西歐圈為時鍾塔的勢力範圍，九成的西歐魔術師會選擇時鍾塔。現在說到魔術協會的話多是指時鍾塔本身。
阿特拉斯院
存在於埃及的阿特拉斯山脈的部門，別名稱為“巨人之地窖“。也是煉金術師聚集的研究組織，同其他部門相比，也是貫徹著算是很徹底的秘密主義，因此詳細不明。根本和外界毫無交流，據說連光線也溜不出去的“活地獄“。
阿特拉斯院專心煉金術，著重於事象的變換，同時鍾塔的現代煉金術研究的物質變換不同。
彷徨海
是彷徨於北大西洋的巨大山脈其本身，也被稱為“移動石柩“。組織內部沒有一般的上下關係，被認為不像時計塔般期望著“魔術更進一步的發展“，但其真相不明。
彷徨海被視為魔術協會的原型，專心於人體改造和神代魔術的研究。認為神代的魔術至高無上，西曆紀元後的魔術等同兒於戲。同時鍾塔處於冷戰狀態。
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（十年後）
“master！”
“說了多少次了，叫我玖翼就好。”
窗外陽光明媚，玖翼整理著自己的衣服。身後是一個少女------宮本武藏！！
玖翼已經三十多歲了，顯得有些成熟，而宮本武藏還保持著二十幾歲的樣子。
玖翼擺弄了一下領帶，卻沒有弄好，宮本武藏走上來替玖翼弄正了領帶，當宮本武藏抽回手的時候，玖翼忽然伸出手，握住了宮本武藏的雙手。
宮本武藏一下子變得臉紅了。
“幹......什麼啊！”
“我喜歡你，武藏。”
“嗚......嗚嗚！抱......抱歉！請等等！兩人獨處時候禁止肢體接觸！沒錯！雖是喜歡美少年，但不太擅長處理男女的關係！因為，佛祖所說，要是帶有這份感情的話會使劍鋒變得遲鈍。”宮本武藏慢慢推開了玖翼。
“已經夠了，剩下的，我來保護你。”
他們的身體貼合在一起，臉靠的很近，他甚至可以看到她臉上細致的絨毛，聞到她身上淡淡的香氣，呼吸變得灼熱，語言已是多餘的東西，唇瓣慢慢貼合在一起，他情不自禁地顫了一下，看到她的眼裏霧蒙蒙水潤潤的，臉上泛了紅潮，鼻尖滲出細小的汗珠，嘴唇微微張著，露出鮮嫩水潤的舌尖，清純夾雜著嫵媚，那惹人憐愛的樣子讓他情難自禁地低頭含住她的唇瓣，繼而溫柔地繞住她的舌尖，她輕顫著承受他的愛意，睫毛已不自覺地潮濕......
“咚咚！”
敲門聲不適合地響了起來。一個學生模樣的男生站在門口，不好意思地撓了撓頭，然後說道：“抱歉不該打斷你們的，玖翼導師，武藏導師。但是韋伯導師有緊急事件，傳召二位。”
（時鍾塔·最高議會辦公室）
韋伯把一份信遞到了玖翼手上。
“來自se.ra.ph。署名，殺生院祈荒。”
（ps：第一部ending）