裴文中的報告如果屬實的話，那麼“北京人”頭蓋骨應該在日本了。但是，事實卻恰恰相反，到目前為止沒有任何證據表明，日本人秘密收藏了“北京人”頭蓋骨，而盟國領袖美國人也斷然否認日本人將“北京人”頭蓋骨運抵美國，那麼為什麼大家都否認這個事情呢？尋找“北京人”頭蓋骨的行動幾乎陷入絕境。然而，就在人們漸漸淡忘這件事情的時候，一個大膽的假設，使“阿波丸”號開始走進人們的視線。
1982年，當時還是光明日報記者的李樹喜第一次接觸到“阿波丸”號事件，當時第一次打撈“阿波丸”號沉船工作進展到後期，由於種種困難，難以進行下去，打撈者找到李樹喜，想通過他反映這個情況。沒想到這次偶然的邂逅，就此讓李樹喜與“阿波丸”號和“頭蓋骨”結下了不解之緣。李樹喜開始深入調查“阿波丸”號沉沒和“頭蓋骨”失蹤事件。
1996年，李樹喜整理資料時，在70年代美國方麵提供的情報資料的中文譯頁原件中發現了從未見過的內容，資料透露：當年失蹤的“北京人”頭蓋骨化石很可能就在沉沒的“阿波丸”號上麵。
這些情報資料是1972年，當時的美國總統尼克鬆訪華時，送給中國的“特別禮物”。情報中還透露了“阿波丸”沉沒的具體位置以及所裝載的巨額物資，包括40噸黃金、12噸白金、40箱左右的珠寶和文物、3000噸錫錠、3000噸橡膠……
1977年，按照美國提供的資料，我國對“阿波丸”號進行了第一次打撈，曆經三年，果然打撈出3000噸錫錠，當年賣得5600萬美元。而且打撈過程中還發現了偽滿洲國的內閣總理大臣鄭孝胥去世後留給後人的圓硯。這就為“頭蓋骨”在“阿波丸”上提供了有力的旁證。
為什麼人們會猜測“阿波丸”號上會藏有“北京人”頭蓋骨呢？這是一艘什麼樣的輪船呢？
“阿波丸”號是一艘建造於20世紀40年代的日本遠洋油輪，船長154.9米，寬20.2米，深12.6米，總噸位11249.4噸，被日本軍隊征用後，先後6次往返於日本———新加坡航線，為陸軍運送給養。1945年3月28日，“阿波丸”號在新加坡裝載了從東南亞一帶撤退的大批日本人駛向日本。4月1日午夜時分，該船行至中國福建省牛山島以東海域，遭到正在該海域巡航的美軍潛艇“皇後魚號”數枚魚雷的襲擊，3分鍾後迅速沉沒。除1人逃生外，2009名乘客、船員以及船上裝載的40噸黃金、12噸白金、40箱左右的珠寶和文物、3000噸錫錠、3000噸橡膠以及數千噸大米，全部沉入海底。
但是對於這種猜測，提出反對意見的人也不少，因為他們認為從1941年底“頭蓋骨”丟失到1945年4月阿波丸號沉沒，曆經了三年半的時間，“頭蓋骨”不可能從中國的北方跑到南方去。
可是，支持者卻提出相反的論點，他們說鄭孝胥1938年死於長春，他的圓硯原本存於東北，七八年後，居然就在“阿波丸”號沉船中發現了，這隻能說明一個問題，那就是，“阿波丸”上可能還存著意料之外的寶貝。
國寶藏匿於日本皇宮地下室嗎
對於中國非常關心的“北京人”頭蓋骨下落，“我可以對《聖經》發誓，這些化石（“北京人”頭蓋骨）和其他財寶一起被放在（日本）皇宮的地下室裏。”這是最新出版的中譯本著作《黃金武士》中引述美國相關人士對“北京人”頭蓋骨下落發表的評論。
該書作者調查發現，在二戰期間，日本天皇曾經派其叔父到中國搶劫財寶。日本掠奪中國財寶包括直接的戰爭行為、黑吃黑的“黑社會”行為和打著民間搜集幌子的行為。戰爭期間，日本掠走的中國財寶不計其數，至今隻有極少部分歸還中國。該書譯校王選女士在接受專訪時強烈呼籲，要求日本政府公開二戰期間的所有檔案資料，公開日本進行戰爭和通過戰爭掠奪財寶的真相。
