秦山二期核電站裝有兩台60萬千瓦水堆核電機組，於1996年6月2日開工建設。1號機組於2002年2月6日實現首次並網，2004年4月15日提前47天投入商業運行。它的建成為我國核電自主化事業的進一步發展奠定了堅實的基礎。
秦山三期核電站是中國和加拿大合作建造的我國第一座重水堆核電站，裝有兩台72.8千瓦核電機組。它於1998年6月8日開工建設。1號機組於2002年11月19日首次實現井岡，2002年12月31日投入商業運行。2號機組也於2003年6月12日並網發電。
秦山核電站是我國核工業適應國家戰略調整大局，向保軍轉民方向邁出的重要一步，是繼核武器、核潛艇研製成功後我國核工業的又一曆史性突破，是核工業第二次創業的裏程碑。它的建成投產結束了祖國大陸無核電的曆史，是我國和平利用核能的光輝典範，同時也使我國成為繼美、英、法、前蘇聯、加拿大、瑞典之後世界上第七個能夠自行設計、建造核電站的國家。
脈衝反應堆
脈衝堆是用獨特的鈾氫鋯材料做燃料元件的多功能小型池式核反應堆。與其他核反應堆相比，脈衝反應堆不僅能進行穩態運行，還能進行獨特的脈衝運行，即在約0.1秒的時間內把脈衝棒彈出堆芯，從而使堆功率及中子通量瞬間達到穩定狀態額定值的數千倍，之後又恢複正常運行。這樣就擴展了它的功能和應用範圍。它具有一般研究堆用途，如同位素生產、中子活化分析。中子照相、樣品輻照、物理實驗等，廣泛應用於工業、農業、科研、醫學。地質、環保、考古等領域。同時，脈衝反應堆具有高度的固定安全性，對環境無汙染，結構簡單，建造和運行費用低，所以具有其他反應堆無法比擬的優越性，可建造在大中城市、科研機構和大學校園內。
1990年10月16日，中國第一座脈衝反應堆在位於四川成都的中國核動力研究設計院建成並達到臨界。中國建成的這座脈衝反應堆，是目前世界上最先進的一種堆型。它的額定功率為1兆瓦，是一種多用途座池式實驗研究堆。它采用慢化劑元件，當反應堆發生功率陡增事故時，這種慢化劑能產生瞬發負溫度係數，從而達到自動調節功率的作用，安全性能很高。這種堆堆芯緊湊，結構簡單，安全保障設施要求較低，大大減少了建造和運行費用。因此，如果用於發電，可大幅度降低成本，具有廣闊的商業化前景。這標誌著中國繼美國之後，已成為世界上第二個能設計與建造這種新型堆的國家。
該脈衝反應堆於1991年6月投入運行。該反應堆能有效地進行中子活化分析，一般光譜分析的靈敏度僅能達到百萬分之一，而中子活化分析可達到十億分之一；也可對高純金屬中微量元素進行分析、檢測食品中有害元素、了解農藥對莊稼的影響等。擁有了這種反應堆，可以在工業、農業、醫藥衛生、科研等多個領域發揮重要作用。
低溫核反應堆後動運行
世界上第一座5兆瓦一體化殼式低溫核供熱反應堆於1989年11月在清華大學投入運行，這是中國在核能科學技術的開發和利用領域取得的突破性進展。
1981年，清華核研究院開始進行低溫核供熱研究，於1983年冬成功地進行了國內首次反應堆餘熱供暖運行試驗。1985年，國家決定在核研院建造一座5兆瓦低溫核供熱實驗反應堆。該項工程於1986年3月開建，1989年11月建成並臨界啟動一次成功。1991年，在這個反應堆上還成功地進行了熱電聯供實驗；1992年，又成功地進行了核能空調製冷實驗。該堆是世界上第一座投入運行的一體化自然循環殼式供熱堆，又是世界上第一座采用新型水力驅動控製棒的反應堆。它的運行成功，使我國在低溫核供熱領域跨人世界先進行列。
超導體的研製
人們把處於超導狀態的導體稱之為“超導體”。超導材料和超導技術有著廣闊的應用前景。能使超導體電阻為零的溫度，叫超導臨界溫度，傳統的超導電現象隻能在液氦溫區（—269℃）才能出現，而氦是一種稀有氣體，因而大大限製了超導的應用。
中國的超導研究始於20世紀50年代，到80年代後期已經取得突破性進展。1986年12月26日，中國科學院物理研究所宣布獲得超導臨界溫度48.6K的超導材料，並在少數樣品中看到了70K時出現超導的跡象。1987年2月24日，中國科學院物理研究所又宣布發現了超導轉變溫度為100K以上的超導體，並首次公開宣布了液氮溫區超導材料的成分。超導體不能在液氮溫區（78K）工作的禁區終於被打破，氮在空氣中大量存在，而空氣的液化是一種廣泛應用的技術。