從前，在德國與奧地利的交界處有一座神奇之城。這個城市的雷雨街777號是一座神秘的大院，裏麵住著許多會不同奇異魔法的人，包括名噪一時的老魔法師格魯爺爺、幾個世紀以來都是世界魔法冠軍的瑪爾塔阿姨以及邪惡的大鼻子女巫特魯德等。
大院的一間孤零零的小屋裏，住著善良的小魔法師莫莉，陪伴她的是一隻異常聰明的烏鴉。莫莉已經77歲了，可她還隻能算是個小孩子。雖然她非常希望能早日擁有神奇的魔力，但是按規定她還不能讀《百歲魔法書》。
有一天，莫莉忍不住好奇，偷偷地讀了那本書，結果雖然學會了一些神奇的魔法，卻被魔法師頭領發現了，並被罰一年內禁止使用魔法。
一年後的春天，莫莉騎著掃帚飛到了布勞坎山，想去參加瓦普吉斯之夜舞會。可是魔法師頭領不讓她參加，他說如果莫莉能通過明年的魔法師資格考試，成為一個好魔法師，就可以參加瓦普吉斯之夜舞會。莫莉記住了頭領的話，之後更認真地學習魔法了，還做了許多好事。
星期五是魔法師的禁日，可是，小魔法師莫莉卻在這天違反了規定：她使用魔法從獵人的槍口下救了一隻小白兔。莫莉很擔心自己會因此被取消魔法師資格，但烏鴉安慰她說：“你做了這麼多好事，不用擔心。”
終於到了魔法考試的那一天，以世界魔法冠軍瑪爾塔阿姨為首的魔法師委員會準備了許多難題，這些都沒有難倒小魔法師莫莉，她的表現特別棒！於是，魔法師頭領最終決定允許她參加瓦普吉斯之夜舞會。可是，這時大鼻子女巫特魯德卻跳出來表示反對，她叫道：“用魔法幹壞事的魔法師才是真正的魔法師，小莫莉的魔法全用在做好事上了，所以她是個壞魔法師！”接著，她就把莫莉在星期五使用魔法的事說了出來。這使許多邪惡的女魔法師們都很生氣，她們憤怒地撲向莫莉，想要把她撕成碎片。就在這時，烏鴉帶著掃帚及時地飛了過來，幫助莫莉逃出了重圍。
莫莉傷心地回到自己的小屋，她發誓一定要掌握更多的魔法來抵製那些壞女巫。不久，專門為國家培養世界級魔法大師的因特耐魔法學校要招生了，莫莉非常渴望去那學習。可那可惡的女巫特魯德又想出了一個鬼主意來阻撓莫莉。她騙烏鴉說：“要是莫莉去上學的話，她就會因為擔心同學笑話她和烏鴉住在一起而不要你了！”烏鴉信以為真，便把莫莉要它代交的報名表燒掉了。結果，因特耐魔法學校都開學了，莫莉還沒有接到錄取通知。她去找校長老魔法師格魯爺爺詢問，才知道其中的緣由。
莫莉非常生氣，想要把烏鴉送給別人。在善良的格魯爺爺的幫助下，烏鴉知道自己被人利用了，非常後悔，便十分誠懇地向莫莉道了歉。之後它又把自己最為珍貴的一根羽毛捐獻給因特耐魔法學校，為莫莉換來了入學通知書。莫莉得知後非常感動，她原諒了烏鴉，並帶著它高高興興地去上學了。
轉眼三年學習時光已經過去了，雖然大鼻子女巫特魯德想出了種種詭計，經常給莫莉製造一些麻煩，但在烏鴉的幫助下，莫莉終於順利地完成了學業。畢業考試時，平常學習魔法最努力的莫莉，以精彩的魔法表演奪得了第一名。校長格魯爺爺親自為莫莉頒獎，他激動地說：“相信你將來一定能成為世界級的大魔法師！”
春天來了，一年一度的瓦普吉斯之夜舞會又要舉辦了，已經擁有超強魔力的小魔法師莫莉決定借這個機會教訓一下那些邪惡的女巫們。就在當天夜裏的十一點四十五分，莫莉帶著烏鴉悄悄地飛到了布勞坎山。眼尖的大鼻子女巫特魯德第一個發現了莫莉，想要從背後偷襲她。這時烏鴉猛地飛了過去，一下子啄瞎了特魯德的雙眼，她慘叫著逃走了。接著，莫莉念起了第一條咒語，隻見成千上萬的掃帚頓時從四麵八方飛了過來。緊接著，她又念起第二條咒語，那些邪惡的女巫們拿在手中的魔法書就像蝙蝠一樣紛紛落到掃帚上。當她念起第三條咒語時，壞女巫們的魔力頓時全都消失了。