圍繞著水晶頭骨，瑪雅人的慶祝活動持續了好幾天，一位瑪雅老人說這個頭骨非常古老，有１０萬年之久的曆史了。老人說，很久很久以前，有個偉大的瑪雅人的祭司十分受人愛戴，人們為了永遠留住他的正直和智慧而製作這個頭骨。老人說，水晶頭骨也許還能說話，至於怎樣才能使他說話，他沒有講。
米歇爾·黑克斯不知道該怎樣處理他們所得到的這顆水晶頭骨。他逐漸認識到，水晶頭骨對於瑪雅人民來說更加神聖，更加重要，他不能把這個頭骨從可憐的瑪雅人那裏帶走。於是，他毅然決然地把頭骨送給了瑪雅人，瑪雅人因此而興奮異常。對米歇爾感恩戴德，頭骨在瑪雅人那裏整整保存了三年多，其中的每一天，頭骨周圍都燃著篝火，從未熄滅。
直到１９２７年，米歇爾·黑吉斯的探測隊的發掘工作接近尾聲，他們在那裏，在瑪雅遠古人類的城市遺址的廢墟上，出土了幾百件奇珍異寶，但任何一件也不能與水晶頭骨相媲美。當安娜與她的養父與瑪雅朋友告別時，瑪雅部落酋長送給米歇爾·黑吉斯一包東西，打開一看，安娜驚喜地發現，正是她冒著生命危險才得到的那顆水晶頭骨。勤勞善良的瑪雅人為感謝米歇爾長期給予瑪雅人在醫療、工具等等方麵的幫助，臨行時把水晶頭骨送給了他。
米歇爾·黑吉斯當初怎麼也沒想到，這塊水晶頭骨會成為人類發現的最神秘的瑰寶之一，它會改變所有來看過它的人的一生的命運，它具有某種通靈之力，向人們昭示遠古和未來的秘密。
令瑪雅人為之頂禮膜拜的水晶頭骨，後來經科學家鑒定，這是從一整塊很大的高純度的水晶石上雕刻、打磨下來的傑出的藝術品。
檢測工作於１９７０年，在美國加利福尼亞薩坦科萊羅的海爾萊德派克爾德水晶實驗室進行。檢測表明，水晶頭骨是由真石英水晶製成，而天然真石英水晶完全是大自然的產物。
對此，檢測小組非常驚訝。這種高純度的水晶石可是世界上硬度最高的材料之一了。按照寶石專家所使用的摩恩硬度標準，它隻比鑽石稍微軟一點兒，再加上它脆而易碎，無疑會給雕刻工作帶來難以想象的困難。盡管如此，頭骨的雕刻工藝卻精美異常。根據檢測小組估算，即使用當今帶有鑽石頭的電動工具，也要刻上至少一年的時間。但是檢測小組斷定，要雕刻這個嬌貴的物品，根本不能使用任何帶鑽石頭的電動工具，因為它經不起用該工具所產生的振動、熱量和摩擦，它會因此而破碎的。以至於一個小組成員不得不說：“真難以想象還真有這樣一個頭骨。”
檢測小組最初認為，頭骨有可能不是用現代工具製成的。後來的檢測進一步證實了最初猜想的真實性。單純從頭骨極其平滑的表麵來看，就看不出任何使用現代工具所遺留下來的任何痕跡，因為如果有就非常難以去掉。這些發現，足以肯定檢測小組最初的判斷是對的——這個水晶頭骨為手工製品。
可以想象，手工創製這樣一個水晶頭骨要花費多長時間！科學家們隻能推算，這個頭骨也許是用河裏的沙子和水慢慢地一點點地從一大塊石英石上磨下來的。也許還用銅線或用手拉的雕刻用的“弓”具。檢測小組推斷，這個水晶頭骨一定耗費了好幾代人的畢生精力！至於他們到底花費了多少時間是難以確定的。據海爾萊德—派克爾德員工雜誌《測量》最精確的估算，有可能是３００年！
正像傑克和查爾斯講的那樣，無論是誰做這個頭骨，都要從三倍於成品大小的一大塊多棱石英水晶開始。開始時，他們無法知道水晶裏麵的純度，也不知道有沒有氣泡或小洞，因此，他們事先要精心地挑出顆粒大小相當的沙子，先用大沙粒磨出雛形，再逐漸地用小沙粒磨出精細的表麵，最後用像粉狀物小得幾乎分辨不出的沙粒打光。而且，一旦中間有所疏漏，則要從頭開始。甚至哪怕混進去了一顆大了點的沙粒，即便整個工作到了最後階段也要重新開始。整個工作從頭到尾，的確是十分艱難的。
科學家們卻怎麼也不能測得它的製作年代。傑克和查爾斯說，這是因為石英水晶根本不留年代記號，它從不會被侵蝕、腐化、風化或隨著時間的變化發生變化，就是這個特點使它成為電子工業中不可缺少的原材料。
但即使是其他與水晶頭骨一樣沒有可見年齡記號的工藝品，科學家們也可以通過測定碳原子組成部分的射線和衰化程度，來鑒定其原材料的年代和工藝。然而，水晶頭骨卻不行。