3.劉道衡使英問題
大理政權後期，曾有劉道衡使英求援問題，成為滇西回民起義研究的重大疑難和評價杜文秀的關鍵。劉道衡，雲南文山人，回族，經名哈桑。1870年上書杜文秀：“請元帥假衡以尺寸之書，專衡以遠使之任”（《回民起義》(二)，第170頁。），去英國求援兵。1871年冬，劉道衡帶著杜文秀呈“大英國皇上”的表文去英國，表文內稱：“中華總統兵馬大元帥臣杜文秀，謹表大英國皇上陛下，俯請聖安”“今聞我大英國皇上仁如堯舜，德媲禹湯臣等深慕大德，遠獻愚忠。
如蒙俯納，遣發飛龍之師，願效前驅，勷成逐鹿之誌。”劉道衡於次年5月到達英國，呈交表文，又兩次致函英王，說明他來求援的原因，並說帶來四箱大理石，以表“獻土稱臣”之意。第一次信中稱：“各位老大人閣前金安，敬啟者：表章內所陳不過大概，至於備細之事，本是要衡細說，方能明白”，“我大理力戰十七年，能與清朝對敵，亦東方之英雄也。今我來歸順貴國者，不過借貴國之洪福，圖成大事而已。若貴國不肯發兵到中華，事也無妨，我大理所管之兵，亦自足用，目下隻須貴國派一二能員貴官，由阿瓦暗地進大理，會我父親，看我情形，若大理可以共圖大事，隻須暗地助我槍炮，助我銀玉，則我大理所管地方，便都是貴國的百姓了。”
第二次函，著重說明送四箱大理石的意圖，說：“古來中華規矩，每逢小邦歸順大國，名為獻土稱臣，必取小邦主山之石，以為憑據，將此石獻於大國，即如將小邦的土地、人民、山川、城池，拿到大國一般。大國將此石收了，即如將小邦的土地、人民、山川、城池收了一般。中華自秦始皇以來，二千餘年，小邦歸順大國，必行此禮。”劉道衡還述說大理政權疆域：“今我大理所管之地，東至楚雄，西至騰越，南至耿馬，北至麗江。由東至西，人走十八日；由南至北，人走二十日。”
這成為了解大理政權轄區的寶貴材料。劉道衡自己寫的函，自然由他自己負責，而杜文秀呈英王的表文是真是假，成為爭論焦點。有人說：“隻有劉道衡這一個無恥透頂的騙子才搞得出那樣一個馬腳畢露，醜態百出而還恬不知恥地去行騙的騙局來”（羅爾綱：《回民起義傑出領袖杜文秀》，載《民族研究》，1984年，第1期。），意思是劉道衡使英完全是劉道衡搞的騙局；有人認為，“既不能說杜文秀完全同意劉道衡這種行為，但也不能說杜文秀對使英的事體可以毫無責任”（田汝康：《有關杜文秀對外關係的幾個問題》，載《曆史研究》，1963年，第4期。）；也有人認為劉道衡使英杜文秀負全部責任，說：“時當同治十年(1871)十月，杜文秀終於依照劉道衡的建議”，並“授予劉道衡全權。”（黃嘉謨：《滇西回民政權的聯英外交》，第178頁。）不論如何，杜文秀對劉道衡使英要負一定責任，說杜文秀呈英王表文純屬劉道衡假造缺乏根據。但即使杜文秀對此事負有責任，也不能因此否定杜文秀，因為陷入危難之際總希望得到援助，求外援不能等同於賣國，何況杜文秀沒得到任何英援，劉道衡空手而歸。
當他回到仰光時杜文秀已殉難，大理政權已失敗，劉道衡以後的行動更不能由杜文秀負任何責了。杜文秀畢竟是個英雄人物，是滇西各族人民反清起義的傑出領袖，人們今天紀念他完全是應該的。
投降清朝後的馬如龍，忠心為朝廷賣命。他的叛賣活動大大削弱了雲南回民起義的力量。《清史稿》說：“滇回初起，勢頗盛，自如龍反正，其氣始衰”（《清史稿》卷四五六，《馬如龍等傳論》。）馬如龍投降後站在清朝廷立場招降杜文秀，政治上瓦解回民起義，軍事上打擊回民起義，為清朝鎮壓回民起義盡犬馬之勞。因此，“全滇底定，賞黃馬褂”；1874年“到京陛見。奉旨調湖南提督。值慈禧皇太後壽辰，命赴慈寧宮聽戲三日，欽賜回教肴饌，並玉如意，衣料、香爐等物。前後召見四次，複命恭親王親驗傷痕，寫呈禦覽”（《回民起義》(二)，第313頁。）他得到朝廷賞賜，但沒得到朝廷信任，由雲南提督調湖南提督，以後客死四川。
另一個降清的回民領袖馬德新，政治上不能肯定，但寫有許多伊斯蘭教著作，受到回民穆斯林的崇敬。
(四)貴州白旗起義
貴州白旗起義即貴州回民起義，因旗幟尚白，故稱白旗起義。廣義上它是雲南回民起義的一部分。因為它與雲南回民軍不僅地理上相連，整體上配合作戰，清朝廷也把它們作為回民起義的一個整體來鎮壓的。