6月4日淩晨2點45分，位於中途島西北240海裏的南雲，已經在忙著進行攻擊的準備了。天還沒亮，航母上孤寂的探照燈，使得大海愈顯黑暗和深邃了。
淵田美津雄趔趄著走到甲板上來，這個曾率部偷襲珍珠港的野蠻壯漢，患上了急性闌尾炎，剛在艦上做過手術不久，現在，他堅持要目送戰機離艦。
另一邊，站著航空參謀源田實，他穿著睡衣就走出來了，向南雲請戰，要求親自負責這次行動。就像湊趣一樣，他也患了病，一直高熱不退，燒得稀裏糊塗，眼睛像患了紅眼病一樣。南雲沒言語，拍了拍他的肩膀，默許了。周圍的官兵無聲地看著，艦上突然升起了一股猶如喪家之犬的傷感味道。
淵田擔心日機會受到美軍攔截，建議南雲派偵察飛機前去搜索。淩晨4點30分，偵察機準備起飛。但好像是天意，問題又出現了。有3架飛機分別因為彈射器故障、引擎故障而未能及時起飛。有一架飛機在鼓搗了半天後，倒是起飛了，但卻因為耽誤的幾分鍾，剛好錯過了與美軍特混艦隊的相遇！而且，它出去兩個小時就跑回來了，一是因為引擎也出毛病了，二是因為天氣又讓人沒情緒。
如果這幾架飛機都能按時起飛的話，曆史也許就會改寫，因為它們會與美軍的特混艦隊打個照麵，會提前做好防備，而不是齊刷刷地等死。
淩晨4點45分，山本乘坐的“大和”號駛到了距中途島800海裏的海麵上。雖然才4點多鍾，但這裏的太陽是“早起”的，天空已經亮白了，唯有濃霧彌漫著久久不退。
山本向遠處望去，什麼也看不見。他的胃痙攣愈加劇烈了，虛汗一層層地冒出來。他暗想，南雲或許也正被濃霧籠罩著。此時，他還不知道，穿著睡衣的源田實已經指揮第一批108架飛機升空去了。
淩晨5點30分，第一批飛機出現在了距中途島150海裏的地方。在這裏，它們與美軍的一部分戰鬥機廝攪在了一起。美軍的另一部分戰鬥機則一溜煙奔向南雲艦隊了。
留下作戰的美機，數量少，性能差，因而沒能截住日軍。日軍於是對中途島進行了20分鍾的肆意轟炸。不過，日軍的機群，卻被地麵美軍的炮火擊落了1/3，幸存飛機的燃料又幾乎殆盡了。
第一波攻擊編隊隻得返航，編隊的指揮官發報給南雲，認為必須再進行第二次空襲，才有可能消滅中途島的航空力量。
南雲接到電報時，是早晨7點鍾。他正與眾參謀商討是否要進行第二次空襲，在7點10分的時候，從中途島飛來的第一批美軍機群，共10架魚雷攻擊機，忽然從雲層中現身了，從1200米的高度向南雲艦隊殺過來，有一架差點撞在南雲所在的“赤誠”號上。
南雲的20多架“零”式戰鬥機迎上去攔截。在持續5分鍾的戰鬥中，有7架美機被擊落，餘下的3架飛機勢單力薄地向中途島返回了。美機所發射的魚雷，一顆沒中。
看到這種情況，參謀長草鹿替南雲下達了第二次進攻中途島的命令。
命令下達時，甲板上的狀況並不樂觀。發著燒的源田實把100多架飛機都擺在了那裏，這些飛機原打算是要轟炸美軍航母用的，因此都掛著魚雷。現在，既然不去轟炸美軍航母，而還是要轟炸中途島，就需要把飛機重新搬回甲板下麵去，在那裏卸掉魚雷，換上炸彈。
7點15分，日軍一堆堆一群群地在甲板上忙活開了。
麻煩在這時已經開始。7點30分，南雲接到報告：發現美軍艦隊，共10艘艦艇。
南雲頓時一驚，如果美艦中有航母，而航母又派出飛機來轟炸怎麼辦？他看了看亂哄哄的甲板，上麵的飛機正在換裝炸彈，根本無法前去迎戰，隻能任人宰割。
7點45分，南雲幾經考慮後，下令停止換彈。
甲板上的活動停止了，而美國飛機也果然來轟炸了。不過，這些美機並非來自航母，而是來自中途島的另一個機群。
這是不中用的一群，還沒等靠近南雲艦隊，就被日本“零”式戰鬥機擊落了50%。接著，又來了15架轟炸機，也不中用，它們不斷地投彈，卻因為處於6000米的高度上，炸彈都白白地擲到魚群中去了。
南雲暫時占據了上風，但還要不要換彈呢？
正猶豫著，南雲又接到報告，說發現的10艘美國軍艦中並沒有航母。南雲想了想，命令：接著換彈。
一聲令下，定格的甲板上，再次你來我往，狼藉的場麵再次形成。
8點20分左右，一個報告又發過來，說是10艘軍艦後麵好像跟著航母。南雲氣得腦袋都要冒煙了：到底有還是沒有！從7點30分到現在，差不多一個小時過去了，一會兒說有，一會兒說沒有，簡直是活活地折磨人。
在心底裏，南雲相信應該有航母，參謀長草鹿也相信。在“大和”號上收到南雲電報的山本，也相信有。但他不像南雲和草鹿那樣悲觀，相反倒有一種“回光返照”似的樂觀，他覺得，這是美軍給他送來的大禮——狂妄、盲目到了極點。
南雲可不這麼想，他焦頭爛額地下令，別換什麼炸彈了，趕緊再換上魚雷，準備轟炸航母去。