不過，像宋象賢這樣有骨氣的官員實在太少了，絕大多數朝鮮官員棄城而走，將領不戰而逃，駐守在巨濟島的慶尚道水軍節度使元均，居然自沉戰艦、火炮、軍械，當先逃跑。
如此順利的攻勢讓小西行長大為開心，他沒有按照原計劃在釜山等待第二軍和第三軍的會合，孤軍北上。破梁山、跨昌原、陷密陽、占大邱，短短幾天之內，朝鮮慶尚道幾乎全部淪落日軍之手。
直到這時，王京的李朝君臣才得知日軍侵略的消息，驚慌失措可想而知。朝鮮將領申砬和李諡，奉命危難之際，率軍南下狙擊日軍。申砬和李諡都曾和女真交手多年，是久經沙場的名將，不料，尚州一戰，李諡臨時招募的士兵毫無戰鬥力可言，一觸即潰；忠州之戰，申砬麾下的精銳騎兵全部倒在日軍的鐵炮之下，申砬投漢江自盡。
申砬和李諡兵敗，朝鮮再也抽調不出兵力阻攔日軍，眼看王京門戶大開，4月29日，朝鮮國王李昖帶著妻妾子女冒雨北逃平壤。5月2日，小西行長的第一軍開入了毫無抵抗的王京，朝鮮丟了首都。
小西行長的第一軍僅僅不到兩萬人，卻在短短半個多月裏勢如破竹，占領了朝鮮首都，簡直是戰爭史上的奇跡。苦於抵抗不住的李諡感歎道：“今日之敵，似如神兵！”以內政能力見長的小西行長，為何作戰如此神勇？
不是小西行長神勇，而是朝鮮軍隊太無能——世無英雄，遂使豎子成名。
朝鮮李朝自太祖李成桂開國，到宣祖李昖當政已延續近兩百年，安享太平已久的李朝政治上黨爭不斷，經濟上日漸衰敗，軍備上空虛薄弱，《宣祖實錄》上哀歎：“升平二百年，民不知兵，郡縣望風奔潰。”
朝鮮正規軍號稱二十萬，但真正能作戰的部隊鳳毛麟角，而且大多數部署在北麵，隻備西北（女真），不備東南（日本）。承平已久，將不知兵，兵不知將。當時朝鮮的最高將領申砬，去各地視察武器，隻重視弓、矢、刀、劍等冷兵器，別人提及熱兵器鳥銃的威力，他卻不屑一顧：“豈能盡中？”朝鮮大臣柳成龍也承認：“吾國軍事隻用弓箭，未能練就其他技術。”
而到了戰場上，朝鮮將領才悲哀的發現，日軍的鐵炮比弓箭射的更遠更準，威力更大——朝鮮被時代拋棄了。
日本方麵，經曆了戰國後期的“鐵炮戰”洗禮，作戰思路早已改變，鐵炮（火繩槍）成了主力武器。拿朝鮮戰場的日軍來說，忽必烈襲日時期還是主力的日本騎兵已經成為後備隊伍，主力是扛著火繩槍的步兵部隊：鐵炮足輕。
一方是文恬武嬉的懈怠、陳舊的軍事思想、落後的裝備，一方是戰略上的主動襲擊、戰術武器上的先進，加上飽經戰亂磨練的戰鬥力，朝鮮敗得這麼慘一點不稀奇。
3. 加藤清正和女真人打了一仗
小西行長占盡了風光，最不爽的是加藤清正。
因為遭遇風浪，加藤清正的第二軍比小西行長的第一軍遲到了三天才抵達釜山。上岸後，加藤清正咬牙切齒說：“悔為豎子所先，吾豈踐其跡乎！”他不屑步行長後塵，另外選了條路線殺過去。直到進攻王京的前夕，加藤清正才在忠州趕上了匹馬當先的小西行長。在戰前會議上，憋了一肚皮火氣的加藤清正，當麵指責行長違背太閣軍令，“不告先發”，隻顧自己貪功，真是一個純粹的“商賈之人”！小西行長當場大怒，抄起一杆槍要刺清正，被鍋島直茂等將領阻擋解勸後，兩人選擇分頭進攻王京，先攻下者頭功。
結果，加藤清正被漢江所阻，再次遲到。等他趕到王京時，早看見城頭飄揚著小西行長的旗幟——不知道是不是藥囊？
5月27日，休整後的日軍三路軍團聯合北上，渡過臨津江攻占了開城後，開始分頭進軍：小西行長進攻平安道，加藤清正進攻鹹鏡道，黑田長政進攻黃海道。
小西行長的第一軍，還是繼續扮演獵犬的角色，沿著朝鮮國王李昖的北逃路線追擊，直指朝鮮陪都平壤。6月11日，李昖無奈撤離平壤，北逃到鴨綠江邊的義州。
三天後，小西行長占領了幾乎沒有抵抗的平壤。至此，朝鮮的三都：王京、開城、平壤全部淪陷。
得到小西行長攻克平壤的消息，加藤清正卻是更加惱怒。在爭功的念頭驅使下，加藤清正催促部下快馬加鞭殺入鹹鏡道，一口氣掃平了元山、鹹興、北青、金策、會寧，抓獲了朝鮮兩個王子，打敗了朝鮮鹹鏡北兵使韓克誠的北方邊防軍。
加藤清正已經打到了朝鮮國土的最北端，但他一點沒有收腳的念頭。為了證明自己比“藥材商”更能打，清正的第二軍悍然跨過圖們江，踏入了女真人的領地，和女真的一個部落打了一仗。從地域上說，圖們江以北屬於中國境內，所以加藤清正的第二軍，算是萬曆朝鮮戰爭中唯一一支“直入於明”的日軍。
這一仗的詳細記載不見於明朝和朝鮮史料，隻在日本史料裏有簡略的記述：“先是清正入兀良哈觀兵，其地部落各有屯營，清正攻拔四五營，餘營皆遁去。”記錄加藤清正生平的《清正記》裏稱：“陷其都城，斬首九百餘。是月還鹹鏡道。”
圖們江以北的地盤為建州女真的一部占據，日本人所稱“兀良哈”是泛指北方野蠻部落。從時間上看，這股女真部落還沒被努爾哈赤統一，所以他們的交手肯定是小規模的遭遇戰，《清正記》裏的“陷其都城”也純屬誇張。事實上，加藤清正在和女真人交手後，還是對他們的野蠻有所忌憚，所以不敢久留，退回到朝鮮鹹鏡道。他在給豐臣秀吉的書信裏，說自己之所以不攻略明地，是因為“孤軍難深入。”