因為他發現博士之死和資料骨骼被盜案隻不過是為了掩蓋另一件案子的真相，而那件案子竟然與國家的最高首腦有關……這時他接到了恐嚇電話，電話威脅他如果再不住手，他將麵臨與梅丁博士同樣的下場。
馬克溫明白繼續調查下去可能麵臨的嚴重後果。但退縮不符合馬克溫的性格，他咬咬牙，把妻子瑪麗安頓到一個秘密地方，然後義無反顧地繼續自己的調查。
經曆了種種艱險，馬克溫終於觸摸到了真相——原來梅丁博士無意中從好友處聽說了有關總統的一件政治醜聞，這件事倘若公之於眾，總統不光會下台，還很有可能要承擔法律責任，梅丁博士的好友正想公布這件事時，他乘坐的飛機突然墜毀，激憤的梅丁打算在記者招待會上公布這件醜聞，沒想到自己也被謀殺了……
馬克溫知道了事情的真相後，明白自己也很難逃脫博士的命運，因為無論他多麼機智勇敢，都無法戰勝對手，他的對手就像一個無比強大的巨人，消滅自己就像消滅一隻螞蟻一樣輕而易舉而又無聲無息。馬克溫猶豫再三，決定把這件事的有關資料通過互聯網傳給自己的上司湯姆，現在他隻敢相信湯姆一個人。可就在馬克溫剛剛發完電子郵件後，他發現自己藏身的地點已被包圍。
幸好馬克溫早有防備，他從秘密通道出去後，跑到了同母異父的哥哥喬爾丹的秘密住所，他的妻子瑪麗就藏在這裏。喬爾丹是一位科學怪人，這些年他醉心於時光機器的研究，這個秘密隻有馬克溫知道，今天馬克溫別無選擇，決定冒險乘坐時間機器逃往未來。
走出時光機器，出現在他們眼前的是一望無際的原始森林中，高大粗壯的樹木遮天蔽日，林間有奇形怪狀的野獸出沒——原來剛剛研製出來時光機器性能不穩定，目標是未來，他們到達的卻是遠古。
雖然結果令人有些沮喪，不過總算擺脫了眼前的危險，馬克溫安慰著哥哥。趁喬爾丹修理時光機器的時候，馬克溫和瑪麗決定出去找點吃的，喬爾丹把一隻特製的手表帶到馬克溫手腕上，說用它可以找到時光機器，否則他們會迷路的。
馬克溫和瑪麗小心翼翼地向林間摸索，林間有些色彩十分鮮豔的野果子，可他們怕有毒，不敢輕易采食。走了一陣，他們忽然發現了一片草地，草地中間有幾棵樹很像蘋果樹，樹上的果子除了小些，也跟蘋果差不多。馬克溫判斷這可能就是遠古的蘋果，他決定去摘幾枚冒險嚐一嚐。馬克溫和瑪麗來到樹下，馬克溫剛要向樹上爬，猛然間樹上飛下一張藤條編製的大網，猝不及防地把兩個人罩在裏麵，隨跟著草叢間衝出一群模樣怪異的野人，上前把馬克溫和瑪麗按倒綁了個結結實實。