《黃金武士》一書由美國兩名專家曆時18年調查采訪而成。該書揭露了日本當局掠奪亞洲價值幾十億美元的財寶，並將其藏匿在菲律賓。戰後，日本和美國等串通一氣，私自吞下這批財寶，並把部分財寶作為進行冷戰的資金。該書有關日本掠奪中國財寶的章節內容，則是首次與中國讀者見麵。
中國人喜歡私下裏收藏財富。日本為了得到這些民間財富，曾與中國黑社會合夥打劫，於是造成中國20世紀三四十年代民間財富大量流失，而且，流失的速度和規模前所未有。據披露，1937年，日本天皇裕仁及其顧問建立了“金百合”皇家組織，成員包括金融、會計、簿記、船運專家及各種寶物專家，該機構由皇族成員監督，通過操縱日本軍隊和黑社會來實行，該組織就像擠牙膏似的榨取中國財富。
據《黃金武士》披露，日本進攻南京前，裕仁天皇將其叔父朝香宮鳩彥派到中國指揮作戰。朝香宮鳩彥對手下發布的命令就是：“給中國兄弟一次永遠也不會忘記的教訓。”南京大屠殺發生。與此同時，“金百合”正在實施，由天皇弟弟秩父宮負責。
在南京，“金百合”行動第一批執行者就是日本憲兵隊。憲兵特別行動小分隊扣壓中國政府財產，炸開銀行庫房，搶劫富人的黃金、珠寶、藝術品和貨幣。書中說：“在這一階段，秘密憲兵至少搜集了6000噸黃金。對這個問題的曆史研究顯示，官方報道的掠奪數量往往隻是實際數目的一個零頭。另外還有無數中國人喜歡儲存的小金塊、白金、鑽石、紅寶石、藍寶石、藝術品和古董也遭搶劫。這些都來自私人家庭和農村的墳墓。日本人做得如此徹底，甚至把屍體鑲的金牙也敲下來。”
被搶來的中國財寶由上海直接由船運往日本，或由火車、汽車運往“滿洲”處理，稀有金屬進行等分，其他的首飾被熔化後，重新澆鑄為統一尺寸的金錠，然後再運回日本。在這個階段，有數名皇族成員參與監督和執行任務，其中包括天皇的兄弟朝香宮、秩父宮、三笠宮和竹田宮等人。
在南京成為廢墟時，中國珍貴藏書、文件等還被嚴密保護。後來，曾有1000多名日本專家來到南京，為日本皇家圖書館優先挑選最珍貴的物品，天皇曾親自過目最珍貴物品的目錄。選中的物品都被一一編號和打包，然後放入防水的箱子裏。大約2300名中國勞工為物品打包，400名日本士兵監督，曾用300多輛卡車把這些箱子運往上海，然後裝船。
這些書的一部分被用來建立位於東京的東亞研究所、東方文化研究所、東亞經濟研究所、東亞地方病研究所、大東亞圖書館等。戰後，美國經過調查後確認，日本至少有17處地方存放這些戰時搶來的書籍，其中包括日本皇宮、皇室內宮、靖國神社、東京科學博物館、東京美術學院、早稻田大學、東京帝國大學和慶應大學。美國占領當局的保守結論是，日本有300萬冊從中國各地圖書館搶來的珍貴圖書和手稿。今天的學者們稱日本的圖書館是亞洲最好的，因為日本僅歸還了其搶來的圖書中的一小部分，大約16萬冊，不足6%。
日本軍方還專門派遣黑社會老大兒玉譽義夫到中國，專門打劫中國黑社會的不義之財。兒玉在中國時，出沒於上海和南京之間無防的農村，到城鎮和村莊，召集地方士紳，強迫地方把財產“捐獻”給天皇。在戰爭初期，兒玉在飛往日本的飛機上裝了太多白金，起飛前起落架曾被壓垮。後來，他隻搜集最大粒、最優質的紅寶石、藍寶石和鑽石，因為這些東西無論是儲存或運輸都要方便得多。