攻占了吐魯番盆地的明軍，麵臨著兩個選擇，一個是繼續往莎車方向進軍，進而徹底掃滅葉爾羌汗國，一個是直接攻向天山北麓，向準噶爾盆地發動進攻。而另一路明軍，則順利的攻占了敦煌，從那裏可以直接進攻青海。
這年頭的青海，還是一片茫茫大草原，不像後世那樣到處都是沙漠，西北的生態普遍要比後世好得多。
西北的異族沒有太強的農業生產能力，對自然的開墾能力自然是比較差的，破壞力倒不是那麼大。但是他們對自然的抵抗力就差了，一旦人口增長到養不起那麼多人的時候，要麼是靠內部矛盾來消耗人口，要麼就是通過外部矛盾來消耗人口。
內部矛盾爆發的時候，就是相互之間打來打去的。靠外部矛盾消耗人口，一般都是向關內發動劫掠。
葉爾羌汗國此時就有點人口過剩，加上阿不杜拉向把內部整合了起來，結果就是到處擴張。
葉爾羌汗國如今撤退到了莎車，離吐魯番盆地已經足夠遠的了。而準噶爾盆地就在天山北麓，與吐魯番盆地就隔著一座天山山脈。
盧象升就這個問題召開了作戰會議，會議結果一致認為葉爾羌汗國暫時可以不予理會，直接攻打準噶爾部才最為穩妥。
因為葉爾羌汗國太弱了，在明軍麵前根本就是被秒殺的戰五渣。在這樣的情況下，反倒是天山北麓的準噶爾部目前對明軍威脅比較大。如果明軍主力前往莎車對葉爾羌汗國窮追猛打，準噶爾部在後麵捅了明軍菊花怎麼辦？到時候明軍首尾難顧，萬一後勤補給被準噶爾部切斷，那豈不是要在這滿地黃沙的西域喝風吃沙？
而且進攻天山北麓，明軍後勤補給不用怕被切斷。
此時天山的積雪正在融化，被積雪所堵塞的道路用不了幾天就能完全暢通，也正好合適向天山北麓發動進攻。
盧象升考慮了一番參謀部的建議之後，直接拍板同意了這個作戰方案，隨即集中主力，向天山北麓發動進攻。
天山北麓的準噶爾部也察覺到了明軍進入西域的大動作，此前他們正要和葉爾羌汗國進行一場爭奪地盤的大火並，結果葉爾羌汗國卻突然慫了。對此一開始還覺得奇怪，但很快就偵查到了吐魯番盆地的戰況。葉爾羌汗國這個強敵，竟然短短幾天時間內就一潰千裏，這也讓準噶爾部對明軍也產生了深深的警惕，立即將主力調集到了天山北麓，防範明軍可能向北突入的可能。
在準噶爾部看來，明軍一般情況下是不會向北進攻的。因為明王朝安安生生的過日子好多年了，準噶爾部也沒去招惹明王朝，一般情況是不會遭到明王朝攻打的。
隻不過接下來明軍很生動的給準噶爾部上了一課，讓他們徹底意識到了，這樣的風格是已經是陳年的觀念了。
僅僅在明軍攻占吐魯番五天之後，明軍主力就悍然對準噶爾部發動了無比凶猛的進攻。