一轉眼間，過去了數十年（20多）過去了，王鵬飛直接來了一個卸磨殺驢，等到學園都市建立完好並且完善了一切之後出手幹掉了艾華斯和亞雷斯塔，自己坐上了學園都市的理事長的寶座，因為下決心走的是基因、精神力、遊戲強化路線，所以，除了造就超能力外，還造就了4個力量：隻有女子的刺客（照搬暗黑2，老玩家們都懂得），隻有男子的超級戰士【PS：光環係列的老玩家們都懂得】，假麵騎士【龍騎世界版】、還有同樣隻有女性的召喚師。每一個職業者都有2顆大眾版石頭（注1）和獨立版寶石（注2），分別綁定在胸口和肚臍上，獨立版則是替代了他們的體內的幾個器官，不會因為失血過多而死，也不會被殺死，因為都吃過了蓬萊之藥，原著裏學園都市的警備隊消失了，被王鵬飛所造出來的刺客、超級戰士、假麵騎士、召喚師、超能力者所替代，隊員是自願加入，一共是20隊組成的，每一個隊伍裏標準配備隊員和裝備：超級戰士1名，召喚師1名，刺客1名，假麵騎士1名，超能力者1名。有統一的製服和特殊的黑色的強殖裝甲，每一個人配有遊戲《光環》的突擊步槍1把*5彈夾（超級戰士專用），麥格農手槍1把*5彈夾，攻擊步槍1把*5彈夾，破片手榴彈3顆，狙擊步槍1把*24發（PS：召喚師專用），散彈槍1把*60發，黏性榴彈手槍1把*5榴彈頭，班自動武器1把*5彈夾（全隊隻配一把），磁軌槍*1把*6彈夾（PS：召喚師專用），斯巴達鐳射槍1把*30容量。
王鵬飛統治下的學園都市已經完完全全變質了，小學生不再是主流了，熱血小強、好戰狂、和平份子、校園類男女主角、戀愛係動漫的所有的男女主角都在這裏被召喚出來，還多出一個叫西行寺幽幽子的大胃亡靈被偶然間召喚出來的，一出場就吃掉了附近的10家餐廳的所有能吃的東西，還嚇跑了一對開店的來自於異界的大魔王和勇者夫婦。大魔王還向王鵬飛告幽幽子的狀，還附帶著被吃光掉而窮掉的10多位餐廳老板的告狀書，王鵬飛為此忙的焦頭爛額，幽幽子還是一副天然呆的模樣，吃啊吃···【幻想鄉亂入開放式！！每一個世界都有一個幻想鄉的角色亂入。】
學園都市坐落在人工建造的一個島嶼上，不是在某一個群島裏麵，王鵬飛貴為理事長，每天日理萬機，為了節出自己的空閑時間，安排了12位理事員，按照12個區來劃分學園都市，找了12個動漫角色，一方通行、坦亙帝都、食蜂操祈、麥野沈利、但丁、亞瑟王阿爾托利亞、阪田銀時、化成人類的祭禮之蛇、天道總司、某軒、五代雄介、吉安娜·普羅德摩爾。各個種族都有，紅世之徒、假麵騎士、輪回隊員、國王、魔法師、超能力者、廢柴、魔人，阿列~好像有什麼奇怪的東西混進去了···
一方通行管理第一區，這個區主要是經濟、商業類區，坐落在東南方；
食蜂操祈管理學生們所呆的幾所學院，這是第二區，坐落在西南方；
第三區由麥野沈利管理，這裏主要是防衛部，警戒部等武裝區，坐落在東北區；