漠深處的地下實驗室中……”神秘的男孩萊恩開始講起了自己的故事。
二十年前，潛伏在沙漠深處的黑暗兵團開始組織科學家進行一係列神秘的研究，目的是生產出可以控製人類思想行為的超能量物質和殺傷力極強的武器。實驗室的頭目是一個天才科學家——卡西歐博士。卡西歐博士下屬還有幾十個具有出眾才能的科學家，他們是不同科學領域的權威。在卡西歐博士的帶領下，他們研製出了一係列產品，這些產品有的可以讓人的智商在一夜之間變得奇高無比，有的可以讓人變得冷酷無情，有的可以讓人具有超能力，有的還可以讓人變癡愚……產品研製出來之後，為了驗證實驗的成果，卡西歐博士從世界各地找來一百個不同種族、不同性別的嬰兒進行實驗。他們將不同的物質注入到嬰兒體內，效果很明顯，嬰兒們出現了不同的反應。被注射了高智商物質的嬰兒們變得特別的聰明，被注射了冷酷物質的嬰兒變得特別的不近人情。卡西歐博士欣喜若狂，他將其中具有高智商的或者冷酷的嬰兒挑出來，又給他們注射了超能力物質和其他物質。但是出乎卡西歐博士意料的是，嬰兒們開始出現了不適的反應，甚至有些嬰兒還因此死亡，卡西歐博士知道不同的物質產生了抵製，他開始對這些接受了實驗的孩子進行觀察，並每日從孩子們身上抽取血液進行檢查。這樣又過了六年，接受實驗的大部分孩子的身體都出現了各種各樣的狀況，這其中隻有十個孩子是能夠健健康康地存活下來的，但是他們所付出的代價就是每個星期至少補充一次能量，否則就會失去生命。萊恩便是這十個孩子其中之一，他是十個人之中最聰明也是最善良的。他知道自己是卡西歐博士的試驗品，所以一直不敢將自己真實的本領顯露出來，以免引來更多的注意，尤其是在他知道了卡西歐博士的陰謀之後，行事的時候更加小心翼翼，防備著自己成為卡西歐博士手下的棋子。萊恩要做的不僅僅是自保，他從小到大看遍了實驗室裏的悲劇，所以更是一直在尋找逃離黑暗實驗室的機會。黑暗實驗室配有專門的圖書館，萊恩經常到那裏去，他希望能從圖書館找到破壞黑暗兵團的力量。
這天，萊恩在午後一點鍾又悄悄地來到圖書館，這時候圖書館裏的工作人員大多已經去休息了，隻有芙美裏阿姨在圖書館中工作。芙美裏阿姨原本是卡西歐博士頗為器重的一位實驗人員，但是因為不滿卡西歐博士拿嬰兒做實驗的事情而拒絕進行實驗，便被卡西歐博士分派到了圖書館。芙美裏阿姨對這些被實驗的孩子都充滿了同情和憐愛，所以孩子們有什麼事情都喜歡和她說。萊恩是芙美裏阿姨最喜歡的孩子之一，因為他善良且富有正義感，所以對萊恩的一切要求她都盡可能通融，萊恩到圖書館來的目的也隻有芙美裏阿姨知道。
萊恩走進圖書館，遠遠就看見芙美裏阿姨衝他招手，看看左右無人，便悄悄地走了過去。
“萊恩，昨天我在卡西歐博士的私人書庫看到這樣一本書！可能對你有所幫助！”芙美裏阿姨說著，悄悄地將一本書塞到了萊恩的口袋裏。
萊恩看了看四周，沒有發現什麼異樣，便拿著書坐到了一個小小的角落裏，接著又隨便找了一本雜誌作掩護，這才小心翼翼地將芙美裏阿姨交給他的書拿出來，這本書確切地說，應該不能算是一本書，因為它是用英文手寫的，而且從發黃的外觀上看來，應該有很久的曆史了，萊恩翻開書的第一頁，立刻被裏麵的文字吸引了，他抬頭看看周邊無人，便如饑似渴地認真地將書中的每一句話刻進了腦子中，很快，萊恩拿著書到了芙美裏阿姨跟前，悄悄地將書還給了她，並用力地握了握她的手，悄悄地說了一句，“我已經找到了！謝謝你，阿姨。”緊接著便準備離開圖書館。
“萊恩！”芙美裏阿姨突然又叫住了他，將一顆小小的珠子放到了萊恩手中，“拿好它！這是你找到親生母親的重要線索！”
萊恩張開雙手，手中的珠子閃著光，萊恩有些吃驚了，“阿姨，珠子怎麼會在你這裏？”
“你被抱到實驗室進行編號的時候，我特意摘下來的！當時這顆珠子就掛在你脖子上！孩子，出去之後一定要找到你的父母，我相信他們一定很想念你！”
萊恩眼睛裏閃著淚光，他用力地握了一下芙美裏阿姨的手，便強迫自己離開了圖書館。萊恩在路上努力抑製自己激動的心情，他現在已經找到了消滅黑暗兵團的方法，現在最重要的，就是拿到走出黑暗城堡的通行證！他知道，走出黑暗城堡的通行證隻有卡西歐博士那裏才有，便找了個機會悄悄地潛入卡西歐博士的起居室。
“通行證到底在哪裏呢？”萊恩在卡西歐博士的屋子裏找來找去，卻始終沒有發現任何線索，就在萊恩著急的時候，突然傳來了開門的聲音，萊恩嚇了一跳，立刻找了個櫥櫃躲起來。